Как правило, паломничество в Землю Воплощения продолжалось в ту эпоху не менее трех лет. Однако все связанные с ним лишения и трудности с лихвой окупались (как свидетельствует, например, средневековый монах доминиканского ордена Феликс Фабер из Ульма) тем почетом, которым пользовались рыцари Св. Гроба в христианском мире благодаря всеобщему и повсеместному признанию их доброй воли к благородным духовным устремлениям. Постепенно в разных странах Европы стали появляться местные орденские ассоциации рыцарей Гроба Господня.

После смерти францисканца Иоанна в 1498 г. встал вопрос о замене его достойным преемником. Но папа римский решил использовать право на посвящение в рыцари Гроба Господня в качестве источника дополнительных доходов для поддержания палестинских святынь в надлежащем состоянии.

В 1485 г. папа, ввиду того что должность «латинского» патриарха Иерусалимского была в тот момент вакантной, специальным эдиктом принял титул и взял на себя функции Великого Магистра ордена Св. Гроба Господня, закрепив их навечно за всеми своими преемниками на Святейшем престоле. Право посвящения достойных того пилигримов в рыцари Гроба Господня от имени папы было передано римским понтификом уполномоченному Апостольского (папского) Престола в Святой земле, которому папа присвоил титул Хранителя горы Сион.

По некоторым данным, полномочия хранителей Гроба Господня были впервые сформулированы папой римским Александром VI Борджа в 1496–1498 гг, по другим – папой Львом Х в 1516 г. Полномочия монахов францисканского ордена в качестве хранителей Гроба Господня были подтверждены папской буллой «Divina disponenta clementia» от 23 июля 1561 г. и уточнены папой Бенедиктом XIV в булле «In supremo militantis Ecclesiae» от 7 февраля 1746 г.

Еще в XIV в. в нидерландских провинциях Фландрии, Брабанте (Нижней Лотарингии, откуда был родом Готфрид Бульонский) и Голландии образовались местные объединения рыцарей Св. Гроба в форме братств.

Задача этих братств заключалась в оказании помощи рыцарям Гроба Господня в деле выполнения теми принесенных ими в Иерусалиме религиозных обетов и в сборе средств на поддержание Иерусалимского Храма Гроба Господня. Однако вплоть до XVI в. рыцарям-иоаннитам (своего рода «конкурентам» рыцарей Гроба Господня – ведь иоанниты сами, как известно, претендовали на то, чтобы быть его хранителями!) удавалось не допустить консолидации рыцарей Св. Гроба в единый, полноценный орден с четкой организационной структурой.

Тем более что папа римский Иннокентий VIII в 1489 г. своей буллой «Cum solerti meditatione pensamus» объединил орден каноников (рыцарей) Гроба Господня с орденом рыцарей-госпитальеров Св. Иоанна Иерусалимского, что по идее ставило крест на дальнейшем самостоятельном существовании ордена рыцарей Гроба Господня!

Однако строптивый Мечовский монастырь Гроба Господня в Польше, вопреки папской булле, наотрез отказался объединиться с орденом Св. Иоанна Иерусалимского. А новый папа римский Лев X своим апостольским посланием от 13 марта 1510 г. по просьбе расположенных в Испании монастырей каноников Гроба Господня также восстановил их независимость от ордена госпитальеров Св. Иоанна Иерусалимского, подтвердив свое решение в 1513 г.

В Нидерландах самое престижное, Антверпенское, объединение рыцарей Гроба Господня – так называемое Иерусалимское братство, в состав которого наряду с брабантскими аристократами входило немало испанских грандов, приняло твердое решение объединиться в орден по образцу древнего рыцарского ордена Св. Гроба эпохи Крестовых походов. Восстановленный орден Гроба Господня должен был иметь двойное подчинение: папе римскому – как высшему духовному авторитету и королю Испании – как светскому главе.

26 марта 1558 г. испанский король Филипп II Габсбург был торжественно избран Великим Магистром ордена Св. Гроба – в пику папе римскому, самому претендовавшему на этот титул! Церемония избрания короля гроссмейстером «сепулькриеров» состоялась в церкви Св. Екатерины Александрийской в Хук Страатене. Однако орден под руководством короля Испанского так и не стал международной рыцарской организацией. Этому противились и обозленная римская курия, и французский король, и рыцари-иоанниты (в силу вышеизложенных причин).

Во Франции король Генрих III Валуа в ноябре 1574 г. дал свое согласие на объединение тамошних каноников Св. Гроба с орденом Св. Иоанна, в соответствии с решением Ватикана. Однако многие французские рыцари Гроба Господня отказались выполнить волю папы римского и своего собственного короля! Причем сепулькриеры ссылались на то, что их орден был основан не папой, а предводителем 1-го Крестового похода Готфридом Бульонским (церемониальный меч, использовавшийся французскими сепулькриерами при посвящениях в рыцари Гроба Господня, считался ими – как когда-то иерусалимскими канониками Гроба Господня! – мечом самого Готфрида).

Факт столь вопиющего неподчинения говорил, между прочим, о крайней слабости королевской власти в тогдашней Франции, раздираемой междоусобной войной между католиками и протестантами-кальвинистами, вошедшими в историю под названием гугенотов (это название являлось искажением немецкого слова «айдгеноссен», Eidgenossen – самоназвания швейцарских конфедератов, распространивших во Франции новую веру своего религиозного учителя Жана Кальвина).

Первое французское братство рыцарей Гроба Господня было основано еще в начале XVI в. в Париже. К вступлению в него допускались не только лица дворянского происхождения, но и заплатившие достаточно крупный денежный взнос горожане (причем в орден можно было вступить и по доверенности!).

Так, гражданин Марселя Жан Буазон был посвящен в рыцари Гроба Господня по доверенности за своего друга Франсуа Серси, никогда не совершавшего паломничества в Иерусалим! В 1615 г. группа французских рыцарей Гроба Господня избрала Великим Магистром ордена Шарля де Гонзага, герцога Неверского (ставшего в 1627 г. суверенным герцогом Мантуанским).

Рыцарям папской ветви ордена Гроба Господня Ватикан пожаловал целый ряд привилегий – титул палатина, или пфальцграфа (лат.: comes palatinus), старшинство над членами всех прочих рыцарских орденов, кроме ордена Золотой Шпоры (Золотого Рыцарства) и ордена Золотого Руна; право узаконивать внебрачных детей (!), изменять данные им при крещении имена, миловать осужденных на смерть на пути к эшафоту. Кроме того, папы пожаловали рыцарям «своего» ордена Гроба Господня право присоединять орденский «иерусалимский» крест к своим родовым гербам и именоваться во всех официальных документах рыцарями Св. Гроба Господня.

В 1847 г. папа римский Пий IX даровал латинскому Патриарху Иерусалимскому право посвящать достойных кандидатов в рыцари Св. Гроба от имени папы.

После нескольких предпринимавшихся в дальнейшем (неудачных) попыток преодоления раскола и воссоздания единого ордена Св. Гроба только папе Пию IX удалось в 1868 г. создать стабильное объединение рыцарей Св. Гроба, поставив его под прямое папское управление, и даровать ему статус папского рыцарского ордена Римской Церкви. Этот орден был всецело подчинен римскому папе как верховному главе всех христиан-католиков. С этого момента все члены ордена Св. Гроба Господня стали подразделяться на три класса, или ранга: