Академии готовили протестантских проповедников — это было их главное предназначение, но некоторые предоставляли также возможность изучать другие дисциплины, в том числе математику и музыку. Например, в 1583 году Генрих Наваррский присвоил академии, основанной его матерью Жанной д’Альбре в Ортезе в 1566 году, статус Королевского университета Беарна с правом выдавать дипломы докторов не только богословия, но и естественных наук, права и медицины. А вот в Академии Монтобана, получившей этот статус в 1598 году, кафедры математики, юриспруденции и медицины пустовали за неимением средств.

В 1599 году «гугенотский папа» Филипп Дюплесси-Морней основал в Сомюре Протестантскую академию, прославившуюся на всю Францию, да и на всю Европу, и привлекавшую многочисленных студентов, местных и иностранных.

Сын Генриха IV Людовик XIII подтвердил Нантский эдикт, но его наследник Людовик XIV отменил его в 1685 году, провозгласив лозунг: «Одно государство, одна религия». Протестантские академии закрывались одна за другой. Академия в Ортезе перестала существовать еще в 1620 году, после присоединения Беарна к Франции. В 1659 году в Монтобане начались стычки между студентами — католиками и протестантами, и по приказу Королевского совета академию перенесли в Пюилоран, а в 1685-м закрыли вообще. Дольше всех держалась Академия Оранжа; ее студенты и преподаватели разбежались только после драгонад[13] 1686 года, найдя прибежище в Нидерландах. Зато Людовик XIV после присоединения Эльзаса к Франции в 1681 году подтвердил привилегии Страсбургского университета. Тамошние профессора-лютеране присваивали ученые степени католикам и протестантам без разбора.

В то время как гугеноты искали спасения от притеснений в протестантских странах, гонимые католики устремлялись во Францию и Испанские Нидерланды. В 1569 году Уильям Аллен основал в Дуэ семинарию для подготовки английских священников, программа обучения в которой частично воспроизводила программу местного университета. 25 марта 1575 года испанский губернатор, уступая давлению со стороны английской королевы Елизаветы I, которая вообще хотела закрыть это католическое заведение, потребовал перенести его в Реймс. Во время реймсского изгнания англичане перевели Новый Завет на родной язык и опубликовали его в 1582 году. Спустя десять лет они вернулись в Дуэ и к 1609 году завершили перевод на английский всей Библии.

Там же, в Дуэ, епископ Джон Лесли, написавший историю шотландской королевы Марии Стюарт, основал в 1573 году шотландскую коллегию. Он был противником Реформации и считал, что протестантская Англия подрывает союз между Францией и Шотландией. Шотландцы, жившие во Франции, автоматически получали двойное подданство. В конце XVII века в коллегию поступали бежавшие с родины сторонники низвергнутых Стюартов. Последний британский монарх-католик Яков II Стюарт, также нашедший приют во Франции, распределил свою библиотеку и прочие исторические раритеты между шотландскими коллегиями Дуэ и Парижа.

Наконец, в 1603 году ирландец Кристофер Кьюсак основал в Дуэ коллегию Святого Патрика, опираясь на поддержку испанского короля Филиппа III. В 1610 году коллегия слилась с факультетом теологии местного университета. Со временем ирландские коллегии возникли в Тулузе, Бордо, Нанте, Лилле, Антверпене, Лувене и Париже. Они поддерживали неугасимое пламя борьбы за свободу и независимость, а потому привлекали к себе пристальное внимание английских шпионов и агентов влияния.

Помимо борьбы между католиками и протестантами, вся католическая Европа пережила конфликт между университетами и иезуитами, взявшими под свое начало почти всю систему среднего образования. В 1626 году университет Лувена даже отправил в Испанию богослова Корнелия Янсения (1585–1638), чтобы тот попытался сплотить все университеты против иезуитов. Во Франции провинциальные университеты в конце концов нашли с иезуитами общий язык, но Сорбонна затеяла три крупных судебных процесса, чтобы отстранить монашеский орден, созданный ее же выпускником Игнатием Лойолой, от преподавания наук. Первый процесс состоялся в 1565 году, когда иезуиты только-только обосновались в Латинском квартале Парижа и открыли Клермонский коллеж; второй — в 1594-м. Иезуитов изгнали из Франции, но вновь вернули в 1611 году, после третьего процесса. Когда Королевский совет разрешил иезуитам преподавать все науки в Клермонском коллеже, университет перешел в контрнаступление, запретив присваивать ученые степени обучавшимся у иезуитов; отныне студенты должны были не только предоставлять справку о посещаемости, но и клясться, что у них не было других учителей. Тогда иезуиты стали сами присваивать ученые степени, опираясь на соответствующую буллу папы римского. Перемирие было заключено лишь в 1642–1643 годах: иезуиты больше не претендовали на присуждение ученых степеней, а Парижский университет не закрывал свои двери перед выпускниками Клермонского коллежа, особенно после того, как в 1682 году ему было присвоено название Королевский коллеж Людовика Великого.

Между тем учение Янсения о предопределении и благодати, изложенное в его книге о Блаженном Августине и противостоящее доктрине иезуитов, послужило толчком к возникновению во Франции и Нидерландах нового религиозного течения — янсенизма. Людовик XIV относился к нему резко отрицательно и на этой почве сумел столковаться с иезуитами, чтобы изгнать из университета Дуэ, к тому времени ставшего французским, профессоров-янсенистов.

В 1762 году Орден Иисуса был окончательно запрещен во Франции; Парижский университет немедленно прибрал к рукам бывшие иезуитские коллежи. Но он недолго праздновал победу: с изгнанием иезуитов в обществе начали множиться проекты образовательной реформы, а закончилось всё, как мы уже знаем, закрытием всех университетов.

Вопрос о нужности университетов был решен радикально только в одной стране. Однако вопрос о недостаточности университетов для подготовки необходимых специалистов поднимался уже давно и в самых разных краях. Священники, юристы, врачи, конечно, были востребованы, но не в таких количествах. Но как же обойтись без строителей, инженеров, картографов, землемеров, военных? Кто будет строить дома, добывать руду, плавить металл и сражаться за него?

В 1416 году третий сын португальского короля Жуана I инфант дон Генрих (1394–1470), прозванный «Генрих-мореплаватель», на обрывистом утесе мыса Сагриш основал Морскую академию, где обучали математике и астрономии применительно к навигации. Преподавали там итальянцы и каталонцы, сведущие в гидрографии. Португалия, подарившая миру великих первооткрывателей и бывшая тогда одной из крупнейших морских держав наряду с Испанией, стала и центром «навигацкой науки». Ее интересы простирались на Запад, на Юг и на Восток, а с учетом того, что корабли становились всё больше, а их грузы — всё ценнее, потребность в грамотных капитанах, которые привели бы их в пункт назначения в целости и сохранности, была остра как никогда.