На станцию Лиски доставили 100 речных мин типа «С».

13 апреля, с открытием навигации, флотилия в составе штабного парохода «Заря», буксира «Воронеж» с нефтяной баржой и сторожевого катера № 1 была переведена в Павловск, где для окончания ремонта имелись более приспособленные мастерские Рупвода. 26 мая из-за невозможности установить прибывшие из Петрограда 75/50-мм пушки (по причине отсутствия болтов), командование 9 и армии, которой к этому времени была оперативно подчинена флотилия, приказало временно вооружить флотилию 76-мм полевыми орудиями, что и было сделано. Однако через несколько дней уда лось изготовить временные болты к 75/50-мм пушкам, и в начале июня эти пушки были установлены на суда флотилии.

13 апреля, с открытием навигации, линия Южного фронта проходила через Георгиевскую (18 верст южнее Луганска), Каменское, Перовку. В районе станицы Качалинской красные перешли Северный Донец, далее линия фронта шла через хутора Золоторецкий, Хурный и Дальний. Таким образом, нижнее течение Дона было свободно до впадения Северного Донца. В среднем же течении Дона продолжалось восстание кулаков во всем районе от Богучара до устья Хопра.

28 мая Донская флотилия в составе буксирного парохода «Воронеж» (вооруженного одним пулеметом), баржи (две 76-мм полевые пушки обр. 1900 г. и 4 пулемета) и парового катера (два пулемета) снялась с якоря и под проводкой лоцманов пошла вниз по течению. На борту судов имелось 450 снарядов. Вел флотилию командующий Б. Ф. Корсак.

Перед флотилией стояла задача оказать содействие правофланговым частям левобережной группы красных по захвату станицы Казанской и восставших хуторов левого Дона.

Во время движения судов флотилии вниз по реке никакой связи с левым берегом не было, поэтому флотилия, опасаясь остаться в тылу левобережной группы, шла в полной боевой готовности для обстрела станицы Казанской.

В 15 ч. 30 мин., проходя мимо сел Монастырица и Пасека, Корсак получил предупреждение от командира 105-го полка о том, что дальше флотилии идти небезопасно, так как оба берега Дона за Белой Горкой находятся в руках казаков, которые имеют здесь же и батарею.

Не доходя до селения Белая Горка, Корсак послал вперед на разведку паровой катер. Катер был остановлен командиром находившейся там роты 106-го полка, от которого комфлот получил приказание начальника Экспедиционных войск задержаться у Белой Горы. В 19 часов, стоя у берега, флотилия была обстреляна батареей противника, находившейся на правом берегу в районе хутора Демидове. Выпустив в ответ два снаряда, Корсак поменял место стоянки. В это время красная батарея, находившаяся в Сухом Донце, открыла огонь, чем заставила замолчать неприятельскую батарею.

29 мая Корсак получил просьбу командира 106-го полка о содействии левому флангу по занятию им хутора Демидове и очистки от мятежников Ореховой Балки, а также указание уничтожить пулеметы, выставленные восставшими на правом берегу и обстреливающие красные части с фланга.

По приказу комфлота «флотилия пошла вниз и открыла огонь по засевшим в ущельях правого берега казакам и по левому берегу для очистки его от пулеметов. Заставив, после первых выстрелов, неприятеля убрать пулеметы с левого берега, флотилия перенесла огонь по наступающим на хутор Демидове казакам. Не видя последних, приходилось все время держать связь с высланными красноармейцами, которые указывали места скопления наступающих казаков. Оказав просимое содействие левому флангу, который занял хутор Демидове, флотилия открыла огонь химическими снарядами по хуторам Матюшинскому и Рубежному, с целью нащупать неприятельскую батарею, о которой имелись сведения еще накануне.

