В Смутное время Переяславль-Залесский был захвачен поляками в 1608 году, но уже 1 сентября будущего года освобожден ратью воеводы князя Михаила Скопина-Шуйского.

Поляки разорили монастыри, стоящие на берегах Плещеева озера. Мужественно защищался Никитский монастырь. Поляки осадили его, но монахи и крестьяне окрестных сел отбивались огнем нескольких пушек, которые хранились в обители. Душой обороны был игумен Мисаил. Но все же осаждавшим удалось силой взять Никитский монастырь, при этом почти все защитники погибли.

Когда Русская земля поднялась на освобождение Москвы, захваченной поляками, в Переяславле-Залесском собирались отряды первого земского (народного) ополчения рязанского воеводы Прокопия Ляпунова.

После воцарения Михаила Романова Переяславль-Залеский продолжал оставаться в числе важных российских крепостей. В 1666 году был возведен новый деревянный кремль: «...рублен в две стены». Длина новой крепостной ограды составляла более двух километров, имелось 12 башен. Среди укрепленных городских ворот выделялись Спасские и Рождественские.

Деревянные башни просуществовали несколько веков и были разобраны только в 1759 году.

После Смутного времени государство уже не нуждалось в такой «внутренней» крепости, которой изначально являлся Переяславль-Залесский. Но все же он вошел в последующую отечественную военную историю. С легкой руки юного царя Петра I сухопутный город стал первым в России кораблестроительным центром.

...Одним из символов княжеских междоусобиц на Руси является Тверь, длительное время не без успеха соперничавшая с Москвой. Первое упоминание о городе относится к 1208 году, но, вне всякого сомнения, «Тферь» возникла гораздо раньше, будучи удачно расположена у слияния рек Волги, Тверцы и Тьмаки.

Первое опустошение Твери связано с Батыевым нашествием, когда защитники города-крепости не смогли устоять против вражеского натиска. В летописи, в которой рассказывается о разорении татаро-монголами Суздальской земли, есть такие строки:

«...Аинии Тферь шедшее взяша, в ней же сына Ярославия убиша...»

Став столицей самостоятельного княжества, Тверь начала противостоять экспансии Москвы, которая стремилась «взять под свою высокую руку» другие уделы на Руси. Поэтому не случайно в тверском приграничье с московскими владениями появились такие крепости, как Холм, Дорогобуж, Буйгородок, Клин, Кашин, Старица, Белгород. Они в своем большинстве служили прикрытием и от Великого княжества Литовского.

В 1232 году по дошедшим до нас сведениям Тверь была защищена деревянной рубленой оградой протяженностью в 800 метров, имевшей 14 боевых башен. Проездными из них были четыре, остальные — глухими.

Великий князь (с 1304 по 1317 год) Михаил Ярославич Тверской в последний год своей жизни увеличил высоту стены, стоявшей на земляном валу. (По навету московского князя Юрия он был вызван в Золотую Орду к хану Узбеку и там казнен. Впоследствии князь был канонизирован Русской православной церковью под именем Михаила Святого.)

Таким немаловажным обстоятельством воспользовалась Москва, отстаивавшая свое право на великое княжение, которое давалось с ханским ярлыком. В августе 1327 года в Твери произошло восстание горожан, в ходе которого был уничтожен отряд золотоордынцев во главе с «послом» Чолханом. Хан Узбек послал в карательную операцию против Твери большое войско, к которому со своими дружинами примкнули ряд удельных князей, в том числе Иван Данилович Московский (Калита).

Тверь была взята и подверглась страшному разгрому, положившему конец ее процветанию как большого торгово-ремесленного города. Вместе с Тверью был сожжен и Кашин, который встал на пути ханского войска.

Поскольку Тверь не отказалась от противостояния с Москвой, она начинает серьезно укрепляться как крепость. Сперва появляется глубокий ров, который соединил Волгу с Тьмакой. Была обновлена деревянная ограда, ров стал шире и глубже, был подсыпан вал. Деревянная стена крепости регулярно обмазывалась глиной, что предохраняло ее от поджога.

В 1375 году Москва пошла большой войной на Тверь. Под знамена Дмитрия Донского встали дружины Дмитрия Суздальского и его брата Бориса, Владимира Серпуховского, Василия Кашинского, князей ростовских, ярославских, смоленского, белозерских, брянского, новосильского, Оболенского, тарусских. В войне против Твери принял участие и Новгород, который хотел отомстить за кровавый погром и сожжение Торжка.

Для начала союзники взяли принадлежавший князю Михаилу Александровичу Тверскому город Микулин. 5 августа Тверь была осаждена. 8-го числа осаждавшие стали делать к крепостной стене «примет» (земляную насыпь), а для защиты воинов ставить плетеные туры. Против «Тмацъких ворот» были поставлены осадные машины.

Тверичи с князем Михаилом предприняли сильную вылазку. В жарком бою осадные орудия были уничтожены, а часть туров сожжена. Однако это только оттянуло развязку.

Москвичи и их союзники обложили город со всех сторон, устроив осадную линию и за Волгой. Были починены мосты, которые сожгли тверичи. Весь город был «отынен», то есть обнесен острожной стеной. Теперь осажденные были лишены возможности связываться с внешним миром. В городе в скором времени начался голод, поскольку запасов продовольствия в большом городе оказалось для военного времени мало.

Московские войска осаждали Тверь около месяца. Не помогла ее взять и новгородская рать, прибывшая в осадный лагерь. В итоге Михаил Тверской, так и не дождавшись помощи от своего тестя и союзника великого литовского князя Ольгерда, подписал с Дмитрием Донским мир на его условиях.

Тверская крепость продолжала усиливаться и в последующие годы. Так, летописец в 1387 году сообщал следующее:

«...У града Тфери около вала рубиша кожух и землею насыпаша. Того же лета и ров копаша глубле человека».

Сооружаются новые, более крепкие городские ворота. У крепости вне ограды появляются два достаточно надежных передовых форпоста. Ими стали Федоровский и Отрочий монастыри, напоминавшие собой маленькие, но сильные крепостцы. Первый был основан в 1394 году на острове в устье реки Тьмаки, встав напротив тверского кремля.

Через полвека Федоровский монастырь был снесен, а на его месте выстроена крепость. Она защищала подступы к расположенному поблизости мосту и речной плотине на Тьмаке. Плотина создавала напор воды в реке, за счет чего городской ров наполнялся водой.

Тверская крепость стала сильна своим артиллерийским вооружением. В башнях теперь стояли большие пищали и пушки. Боекомплект из ядер и «каменного дроба» (каменной картечи) хранился в банях. Пороховой («зелейный») погреб был в крепости один, располагаясь в княжеском дворе.

Обращается внимание на более надежную защиту крепко «сделанных» городских ворот. Их было трое: Владимирские, Тьмацкие и Волжские. Теперь по бокам каждой из надвратных башен на стенах находились так называемые «стрельницы», предназначавшиеся для усиления обороны наиболее уязвимых мест крепостной ограды. А такими местами в любой крепости во все времена были ворота.