1885, март. Назначение командиром броненосного фрегата «Князь Пожарский» и плавание на этом корабле в Балтийском море.

1885, 17 сентября. Назначение командиром корвета «Витязь».

1885, октябрь. Опубликование в «Записках Академии наук» труда С. О. Макарова «Об обмене вод Черного и Средиземного морей».

1886, май — 1889, июнь. Кругосветное плавание на корвете «Витязь».

1887, Присуждение Академией наук неполной Макарь-евской премии за труд «Об обмене вод Черного и Средиземного морей».

1890, 1 января. Производство в контр-адмиралы с назначением в младшие флагманы флота Балтийского моря.

1890, ноябрь. Выступление на Всероссийском съезде естествоиспытателей и врачей с докладом «О разности уровней морей, омывающих берега Европы».

1890, сентябрь—октябрь. Назначение председателем комиссии по испытанию артиллерии на броненосце «Император Александр II».

1891, 5 октября. Назначение исполняющим должность главного инспектора морской артиллерии.

1891. Опубликование труда «Витязь» и Тихий океан».

1892. Предложение приспособления, увеличивающего бронебойную силу артиллерийских снарядов (так называемый «макаровский колпачок»).

1893. Награждение за труд «Витязь» и Тихий океан» Академией наук полной Макарьевской премией и золотой медалью Географического общества.

1893. Поездка за границу для осмотра заводов, изготовляющих орудия и броню.

1894, февраль. Назначение младшим флагманом Практической эскадры флота Балтийского моря.

1894, июль—октябрь. Плавание на эскадренных броненосцах «Наварин» и «Гангут» и на крейсере 1-го ранга «Рюрик».

1894, июнь. Опубликование в «Морском сборнике» статьи «Разбор элементов, составляющих боевую силу судов».

1894, ноябрь. Назначение командующим русской эскадрой в Средиземном море.

1895, январь—май. Переход с эскадрой из Средиземного моря в Тихий океан.

1895, май — 1896, январь. Соединение с Тихоокеанской эскадрой вице-адмирала П. П. Тыртова и плавание в водах I Тихого океана от Владивостока до берегов Японии.

1895, декабрь. Награждение орденом Святой Анны 1-й I степени.

1896, январь. Назначение исполняющим делами старшего флагмана 1-й флотской дивизии флота Балтийского моря.

1896, май—сентябрь. Командование Практической эскадрой флота Балтийского моря (флаг на броненосце «Петр Великий»).

1896, август. Производство в вице-адмиралы и утверждение в должности старшего флагмана на 1-й флотской дивизии.

1896, декабрь. Чтение лекций в Кронштадтском морском собрании на тему «Рассуждения по вопросам морской тактики».

1897, январь. Представление докладной записки управляющему Морским министерством П. П. Тыртову с проектом исследования Арктики при помощи ледоколов.

1897,12 марта. Выступление в Академии наук с докладом об исследовании Северного Ледовитого океана при помощи ледоколов.

1897, 30 марта. Выступление в Географическом обществе с докладом «К Северному полюсу — напролом».

1897, июнь—сентябрь. Посещение устьев рек Оби и Енисея с целью изучения ледовых условий плавания к устьям этих рек.

1897, декабрь. Подписание вице-адмиралом С. О. Макаровым договора на постройку ледокола «Ермак» с фирмой «Армстронг» в Ньюкасле, Великобритания.

1897. Опубликование в «Морском сборнике» работы «Рассуждения по вопросам морской тактики».

1898, февраль. Поездка за границу для изучения ледокольного дела и наблюдения за постройкой ледокола «Ермак». Посещение городов Ганге, Стокгольма, Берлина, Эльбинга, Данцига, Гамбурга, Ньюкасла, Нью-Йорка и озер Мичиган, Гурон и Эри.

1898, май—сентябрь. Командование Практической эскадрой флота Балтийского моря (флагманский корабль — броненосец «Петр Великий»).

1898,17 октября.Спуск на воду ледокола «Ермак» в Ньюкасле.

1898. Опубликование работы «Рассуждения по вопросам непотопляемости судов».

1899, 20 февраля. Приемка ледокола «Ермак».

1899, 4 марта. Прибытие ледокола «Ермак» в Кронштадт.

1899, 1 апреля.Избрание вице-адмирала С. О. Макарова членом-корреспондентом Главной физической обсерватории.

1899, 29 мая. Выход ледокола «Ермак» в первое полярное плавание из Ньюкасла.

1899, 25 октября. Назначение командиром 1-й флотской дивизии флота Балтийского моря.

1899, 6 декабря. Назначение главным командиром Кронштадтского порта, начальником гарнизона и военным губернатором города Кронштадта.

1901, февраль. Выход в свет труда С. О. Макарова «Ермак» во льдах».

1901, 16 мая. Второй поход ледокола «Ермак» в полярные широты из Кронштадта. Экспедиционный рейс к Новой Земле и Земле Франца-Иосифа.

1901, 13 октября. Освобождение С. О. Макарова от руководства ледоколом «Ермак».

1903, апрель, июль. Опубликование работ «Броненосцы или безбронные суда» и «Без парусов».

1904,1 февраля.Назначение командующим флотом на Тихом океане.

1904, 24 февраля. Прибытие в морскую крепость Порт-Артур.

1904, 9 марта. Организация перекидной артиллерийской стрельбы через гору Ляотешань.

1904, 13 марта.Выход порт-артурской эскадры в море под флагом вице-адмирала С. О. Макарова в составе 22 кораблей.

1904, 31 марта. Гибель вице-адмирала С. О. Макарова на броненосце «Петропавловск».