I Национальная конференция была знаменательной еще и потому, что положила начало процессу превращения МПЛА из организации, представлявшей преимущественно интересы городских слоев населения, в подлинно общенародный антиколониальный фронт.

Об этом свидетельствует тот факт, что в решениях конференции был сделан акцент на роли крестьянства, которое характеризовалось как «наиболее эксплуатируемый» и «самый многочисленный социальный класс» Анголы. Пересматривая прежнее отношение к крестьянству, отмеченное некоторой недооценкой его роли, конференция поставила вопрос о необходимости земельной реформы, считая, что крестьяне сражались бы «с большей решительностью», если бы понимали, что борются за свою землю. В резолюции конференции подчеркивалось, что крестьянство должно быть достаточно широко представлено в руководстве движением и в его организациях, ведущих борьбу внутри страны.

Преодоление «предрассудков, мифов и трайбалистских чувств» политически недоверчивого крестьянства стало «насущнейшей задачей, вставшей перед движением».

На конференции была принята Программа действий МПЛА, в которой были сформулированы основные принципы организации.

Конференция подвергла критике организационную структуру МПЛА. Отмечалось, что в ней отсутствует механизм контроля за выполнением директив руководства, которое, в свою очередь, плохо информировано о внутренних проблемах. Критиковалась также работа секретариата, который не смог наладить систематический отбор и обучение новых квалифицированных руководящих кадров, а армия МПЛА была оставлена на произвол судьбы и стала действовать как некоординируемый «самостоятельный организм», находящийся вне политического контроля.

Была сформирована новая структура руководящих органов МПЛА. Высшим его органом стал Национальный политический совет, состоявший из 70 делегатов. Из их числа формировались исполнительные органы — Руководящий комитет (президент, вице-президент, руководители отделов: военного, внешних сношений, информации, социальных вопросов, финансов и экономики, безопасности) и Военно-политический комитет (президент, вице-президент, руководители нескольких отделов). Кроме того, из состава Национального политического совета формировалась Контрольная комиссия из 10 членов. Отделы делились на подотделы, секции и подсекции. На них возлагалась ответственность за различные участки работы.

Вскоре после конференции руководство МПЛА приняло решение передислоцировать штаб и военные базы в Браззавиль. Это мероприятие началось 15 августа 1963 г. Оно дало возможность перегруппировать силы, реорганизовать МПЛА и начать новый этап борьбы с португальскими колонизаторами. 3—10 января 1964 г. в Браззавиле состоялось совещание, получившее название Конференция кадров МПЛА. На ней было принято решение о реорганизации Народно-освободительной армии Анголы в партизанские отряды. В тогдашних условиях партизанская война была наиболее эффективной и целесообразной формой ведения военных действий против колонизаторов, а создание регулярной армии было признано преждевременным.

Несмотря на переброску значительных подкреплений из метрополии, объявление мобилизации в самой Анголе, широкие карательные операции, зверские репрессии, применявшиеся колонизаторами, вооруженная борьба патриотов распространилась на обширные территории. Первый военно-политический район МПЛА открыло в марте 1961 г. в районе Дембуш, Намбуангонго и в провинции Уижи. Командующим силами МПЛА в первом районе был Томаш Феррейра, одним из его помощников — Ожи-я-Энда.

В боях против португальских карателей МПЛА применяло тактику, заимствованную у Фронта национального освобождения Алжира, используя главным образом методы партизанской войны. Вооруженные силы движения были разбиты на мобильные партизанские отряды численностью 30 человек, из которых для отдельных операций формировались колонны численностью до 150 человек. Партизаны нападали на отдельные португальские гарнизоны, устраивали засады, разрушали мосты, перерезали коммуникации, а впоследствии стали совершать нападения на хорошо укрепленные португальские опорные пункты, города, фермы, железнодорожные станции, захватывая их и оставляя там свои гарнизоны. Бойцы МПЛА получали значительную помощь от местного населения, которому разъясняли смысл происходившей борьбы.

В середине 60-х гг. ангольские патриоты, руководимые МПЛА, активизировали вооруженную борьбу и распространили ее на анклав Кабинда, ставший подлинной кузницей политических и военных кадров МПЛА. Вспоминая об этом времени, А. Нето писал: «Фронт в Кабинде был действительно полезен для нашего движения. Там были подготовлены многие кадры, создан первый революционный центр, и там мы приобрели ценный опыт для ведения партизанской войны. Большинство наших командиров было подготовлено на той территории. Кабинда являлась школой, в которой были отработаны важные элементы для развития борьбы в других районах».

Как отмечалось в одной из брошюр, изданных МПЛА, война в Кабинде «имела огромное психологическое воздействие на все население Анголы. Она восстановила доверие старых активистов, которые в городах и сельской местности Анголы сохраняли веру в движение. Партизанский район в Кабинде был не только лабораторией, где МПЛА реализовало на практике свою концепцию партизанской войны и подготовило высококвалифицированные кадры, но он был также и первым в истории Анголы ядром национальной и народной вооруженной борьбы».

Развертывание национально-освободительного движения в Кабинде напугало американскую монополию «Галфойл», бельгийскую компанию «Петрофина» и другие компании, получившие право на добычу кабиндской нефти. Они стали в спешном порядке разрабатывать планы отделения Кабинды от Анголы. В этих целях было решено использовать местную сепаратистскую организацию Фронт освобождения анклава Кабинда (ФЛЕК), которая была создана в августе 1963 г. в Пуэнт-Нуаре (Конго) в результате объединения трех мелких сепаратистских организаций. Лидером ФЛЕКа являлся Луиш Ранк Франк — ставленник многонациональных корпораций. По словам Дж. Маркума, «независимость Кабинды оставалась незатухающей страстью кабиндских националистов».

ФЛЕК даже создал правительство Кабинды в изгнании. 10 января 1967 г. это «правительство» направило письмо в ООН, в котором сообщило, что «народы фиот в Кабинде», желая «полной, немедленной и безусловной независимости», создали «временное правительство революционеров-фиот в изгнании». Это «правительство» нашло себе приют в Заире, а штаб-квартира ФЛЕК находилась в Пуэнт-Нуаре (Конго).

МПЛА с полным основанием квалифицировало ФЛЕК как «новую трайбалистскую игрушку колониализма, рассчитанную на подрыв военных действий МПЛА и готовящую путь к “балканизации Анголы”».

Финансировавшие Франка транснациональные корпорации требовали от него прежде всего активных военных действий против МПЛА, с тем чтобы не допустить вхождения Кабинды в состав будущей независимой Анголы. Начиная с 1965 г., когда МПЛА перешло к активным операциям по всей территории анклава, не прекращались вооруженные стычки между патриотами МПЛА и сепаратистами ФЛЕК. Как писала газета «Гардиан», «ФЛЕК никогда не сражался против португальцев в Кабинде, но именно его члены участвовали в бесчисленных кровавых стычках с бойцами соперничающей группировки — МПЛА».