В апреле 1942 г. по предложению одного из командиров подводных лодок увеличили автономность подводных лодок «М» XII серии с 8 до 15 суток за счёт незначительных переделок, в ходе которых цистерны № 4 стали использоваться как топливно-балластные. Первой лодкой, вышедшей в поход на 12 суток, была М-113 (И. Станкевич). Затем М-117 (А. Кесаев) и М-118 (С. Савин) пробыли в море по 17 суток. Это позволило полноценно использовать лодки с апреля 1942 г. на коммуникациях противника из Севастополя, а затем из портов Кавказа и, несмотря на потери, продолжать наносить удары по противнику почти тем же количеством подлодок, что и в начале войны.

5 апреля. В 03.24 транспорт «Сванетия» в охранении эскадренного миноносца «Бойкий» и двух сторожевых катеров прибыл из Новороссийска в Севастополь. В 20.27 «Сванетия», приняв на борт 120 раненых и 65 т разных грузов, в охранении эскадренных миноносцев «Бойкий» и «Незаможник» вышла из Севастополя в Туапсе.

10 апреля. В 03.11 транспорт «Абхазия» в охранении лидера «Харьков», эскадренного миноносца «Свободный», базового тральщика «Гарпун» и двух морских охотников прибыли из Новороссийска в Севастополь.

В 20.00 эскадренный миноносец «Свободный», стоя на якоре в Севастопольской бухте, открыл огонь по скоплениям вражеских войск в селениях Биюк-Отаркой и Мамашай. Правда, стрелял недолго и, скорее, «на испуг». Всего корабль произвел 20 выстрелов по площадям. В 20.17 «Абхазия», приняв на борт 172 раненых и 116 т разных грузов, в охранении лидера «Харьков» и эскадренного миноносца «Свободный» вышла из Севастополя в Поти.

11 апреля. В 04.17 танкер «Москва» в охранении эскадренного миноносца «Дзержинский», базовых тральщиков «Взрыв» и № 27 и двух сторожевых катеров прибыл из Туапсе в Севастополь.

13 апреля. В 04.00 транспорт «А. Серов» в охранении эскадренных миноносцев «Бойкий», «Незаможник», базовых тральщиков «Якорь», «Гарпун» и двух сторожевых катеров прибыл в Севастополь. У подходной точки военного фарватера № 3 транспорт встретили базовые тральщики № 25 (Т-410 «Взрыв») и № 27 (Т-413) из Севастополя.

14.04.1942 г. на авиационной мине в районе порта Камыш-Бурун подорвался транспорт «Антон Чехов».

Перевозки в Севастополь задокументированы, и информация о них более или менее доступна, но работа малых и мобилизованных судов, работа Азовской военной флотилии нигде и никем не отражены. Объем работ по конвоированию и доставке грузов в Керчь был колоссальный. Мобилизованная канонерская лодка «Дон» только за один месяц прошла на коротком плече 5 тыс. миль, перевезя 7 тыс. т груза. Примерно так же интенсивно работали и остальные корабли Азовской флотилии. К сожалению, даже в мемуарах С.Г. Горшкова, бывшего командующего флотилией, этот факт отражения не нашел. Работа «тюлькиного флота»: сейнеров, парусно-моторных шхун, непрерывно перевозивших грузы через Керченский пролив, вообще ни в одной работе не упоминается, хотя… неправильно это. От этих малых суденышек многое зависело в те дни.

С 15 апреля противник усилил давление на морские коммуникации, ведущие в Севастополь и Керчь. Если до этого авиация противника в ночное время почти не действовала, то с этой даты начинается ночное барражирование над морем.

В апреле немцы вновь бомбили Туапсе – 9, 10, 11, 13 и 19-го числа. Новороссийск бомбили 9 и 10 апреля, а с 18-го налеты стали практически ежедневными, иногда даже дважды в сутки – днем и в ночное время. В Новороссийске 21.04.1942 г. затонул транспорт «Калинин» (4156 брт), были потоплены два буксира. Кроме того, получили повреждения эсминец «Способный», транспорты «Кубань», «Потемкин», «Курск», «Эльбрус» и «Димитров» (не путать с «Георгием Димитровым», потопленным в Севастополе еще в марте).

