Один-единственный раз пираты отказались от выкупа: захваченное ими в мае 2009 года пакистанское судно, следовавшее из Объединенных Арабских Эмиратов, везло товары в Сомали.

Поняв, что «спасение утопающих — дело рук самих утопающих», экипажи торговых судов сами начали давать отпор бандитам. Китайские моряки отбились от сомалийских пиратов самодельными бутылками с зажигательной смесью, филиппинские закидали их пустыми металлическими бочками из-под машинного масла и деревянными подцонами. Были случаи, когда моряки сбивали пиратов с ног струей воды из брандспойта и даже топили таким образом пиратские катера. Только между 27 и 29 января 2009 года в Аденском заливе нападению подверглись четыре торговых судна; танкер-газовоз «Лоншан», следовавший из Европы на Дальний Восток, пиратам удалось захватить, остальные нападения были отбиты экипажами, которые использовали пожарные шланги, прожекторы и ревуны. По свидетельству капитанов, если пираты видели, что команда готова дать им отпор, они ретировались.

В апреле 2008 года бельгийское правительство вслед за французским решило отправлять на торговых судах по восемь вооруженных военнослужащих, но за безопасный недельный переход каждого корабля бельгийский судовладелец должен заплатить 115 тысяч евро. При этом судно должно быть застраховано, а его хозяин обязуется не предъявлять претензий к государству, если пираты всё же захватят корабль, несмотря на охрану. Летом 2009 года владельцы тунцеловов, ведущих промысел вблизи Сейшельских островов, обратились к французским ВМС с просьбой защитить их от сомалийских пиратов. Отныне в период лова — с конца июля до конца октября — на борту рыболовецких судов будут находиться солдаты морской пехоты.

Второго апреля 2009 года международная антипиратская коалиция уничтожила одну из плавучих баз разбойников у порта Харардере, в 400 километрах к северу от Могадишо; четверо пиратов были убиты. Но два дня спустя пиратам удалось захватить свой первый контейнеровоз — германский «Ханса Ставангер» с экипажем из двадцати четырех человек, включая троих россиян. Во время нападения судно обстреляли из гранатометов; каюта старшего механика была изрешечена картечью, выгорели два этажа надстройки. Пожар был настолько сильным, что воду, использованную при тушении, потом пришлось откачивать с палубы насосами. Однако пострадали лишь два члена экипажа, филиппинцы, причем легко. Старший механик четыре часа тянул время, не запуская двигатель, в надежде на подход военного корабля. Немецкий фрегат был уже рядом, когда пираты повели-таки судно на базу. Но благоприятный момент для штурма был упущен: пока судно угоняли, на его борту находились всего пять пиратов, а экипаж пользовался относительной свободой перемещения; позже на борт поднялись 20 пиратов, выставили охрану на верхней палубе, а экипаж согнали на мостик Сначала с командой обращались довольно гуманно, но затем бандиты изменили свое поведение. Над пленными моряками устраивали имитацию расправ, их морили голодом; через три месяца пребывания в неволе все они были серьезно больны и находились на грани нервного срыва.

Такое поведение, в общем, типично для разбойников. Когда два бельгийца из организации «Врачи без границ», захваченные в заложники, объявили голодовку, пираты сначала попытались накормить их насильно, а потом, разъярившись, избили до полусмерти. Над украинским экипажем балкера (судна для перевозки насыпных грузов) «Ариана», захваченного 2 мая, пираты откровенно издевались — избивали и угрожали казнить.

В июле 2009 года пленницей пиратов впервые стала женщина -24-летняя турчанка Аюсун Акбай, вышедшая в свой первый рейс в качестве штурмана на большом океанском судне — балкере «Хоризон-1», перевозившем серу из Саудовской Аравии в Иорданию.

Восьмого апреля 2009 года пираты захватили контейнеровоз «Мэрск Алабама» с грузом гуманитарной помощи, однако команде вскоре вновь удалось взять судно под свой контроль. Капитан Ричард Филлипс предложил пиратам взять его в заложники в обмен на освобождение судна и девятнадцати членов экипажа. Забрав капитана с собой, пираты покинули судно на спасательной шлюпке (свой катер они затопили, забравшись на борт контейнеровоза). Однако у них кончилось топливо, и они несколько дней дрейфовали в Индийском океане; контейнеровоз же прибыл в Кению. В ночь с 9 на 10 апреля Филлипс попытался бежать: спрыгнув за борт шлюпки, он поплыл к американскому ракетному эсминцу «Бейнбридж», стоявшему неподалеку, однако его быстро догнали и выловили. Американские военные вступили в переговоры с пиратами, однако те не пожелали освобождать капитана, заявив, что если на них нападут, они будут сражаться: «Мы уверены в себе и не боимся американцев». И все же Филлипс не сдался: он вновь выпрыгнул из шлюпки, где его пытались удержать четверо пиратов, и доплыл-таки до спецназовцев, прикрывавших его бегство огнем. Три пирата были убиты. Президент США Барак Обама представил 55-летнего капитана к награде, назвав его примером для всей нации.

Бывало, что военные оказывали пострадавшим от пиратов «медвежью услугу»: при штурме французской яхты «Танит», захваченной разбойниками, погиб капитан — возможно, от пули французских спецназовцев.

В начале мая пираты захватили немецкий сухогруз «Виктория», перевозивший десять тонн риса из Индии в Саудовскую Аравию, прямо под носом у боевых кораблей: судно шло в сопровождении эскорта по охраняемому коридору, нападение и захват произошли в считаные минуты, военные подняли в воздух вертолет, но было уже поздно. Дело в том, что военные моряки имеют право уничтожить или отогнать пиратов только до того момента, как они поднимутся на борт торгового судна. После этого речь идет уже не о предотвращении захвата, а об освобождении корабля.

А вот канадский патрульный фрегат «Виннипег» вовремя подоспел на помощь норвежскому судну «Фронт Арден», которое намеревались захватить пираты, вооруженные гранатами. Те попытались скрыться, однако после многочасовой погони их всех арестовали.

В начале апреля 2009 года суд сомалийской области Пунтленд приговорил 15 пиратов к трем годам лишения свободы; девять из них были захвачены в октябре в Аденском заливе французскими военными моряками. В качестве доказательств фигурировали видеопленка и оружие, отобранное у подсудимых. Два человека были оправданы за недоказанностью вины. Эти меры сомалийские власти назвали «решительными».

Неудивительно, что после этого европейцы решили взять дело в свои руки: в 2009 году в Нидерландах начался первый в Европе суд над пиратом, похожие процессы готовятся в Германии и Франции. Впервые за последние 100 лет пирата будут судить в США, обвинение намерено требовать пожизненного заключения.

Между тем пираты расширили радиус своего действия, совершая нападения на расстоянии до двух тысяч километров от побережья Сомали, в том числе в водах Мадагаскара и Сейшельских островов. Судно «Ариана» было захвачено примерно в 1600 километрах от берегов Сомали, причем ночью (раньше пираты нападали только в светлое время суток). Евросоюз тоже решил включить Сейшельские острова в зону операции «Аталанта» по борьбе с пиратством, увеличив ее финансирование. Но что толку? Сами военные признают, что не могут стопроцентно гарантировать безопасность торговых судов, даже находящихся в составе караванов.