Шрифт:
Интервал:
Закладка:
Пока все понятно? Отлично. А теперь глубоко вдохните. Благодаря этим крупицам понимания мы пересечем глубокий пролив сложных молекулярных терминов и доберемся до важного научного откровения. Поехали!
Майкл Воробей обнаружил, что DRC60 и ZR59, образцы, взятые у двух жителей Киншасы в течение буквально одного года, очень отличаются друг от друга. И тот, и другой, несомненно, принадлежали к одной и той же группе M ВИЧ-1; их невозможно было перепутать ни с группой N, ни с группой O, ни с вирусом шимпанзе ВИОcpz. Но в пределах группы M они разошлись очень далеко друг от друга? Насколько далеко? Одна секция генома на 12 процентов отличалась от той же секции в другом вирусе. А сколько нужно времени, чтобы достичь такой разницы? Лет пятьдесят, предположил Воробей. Или, если вы хотите более точной цифры, по его подсчетам, ближайший общий предок DRC60 и ZR59 датируется 1908 годом, плюс-минус небольшой допуск.
Получается, преодоление межвидового барьера случилось в 1908 году? Это намного раньше, чем кто-либо предполагал; таким открытиям самое место в авторитетных изданиях вроде Nature. Статья была издана в 2008 г., через сто лет после предполагаемого события; среди соавторов значились в том числе Жан-Жак Муйембе, Жан-Мари Кабонго и Дирк Тёвен. Воробей писал:
«Наша оценка времени расхождения с эволюционной временной шкалой, длина которой составляет несколько десятилетий, а также учитывая заметное генетическое расстояние между образцами DRC60 и ZR59, показывает, что эти вирусы происходят от общего предка, который циркулировал среди жителей Африки в начале XX в.»[218]
В разговоре со мной он выразился проще:
– Этот вирус был для людей не новым.
Работа Воробья стала непосредственным опровержением гипотезы ОПВ. Если люди болели ВИЧ-1 уже в 1908 г., то, очевидно, вирус никак не мог впервые попасть в организм человека во время испытаний вакцины, проведенных в 1958 г. Окончательное прояснение этого вопроса важно и само по себе, но это лишь часть вклада, сделанного Воробьем. Определение временных рамок первого заражения стало большим шагом к пониманию того, как началась и развивалась пандемия СПИДа.
94
Определение места первого заражения не менее важно; это удалось выяснить в другой лаборатории. Беатрис Хан немного старше Майкла Воробья, и ее работа по поискам происхождения СПИДа началась задолго до того, как Воробей нашел образец DRC60.
Хан, уроженка Германии, получила медицинское образование в Мюнхене, в 1982 г. переехала в США и три года проработала в лаборатории Роберта Галло, изучая ретровирусы. Затем она перебралась в Алабамский университет в Бирмингеме, где стала профессором медицины и микробиологии и одним из директоров центра исследования СПИДа, собрав под своей эгидой талантливых постдокторантов и аспирантов. (Она работала в Алабамском университете с 1985-го по 2011 г., и практически вся описанная здесь работа была проведена именно в этот период; позже она присоединилась к Перельмановской школе медицины в Пенсильванском университете в Филадельфии.) Главная цель разнообразных проектов Хан, как и у Воробья, – разобраться в эволюционной истории ВИЧ-1 и его родственников и предков. Самое подходящее описание для подобных исследований дал Воробей, когда я попросил его назвать свою отрасль работы: молекулярная филогенетика. Молекулярные филогенетики исследуют нуклеотидные последовательности ДНК или РНК различных организмов, сравнивают и сопоставляют их с той же целью, с которой палеонтологи изучают фрагменты окаменевших костей вымерших гигантских ящеров, – чтобы узнать форму генеалогического древа и эволюционную историю. Но Беатрис Хан, будучи врачом, поставила перед собой и другую цель: узнать, как именно гены ВИЧ-1 вызывают заболевание, и разработать новые методы лечения, профилактики, а может быть, даже полного излечения болезни.
За два десятилетия работы лаборатории Хан в Алабамском университете было издано немало очень интересных статей; во многих из них основным автором значился кто-то из младших исследователей, а Хан, как научный руководитель, стояла в списке последней. Именно так случилось и в 1999 г., когда Фен Гао опубликовал филогенетическое исследование ВИОcpz и его связи с ВИЧ-1. В то время было известно лишь три штамма ВИОcpz, полученных от шимпанзе, содержавшихся в неволе; статья Гао добавила к ним четвертый. Работа была опубликована в журнале Nature; в комментарии к ней говорилось, что это «самое убедительное на нынешний момент доказательство, что ВИЧ-1 передался людям от шимпанзе, Pan troglodytes»[219]. На самом деле Гао и его коллеги не просто отследили происхождение ВИЧ-1 до шимпанзе; анализируя вирусные штаммы, они сумели свести его к особям подвида, известного как черномордый шимпанзе (Pan troglodytes troglodytes); именно от него вирус иммунодефицита обезьян передался человеку и превратился в ВИЧ-1 группы M. Этот вид шимпанзе живет только на западе Центральной Африки, к северу от реки Конго и к западу от Убанги. Так что Гао в своем исследовании, по сути, обнаружил и резервуар, и географическую область, в которой впервые появился СПИД. То было великое открытие, что отразил и заголовок в журнале Nature: «От pan до пандемии». Фен Гао тогда был постдокторантом в лаборатории Хан.
Но, поскольку Гао, как и Мартина Петерс до него, основывал свои генетические сравнения на вирусах, полученных у обезьян, которые содержались в неволе, небольшие сомнения в существовании этой инфекции среди диких шимпанзе продержались еще несколько лет. А потом, в 2002 г. Марио Саньтяго с группой соавторов объявили в журнале Science о находке ВИОcpz у диких шимпанзе. Сантьяго был кандидатом наук и учеником Беатрис Хан.
Самым главным аспектом работы Сантьяго, за которую он заслуженно получил докторскую степень, стало то, что в процессе поиска ВИО у диких шимпанзе (он нашел вирус всего у одного животного из пятидесяти восьми протестированных) он изобрел методы этих самых поисков. Методы были «неинвазивными» – это означало, что ученому больше не нужно ловить шимпанзе и брать у нее кровь. Ученому теперь достаточно всего лишь следовать за животными по лесу, вставать под ними, когда они справляют естественную нужду (или, что еще лучше, отправлять под желтый дождик кого-нибудь из полевых ассистентов), собирать образцы в маленькие пробирки и проверять их на наличие антител. Оказалось, что моча практически так же красноречива, как кровь.
– То был настоящий прорыв, – рассказала мне Беатрис Хан, когда мы встретились в