На немецких минах в Керченском проливе 14–15 апреля погибли морские охотники СКА-042 и СКА-024.

16 апреля. В 03.00 транспорт «Сванетия» в охранении эскадренных миноносцев «Бдительный», «Свободный» и трех сторожевых катеров прибыл из Новороссийска в Севастополь. На транспорте доставлено: 151 человек маршевого пополнения, 191,5 т бензина, 618,5 т продовольствия и другие грузы. После разгрузки, приняв на борт 221 раненого, 35 человек личного состава 40-й кавалерийской дивизии и 9 человек гражданских лиц, «Сванетия» в охранении эскадренного миноносца «Бдительный» в 21.20 вышла из Севастополя в Новороссийск.

В 07.24 транспорт был обнаружен немецким самолетом-разведчиком. Корабли открыли огонь и начали ходить переменными курсами. 12 бомбардировщиков (по немецким данным, суда атаковали семь Ju-88 из III/LG1) с разных румбов атаковали транспорт, сбросив на него 48 бомб. Одна бомба, сброшенная одним из самолетов, пробила дымовую трубу, шлюпочную палубу и вылетела за борт, не взорвавшись. Транспорт остался почти невредим. Был послан запрос на авиационное прикрытие, однако командование флотом отказалось выполнять запрос, надеясь на то, что эсминец своей зенитной артиллерией сможет прикрыть транспорт.

В 15.55 с запада показались девять низколетевших торпедоносцев. «Бдительный» пошел им навстречу, а «Сванетия» продолжала идти курсом на восток. Торпедоносцы разделились на три группы: одна из них заняла позицию для атаки с носовых курсовых углов правого борта теплохода, вторая – с левого борта, а третья маневрировала в готовности впереди по курсу.

В 16.10 в атаку на «Сванетию» вышли девять торпедоносцев «Хе-111» и сбросили восемь торпед, из которых две попали в носовую часть судна, с правого и с левого борта. Командира транспорта и других находившихся на мостике моряков взрывной волной сбросило на шлюпочную палубу. Старпом Г. Кухаренко с помощью рулевого А. Курепкова перенес их на спасательный плот и оттолкнул его от борта. Сам он бросился в штурманскую рубку, схватил со стола боевую карту, выбрался на еще возвышавшийся правый борт и спрыгнул в воду.

После взрыва торпед среди пассажиров началась паника. Медицинский персонал самоотверженно выносил из уцелевших помещений раненых и спускал их в воду по левому борту, где вода доходила до палубы. Комендоры кормового зенитного орудия и пулеметчики продолжали вести огонь. «Сванетия» начала крениться на левый борт, и когда крен достиг 40, машинной команде было приказано покинуть помещение. В это время вдруг раздался гудок: это один из мотористов, выбравшись через трубу, держался за тросик сирены. Обернувшись, Кухаренко увидел, как с высокоподнятой кормы в воду сыпались люди.

Командир отряда прыгнул в воду при погружении судна, но не успел отплыть и двух метров, как «Сванетия» опрокинулась на левый борт, накрыв корпусом три шлюпки и часть плавающих людей.

В 16.30 транспорт скрылся под водой, продержавшись на плаву после попаданий всего 18 минут. После гибели судна торпедоносцы сделали по три захода над плавающими людьми, расстреливая их из пушек и пулеметов. В это время «Бдительный» скрылся из видимости, маневрируя и отбиваясь от атак торпедоносцев. Только через полтора часа после ухода самолетов «Бдительный» вернулся к месту трагедии и подобрал 157 оставшихся в живых людей, 17 из которых вскоре скончались. Всего же из числа находившихся на транспорте погибли 753 человека.

Следующей потерей флота стал «Ледокол № 7», 20.04.1942 г. подорвавшийся на авиационной мине в Керченском проливе. Директивой Ставки № 170302 создано Северо-Кавказское направление. В него включены войска Крымского фронта, Севастопольского оборонительного района, Северо-Кавказский военный округ, Черноморский флот и Азовская флотилия.