Дойдя до Демидова, ввиду наступления темноты, флотилия ошвартовалась к берегу, где предполагалось остаться на ночь. Через некоторое время неприятельская батарея открыла по флотилии огонь шрапнелью. Узкость реки в этом районе не позволяла маневрировать на месте, пришлось отступить вверх по течению, ввиду того, что флотилия оказалась в районе падения неприятельских снарядов. Все время идя вверх, флотилия продолжала вести огонь. Ночью флотилия пришла в Белую Горку, где стала на якорь. За истекшие сутки было выпущено 118 снарядов. В носовом орудии случилась вторичная поломка подъемной муфты, ввиду чего стрелять из этого орудия было небезопасно»{186}.

Не имея никаких сведений о положении на левом берегу, Корсак около 16 часов 30 мая послал паровой катер в Дедово. Вернувшись к вечеру, командир катера доложил, что, по собранным сведениям, как курсанты, так и отряд моряков ушли из Дедова в направлении Березняков. В 19 ч. 31 мин. Корсак получил по телефону просьбу командира 106-го полка очистить хутор Рубежный, где казаки поставили пулеметы и обстреливали оттуда красные части, находящиеся в районе Демидова. Флотилия снялась с якоря, спустилась вниз и обстреляла район хутора Рубежный, выпустив 32 снаряда. Казаки пулеметы убрали, и флотилия ушла обратно.

С рассветом 31 мая Корсак послал паровой катер к месту наводки моста, куда утром прибыл и сам с пароходом и баржой, оказав содействие командиру 106-го полка при выполнении заданной ему операции. Получив вечером распоряжение начальника Экспедиционных войск о передаче сухопутных орудий в 106-й полк, комфлот той же ночью передал их по назначению, а также семь пулеметов, 275 снарядов, 30 тыс. патронов и 68 пулеметных лент. Утром 2 июня, согласно приказанию начальника Экспедиционных войск, флотилия вышла в Богучар, оставив на фронте паровой катер. Описанным эпизодом и закончилась боевая деятельность флотилии.

В связи с наступлением Деникина 29 июня началось расформирование красной Донской флотилии. Канонерки ГВИУ № 3 и № 6 были отправлены по железной дороге в Саратов. 29 июня 1919 г. обе канонерки вновь вошли в состав Волжской флотилии.

К маю 1919 г. белая Донская флотилия («Морские и речные силы Дона») была фактически независимым соединением, но формально входила в состав Черноморского флота. Флотилия состояла из речного отряда и морского отряда. В речной состав сходили 1-й, 2-й и 4-й дивизионы, а в морской — 3-й и 5-й дивизионы.

В 1-й речной дивизион входили суда: № 1 (болиндер, одна 152/ 45-мм пушка Кане), № 2 (речной буксир «Донец», две 76-мм полевые пушки), № 3 (болиндер, одна 152/45-мм пушка Кане), № 4 (речной буксир «Кубанец», не вооружен).

Во 2-й речной дивизион входили суда: № 5 (болиндер, одна 152/45-мм пушка Кане), № 6 (речной буксир «Богатырь», две 76-мм полевые пушки), № 7 (болиндер, одна 152/45-мм пушка Кане), № 8 («Ростов», две 76-мм полевые пушки) и один буксирный пароход.

В 3-й морской дивизион входили суда: № 9 (ледокол «Каледин», одно 75/50-мм орудие), № 10 (морская шхуна «Ваня», одна 152/45-мм пушка Кане), № 11 (предполагалось вооружить шхуну «Гельвеция»), № 12 (морская шхуна «Амалия», одно 120/45-мм орудие).

В 4-й речной дивизион входили суда: № 14(речной буксир «Амур»), № 15 (самоходная баржа «Парамонов», две 152/45-мм пушки Кане), № 16 (болиндер, не вооружен), № 17 (болиндер, одна 152/45-мм пушка Кане) и один буксирный пароход.

В 5-й морской дивизион входили суда: № 18 («Колхида», три 75-мм орудия), № 19 (ледокол «Донские Гирла», одно 102/60-мм и одно 120/45-мм орудие).