С 22 августа по 26 сентября 1941 года — замначальника 1-го отдела Управления особых отделов НКВД СССР. С 26 сентября по 17 декабря 1941-го — начальник Особого отдела НКВД 7-й отдельной армии. Начальник Особого отдела НКВД Волховского фронта — с 17 декабря 1941-го по 2 мая 1942 года, непродолжительно — с мая по июнь 1942-го — Ленинградского фронта, а потом его снова перебросили руководить Особым отделом НКВД и УКР Смерш Волховского фронта — до 15 февраля 1944 года.

С марта 1944 года руководил УКР Смерш Карельского фронта.

Начальник УКР Смерш по Резервному фронту — с 30 декабря 1944-го до 20 апреля 1945 года. В дальнейшем возглавлял Отдел КР Смерш по Приморской группе войск 1-го Дальневосточного округа с 20 апреля до 5 августа 1945 года. Затем возглавил УКР Смерш по 1-му Дальневосточному фронту и Приморскому военному округу.

С 5 сентября 1946-го до августа 1949 года — начальник отдела КР МГБ по Западно-Сибирскому военному округу. В 1949–1950 годах — слушатель курсов высшего руководящего состава Высшей школы МГБ СССР.

После окончания учебы вернулся на предыдущую должность, где проработал до 1953 года. Заместитель начальника Отдела КР — Особого отдела МВД по Приволжскому военному округу — с 28 апреля 1953-го до марта 1954 года, затем — замначальника Особого отдела КГБ при СМ СССР по Приволжскому военному округу — до 9 марта 1955 года.

Уволен из КГБ по болезни.

Комиссар госбезопасности 3-го ранга Д. И. Мельников был направлен начальником Особого отдела НКВД СССР Волховского фронта (ВФ), созданного по директиве Ставки ВГК с 17 декабря 1941 года за счет сил левого крыла Ленинградского фронта (ЛФ) и резервов Ставки ВГК в ходе обороны городов Ленинградской области Волхова и Тихвина. Возглавил фронт генерал армии К. А. Мерецков. Но 23 апреля этот фронт неожиданно расформировали. Однако, как писал в своих мемуарах командующий ЛФ генерал-лейтенант М. С. Хазин, «довольно скоро нам пришлось убедиться, что в результате объединения фронтов дело не только не улучшилось, а, наоборот, ухудшилось».

8 июля 1942 года Волховский фронт вновь был восстановлен. Ставка наконец-то поняла ошибочность своего решения в упразднении данного фронта. Возглавил его снова К. А. Мерецков. Сталин приказал ему и А. М. Василевскому вывести 2-ю ударную армию — хотя бы без тяжелого вооружения и техники — из окружения.

Эти места автору знакомы — болота, топи, леса, подлески.

Выводить армию, попавшую в окружение, а тем более выводить тяжелую технику из-за дефицита горючего было невозможно. Командующий армией генерал А. А. Власов в этой обстановке проявил безволие, пьянствовал и развратничал, а после уничтожения средств связи совсем потерял управление войсками.

Начальник Особого отдела армии майор госбезопасности А. Г. Шашков и его подчиненные проявили героизм и верность Родине, до последнего пытались через свои возможности сцементировать личный состав полков и дивизий, подавить панические и дезертирские проявления.

Их поведение напоминало действия военных контрразведчиков Юго-Западного фронта во главе с комиссаром ГБ 3-го ранга А. Н. Михевым летом 1941 года.

При выходе из окружения в ночь с 24 на 25 июня 1942 года начальник Особого отдела 2-й ударной армии А. Г. Шашков попал под артиллерийско-минометный обстрел и, получив ранение в руку с переломом кости, решил не обременять других и застрелился.

Д. И. Мельникову надо было пережить и предательство Власова, и гибель Шашкова, и неудачи фронтовых операций первых месяцев войны. Но, несмотря на это, его организаторские способности и профессионализм высоко ценило руководство на Лубянке. Недаром Дмитрия Ивановича бросали на самые сложные участки боевых действий. После службы в особых отделах НКВД он руководил УКР Смерш Ленинградского, Карельского, 1-го Дальневосточного фронтов и Приморской группой войск Дальневосточного округа.

Во время службы в УКР Смерш Ленинградского фронта (ЛФ) он через подчиненный оперативный состав принимал непосредственное участие в разработке агентуры противника, задействованной в разведывательной, диверсионной и террористической деятельности.

Вот один из примеров. Летом 1943 года сотрудниками Смерша ЛФ был задержан и разоблачен фашистский террорист в форме советского офицера и с документами на фамилию Савенков, имевший задание убить командующего войсками Ленинградского фронта генерал-полковника Л. А. Говорова.

Террористический план был таков — он попросил у охраны допустить его к командующему якобы для передачи «важных документов о противнике». При ознакомлении с удостоверением личности у Савенкова проверяющий офицер не нашел в нем тех самых «меток», которые должны были быть на подлинном документе. «Неудачник» был тут же задержан для выяснения личности, а потом арестован.

При провалившемся немецком агенте, бывшем командире Красной армии, попавшем в плен, а затем перешедшем на сторону врага, военные контрразведчики обнаружили весь арсенал экипировки террориста, готовящегося по заданию немецкой разведки убить фронтового руководителя.

И вот час освобождения настал. «Победу приближали как могли» при снятии блокады: и армейцы, и разведчики, и контрразведчики. Утром 12 января 1943 года тяжело дрогнул воздух над скованной льдом Невой. Раскаты оглушительного залпа более четырех с половиной тысяч орудий и минометов Ленинградского и Волховского фронтов и Краснознаменного Балтийского флота докатились до умирающего Ленинграда. Этого дня давно ожидали защитники Северной столицы…

А дальше у Мельникова были трудные и долгие дороги в сторону Дальнего Востока. Ему поручили возглавить УКР Смерш 1-го Дальневосточного фронта, а затем Приморской группы войск Дальневосточного округа, участвовавших в логическом окончании Второй мировой войны — разгроме Квантунской армии и таким образом сокрушении японского милитаризма.

Руководство СССР знало о существовании плана «молниеносной войны» Японии против Советской России под кодовым названием «Кантокуэн». Это был не одномоментный акт, он созревал в недрах кабинета министров, генералитета имперской армии и ее генштаба, а также главного морского штаба и сотрудников военной разведки. С поползновениями японской военщины надо было бороться.

Для УКР Смерш двух фронтов — 1-го и 2-го Дальневосточных — и Тихоокеанского флота главной задачей была борьба и с японскими разведчиками, осевшими в японских военных миссиях (ЯВМ), и с диверсантами, и с террористами. Советским армейским чекистам пришлось буквально выкорчевывать в Приморье многолетние японские резидентуры, глубоко внедрившие свою агентуру.

Большую опасность для СССР и Дальневосточного региона представляли и угрозы бактериологической войны со стороны Японии посредством отряда № 731. Надо было найти его подразделения, обезвредить и задержать всех сотрудников для предъявления им обвинения в проводимых чудовищных экспериментах над людьми и последующего суда над изуверами.

Все эти тяготы легли на плечи генерал-лейтенанта Дмитрия Ивановича Мельникова, но о результатах той борьбы, к сожалению, из-за ограничения тематики рамками книги автор не может рассказать подробно.