О ходе экспедиции В.К. Арсеньев докладывал рапортами на имя генерал-губернатора из залива Святой Ольги, бухт Джигит и Пластун, с рек Самарги, Соён, Такэма, Санхобэ (названия прежние; все пункты – современный Тернейский район Приморья). Они сохранились в РГИА ДВ и снабжены цветными схемами местности, исполненными рукой В.К. Арсеньева. Порой его доклады принимали форму обширных многостраничных отчётов, в которых не только сообщались собранные оперативные сведения, но и высказывались обобщения, формулировались теоретические выводы и практические предложения на будущее. Впоследствии многие фрагменты этих докладов вошли в печатные работы В.К. Арсеньева – «Краткий военно-географический и военно-статистический очерк Уссурийского края» (1912 год), «Вымирание инородцев Амурского края» (1914 год) и «Китайцы в Уссурийском крае» (1914 год).

Как и планировал В.К. Арсеньев, работа экспедиции продолжалась вплоть до выпадения снега, хотя первоначальные намерения приходилось корректировать в зависимости от меняющихся обстоятельств. Например, 20 августа, попав в густой туман, на камнях около залива Святой Ольги разбился пароход «Трувор», и некоторые грузы не дошли до экспедиции; сам В.К. Арсеньев в конце экспедиции не мог совершать продолжительные походы по тайге из-за больной ноги и потому сосредоточился на районе Терней – Пластун – Джигит.

Последним из написанных непосредственно в экспедиции рапортов стал отправленный из залива Джигит 1 ноября 1911 года; вот его сокращённое содержание.

«Доношу Вашему Высокопревосходительству, что в текущем году я дошел до Зал. Джигит и здесь закончил свою работу… За эти три месяца с половиной мною в глубине страны, вдали от моря, в стороне от дорог, сожжено 58 фанз с запасами продовольствия. Арестовывались только те китайцы и корейцы, которые были задержаны в этих фанзах и те, которые бежали в горы, скрываясь от преследования отряда. Таких беглецов арестовано 136 человек.

В общем я полагаю, что всё-же мне удалось удалить из прибрежного района не более 40 % китайского и корейского населения. В одной фанзе найден был склад оружия (4 винтовки) и 12 фунтов пороху, 18 патронов бердановских и 90 шт. боевых трехлинейных патронов» [50].

Из залива Джигит экспедиция на пароходе добралась до Владивостока, а оттуда поездом прибыла в Хабаровск в 20-х числах ноября 1911 года. Весьма важными представляются научные итоги этого похода. Трудно себе представить, как при такой занятости можно было найти время для каких-либо исследований, но В.К. Арсеньев сумел сделать это. За 3.5 месяца работы он лично составил гербарий из 768 растений охотской флоры, который затем выслал в Петербург, профессору-ботанику И.В. Палибину. Н.А. Десулави собрал более 800 растений и совместно с В.К. Арсеньевым установил границу маньчжурской и охотской флоры – на 25 вёрст севернее мыса Олимпиады. Было собрано много фольклорных материалов, продолжено составление орочского словаря, произведены раскопки старых могил, откуда извлечено 6 скелетов, привезена коллекция религиозных предметов и минералогических образцов. В.К. Арсеньев составил описания всех укреплений, колодцев, валов, дорог и других памятников старины Уссурийского края, снял их планы, нанёс на карту более 20 таких пунктов; раскопал две стоянки времён неолита и собрал коллекцию каменных топоров, наконечников стрел, орудий труда, костей, зубов и раковин [56].

После возвращения в Хабаровск В.К. Арсеньев, используя данные только что окончившейся экспедиции, оперативно закончил обширную работу под названием «Краткий военно-географический и военно-статистический очерк Уссурийского края. 1901–1911 гг.». Её основное содержание было доведено автором до сведения членов Приамурского отдела ИРГО в докладах 9, 14 и 24 декабря 1911 года под общим названием «Физико-географический очерк Уссурийского края», а в 1912 году она была издана штабом Приамурского военного округа в двух томах с приложением в виде карт. Это была первая столь подробная сводка энциклопедического характера, содержащая практически все известные к тому времени общегеографические сведения о крае (в том числе о его китайском населении). Одновременно В.К. Арсеньев продолжил написание другого обширного труда – «Китайцы в Уссурийском крае», в котором также использовал данные, накопленные в своих экспедициях, включая только что оконченную.

9 января 1912 года Переселенческим управлением Главного управления землеустройства и земледелия В.К. Арсеньев был откомандирован в распоряжение Приамурского генерал-губернатора в качестве чиновника особых поручений «для исполнения поручений по рабочему вопросу», а ещё через две недели получил иное назначение – штаб-офицером для поручений при Переселенческом управлении. 13 января 1912 года В.К. Арсеньев представил генерал-губернатору доклад с маршрутами четырёх различных экспедиций, предусматривающих продолжение борьбы с хунхузами. Н.Л. Гондатти наложил такую резолюцию: «Лично даны Арсеньеву соответствующие указания. В начале весны состоится его отправка по первому маршруту вплоть до начала лета; относительно других районов поручено выработать общий план действий с Управл. Государственн. Имущ.» [50].

Обстоятельный доклад В.К. Арсеньева по поводу средств и методов борьбы с хунхузами был представлен генерал-губернатору 6 февраля 1912 года, а на следующий день на его первой странице появилась письменная резолюция Н.Л. Гондатти: «Совершенно согласен с высказанными здесь взглядами». Практически арсеньевский документ имел форму и признаки боевой инструкции по противодействию хунхузам; при этом в нём были затронуты не только тактические, но и стратегические аспекты такой борьбы [52].

Данный доклад был настолько продуман В.К. Арсеньевым, что прямые цитаты из него вошли в текст работы «Китайцы в Уссурийском крае», изданной через два года. 7 февраля 1912 года В.К. Арсеньев подал очередной доклад, в котором подробно расписал маршрут новой экспедиции, количество отрядов (два) и людей в них, порядок действий, силы и средства, необходимые для осуществления похода, взаимодействие с судами, планируемые результаты. Он также просил выдать ему открытый лист и инструкцию, аналогичные документам 1911 года, прилагал смету расходов; все эти требования и условия Н.Л. Гондатти утвердил.

Наконец, подписано предписание: «… Предлагаю Вам немедленно отправиться в экспедицию … 4 апреля 1912 г. Гондатти» [50]. В тот же день, 4 апреля 1912 года, буквально накануне отъезда, В.К. Арсеньев получил бумаги о производстве его в капитаны (в предыдущем звании штабс-капитана он пробыл 7 лет).

6 апреля 1912 года В.К. Арсеньев отбыл из Хабаровска во Владивосток, где уладил оставшиеся дела; затем прибыл к месту сбора экспедиции, в село Кремово (название сохранилось, Михайловский район Приморского края). С 16 по 21 апреля 1912 года личный состав находился в Кремово, завершая приготовления к походу, а сам В.К. Арсеньев исследовал ближние окрестности, в том числе и в археологическом отношении. В его основной отряд вошли: переводчик А.А. Шильников, Н.М. Ощепков, в качестве препараторов – студент Н.М. Усов и младший брат В.К. Арсеньева, Александр. Он в 1911 году окончил Межевой институт в Москве и в марте 1912 года вместе с В.К. Арсеньевым приехал на Дальний Восток, где потом работал топографом.