города Канева на Днепре. Здесь должно было быть их главное сборное место, а в ближайшем древнем монастыре был устроен приют для стариков и изувеченных на войне. Таким реестровым казакам была отдана земля и полагалось жалованье от правительства. Таким образом вольные запорожские казаки были отделены, но они все-таки составляли главную казацкую массу и не переставали быть предметом беспокойства правительства. Стефан Баторий старался неоднократно усмирять низовых казаков и рассылал приказы и киевскому воеводе и пограничным старостам, чтобы они всеми мерами препятствовали своеволию их. Но количество вольных казаков увеличивалось недовольными крестьянами, и они добывали средства к существованию или разбойничьими набегами на турецкие города, или участием в войнах иноземных государей. Все-таки этому энергичному королю удавалось хотя отчасти удерживать казаков от крупных военных походов. После его смерти они сделали подряд несколько набегов на татар и турок и разорили главные невольничьи рынки на Черном море, через которые прошло много русских людей. В отместку за это татары стали опустошать Червонную Русь, а турки грозили Польше немедленной войной. Наконец, в 1590 году сейм постановил окончательно уничтожить самоуправление казаков. Их подчинили коронному гетману и другим начальникам, назначавшимся правительством из польской шляхты. Без согласия и ведома этих начальников никто не мог уходить в казачество. Кроме того, стали строго карать крестьян за побеги. Эти стеснения и вызвали первый бунт под предводительством Косинского. Восстание охватило разом три южно-русские воеводства — Киевское, Брацлавское и Волынское. Отряд, посланный старостами Киевского воеводства, был разбит казаками, разорявшими панские и шляхетские поместья. Они с особенным озлоблением уничтожали попадавшиеся им шляхетские грамоты, как бы желая уничтожить права и привилегии, создающие неравенство между людьми, которого они не хотели признавать. В 1592 году Косинский овладел Киевом, а потом Белой Церковью. Все украинское население встречало его с сочувствием, в городах отворяли ворота, в церквах звонили в колокола. Взяв еще несколько городов, Косинский стал думать об отторжении Руси от Польши. Он не только убивал панов, грабил поместья, брал города и земли, но и заставлял шляхтичей и мещан присягать себе. Первое поражение потерпел Косинский от сына Константина Острожского, Януша. После этого казаки предложили мир и обязались прекратить бунт и сменить Косинского. Оставленный на свободе, Косинский не угомонился, а принялся набирать новый отряд казаков, но был убит в Черкассах, в доме, где остановился.

Восстание Косинского повлекло за собой еще большие стеснения для казаков и еще более суровые наказания для беглецов-хлопов. Ответом на это были новые восстания. Предводителями следующего восстания являются новый гетман казаков Лобода в одном месте и казак Наливайка в другом. Оба сначала делали набеги на турок, а потом пришли в Украину. Как раз в это время владыки собирались ехать в Рим для решения дела с унией. По Руси ходили слухи о подчинении русской церкви папе, возмущение начинало принимать религиозный характер. Население верило, что казаки не только отстаивают свои права, но и становятся на защиту православной веры. Снова началось уничтожение шляхетских имений, сопровождаемое жестокой резней, и снова всюду замечалось сочувствие простого населения. Для усмирения восстания выступило правительственное войско, под начальством польского гетмана Жолкевского. Сначала казацкие отряды встретились с гетманским войском на Днепре, в окрестностях Киева, потом казаки ушли в Переяславль, и Жолкевский погнался за ними. Недалеко от Лубен казаки были заперты и после двух недель осады были взяты и изрублены все, с женами и детьми, за исключением небольшого количества, успевшего прорваться и спастись бегством. Лобода был убит еще раньше самими казаками, по наущению Наливайки, а Наливайка был увезен Жолкевским в Варшаву и там казнен, после жестоких пыток. В народе ходили разные сказания о его смерти и о муках, перенесенных им. Рассказывали, что его посадили на раскаленного железного коня и на голову ему надели раскаленный железный обруч. Затем говорили, что его заключили в медного быка, которого поджигали медленным огнем, пока тело Наливайки не обратилось в пепел.

По новому постановлению сейма у казаков был отнят Трахтемиров и они были лишены и тех незначительных прав, которые оставил им Стефан Баторий. Государство признавало их только пограничной стражей. Одновременно с этим в самом казачестве начались раздоры. Часть их соглашалась идти на примирение с правительством, а другая часть подбивала к новым бунтам и восстаниям. Раздоры прекратились в гетманство Самойлы Кишки. В это время правительству понадобилась помощь казаков для военного похода в Молдавию. Кишка согласился идти с казаками только под условием возвращения им всех прежних прав вольности и обеспечения их от притеснений со стороны старост и других правительственных лиц. После непродолжительной войны в Молдавии началась война Польши со шведами, и снова король обратился за помощью к казакам, хотя обещания, данные им, не были еще выполнены. Кишка повторил свои требования перед выступлением в поход. На этот раз сейм издал закон, которым отменялось уничтожение казачества, снималось с него осуждение в измене и возвращались ему старые права, хотя и не в полной мере. В тяжелой войне со шведами казаки потеряли много людей и, наконец, своего предводителя и заступника Кишку. По окончании войны казаки потребовали полного восстановления своих прежних прав и снова стали господами Поднепровья. Шляхта начала опять жаловаться на своеволие казаков, но на жалобы ее правительство не обращало внимания, так как нуждалось еще в казаках.

Это были первые годы семнадцатого столетия, когда началась смута в Московском государстве и поляки взяли под свое покровительство Лжедмитрия. Московская смута продолжалась почти десять лет, и казаки принимали в ней большое участие. Было время, когда польский король думал завладеть московским престолом. Казаков призывали постоянно на королевскую службу. А так как служившие королю казаки считали себя людьми вполне свободными, то находилось много охотников пополнять их ряды. Не довольствуясь московскими походами, казаки снова принялись за свои обычные набеги на южные турецкие города. В это время крепнет опять казацкая воля и напряженнее делается борьба с шляхетским гнетом. Правительству, занятому московскими делами, не до казаков и вообще не до Украины, которая рвется на свободу. Мещане и крестьяне выходят из повиновения помещикам и старостам, и чуть не все поднепровское население превращается в вольных казаков. Уже в 1596 году казаков числилось 20 тысяч, а с начала семнадцатого столетия количество их все увеличивалось.

Казаки не любили жить в пожалованном им Трахтемирове, потому что он был на глазах у правительства. Центром казачьих поселений по-прежнему была Запорожская Сечь на Низу. Мелкие острова на днепровских порогах укреплялись валами и засеками, за которыми скрывались пушки и разные военные принадлежности.