В последующем из личного состава ряда истребительных батальонов были сформированы партизанские отряды, которые успешно вели борьбу во вражеском тылу. Так, партизанский отряд под командованием пограничника В. Карасева в сентябре 1941 года под Москвой внезапно напал на штаб 12-го армейского корпуса гитлеровцев. При этом партизаны уничтожили до 600 фашистов, в том числе одного генерала, было сожжено 4 танка, до 100 автомашин. За умелое и успешное выполнение боевого задания командир партизанского отряда В. А. Карасев удостоился звания Героя Советского Союза.

С развертыванием боев за Москву истребительные батальоны были сведены в четыре стрелковые дивизии. В последующем они были переданы в состав Калининского фронта, участвовали в разгроме немцев под Москвой и все были удостоены звания гвардейских. Всего в батальонах в Москве и Подмосковье было свыше 400 офицеров-пограничников.

Широкую известность получили истребительные батальоны в Прибалтике, состоявшие в основе из местных жителей. На командные должности были назначены пограничники, авторитет которых среди местных жителей был высок. Так, 8-й погранотряд выделил 15 (в целом по Прибалтийскому округу 50) офицеров для комплектования истребительных батальонов. Среди них были коменданты участков майор И. З. Смирнов и капитан Г. А. Бордуков, начальник штаба комендатуры И. Григорьев. Командирами истребительных батальонов были также назначены майоры С. М. Горбатенко, И. Д. Загарьев, капитаны М. Ф. Пастернак, Ф. М. Лисицын, М. Н. Рубинов, А. Г. Лошманов и другие. Военкомы батальонов подбирались как из числа политработников-пограничников, так и из местных партийно-советских работников. Ими были инструкторы политотдела отряда старший политрук С. А. Русанов, политруки Я. П. Яланский, Н. А. Тесленко, Е. П. Рыжов, лейтенант А. А. Якимов, а также работники партийных комитетов В. Кинн, В. Ферберг, К. Кукки и др. Особенно большую работу в батальонах проводил назначенный комиссаром оперативной группы пограничных войск округа второй секретарь ЦК КП Эстонии Федор Окка. Он побывал во многих батальонах, лично провел несколько совещаний командиров и военкомов. Все это способствовало оживлению политической работы, подъему боевого настроения среди бойцов. Участвуя в боях, истребительные батальоны не раз отличались. Об этом писалось в центральных газетах, в том числе в «Правде» и «Комсомольской правде», сообщалось в сводках Совинформбюро. Бессмертный подвиг при обороне Таллина совершил комиссар оперативной группы Ф. Окка, имя которого было присвоено заставе 106-го Краснознаменного погранотряда Краснознаменного Прибалтийского пограничного округа.

В условиях общего отступления наших войск пограничники нередко оказывались в окружении. Выход из него требовал большой организованности. 22 августа 1941 года 13-й пограничный отряд в районе деревни Обликушки (Западный фронт) был сначала внезапно подвергнут бомбардировке 27 фашистскими самолетами, а затем со стороны деревни Харитоново в расположение отряда прорвались танки противника. Враг предполагал, что перед ним находится штаб крупного соединения, и бросил против отряда мощные огневые средства и технику. Несмотря на численное превосходство, отряд принял бой. Командиры, политработники провели большую работу по организации отпора врагу всеми имеющимися средствами. В подразделениях командиры накоротке провели красноармейские собрания, беседы о поведении воинов в бою. Затем все они пошли на огневые позиции, в окопы, где непосредственно на месте приняли меры по наведению порядка. Первые часы боя показали высокие морально-боевые качества пограничников, которые сражались самоотверженно, нанося врагу большой урон в людях и технике. Только за один день боя у противника было отбито 6 танков, подожжено 2 бронемашины, уничтожено 2 автомашины с пехотой[115].

Высокую организованность в исключительно тяжелой обстановке показал 79-й погранотряд в период его участия в обороне города Кировограда в начале августа 1941 года на южном участке фронта[116]. Здесь сложились тяжелые условия. Противник, используя свое численное превосходство, теснил наши части. Под угрозой захвата оказался город Кировоград. Начальник гарнизона не справился со своими обязанностями, проявил растерянность, за что был отстранен от руководства. Начальником гарнизона назначили начальника 79-го погранотряда подполковника С. И. Грачева, военным комиссаром — военкома отряда батальонного комиссара И. Т. Прибылова.

В срочном порядке организовывалась оборона города. В целях усиления гарнизона были остановлены идущие в тыл с фронта одна танковая рота, взвод бронемашин, задержаны 4 противотанковых орудия. Создали сводную роту из одиночек, следовавших в тыл. В состав гарнизона был включен запасной дивизион. В короткое время удалось сколотить вновь созданные подразделения. Прибывший в город военком охраны тыла фронта бригадный комиссар А. А. Клюев 1 августа 1941 года провел совещание партийного актива города, на котором были поставлены конкретные задачи по поддержанию порядка и организованности. Это необходимо было сделать в связи с тем, что в городе царила паника. Не оказалось света, воды, хлеба. Денежные знаки из банка, боеприпасы, зерно, горючее и другие ценности не были вывезены. В городе началось самовольное вскрытие магазинов, складов, часть населения перепилась. На вокзале собралось до 200 военнослужащих-одиночек, которые самоуправничали, самовольно садились в вагоны и на паровозы, пытаясь выехать в тыл. Вследствие усиленной бомбардировки города с воздуха возникли большие пожары, тушение их никем не организовывалось. Начальник аэродрома без разрешения начальника гарнизона уничтожил аэродромное хозяйство и вывел прикрывающие аэродром части за город, чем еще больше усилил панику.

Для наведения порядка на вокзал была направлена группа командиров и политработников пограничного отряда. Они свели в новое подразделение красноармейцев-одиночек, организовали эвакуацию материальных ценностей и денег банка. Товары и продукты, которые нельзя было вывезти, были розданы населению. Железнодорожный мост и предприятия города подготовили к взрыву. К исходу 3 августа 1941 года в городе был наведен порядок. Большую организованность показал личный состав отряда и при обороне города. Несмотря на малочисленность гарнизона и усиленный артиллерийский и минометный огонь противника, среди бойцов не было ни одного случая самовольного оставления позиций, бегства с поля боя и паники. Пограничники в ходе обороны города уничтожили до 500 солдат и офицеров, 7 танков, 10 автомашин и 15 мотоциклов противника[117].

Выполнение задач охраны войскового тыла требовало от воинов высокого воинского и профессионального мастерства, мужества и отваги. Вот некоторые примеры.

В декабре 1941 года в течение двух дней несколько раз отличился заместитель политрука 95-го погранполка В. И. Утин.

9 декабря, пользуясь темнотой, он подполз к дому, в котором находилось до 20 вражеских солдат и офицеров, забросал его гранатами. Было уничтожено 10 человек. Во время боя вражеский офицер бросился на Утина с шашкой. Ударом приклада автомата в голову Утин убил офицера. Другого, бросившегося на него, ударом ноги в живот сбил на землю. Используя замешательство среди врагов, Утин перезарядил пулемет и его огнем уничтожил пулеметный расчет противника, а старшего унтер-офицера взял в плен. На следующий день Утин, по собственной инициативе, под ураганным огнем противника с автоматом бросился на группу фашистов. От огня пограничников полегло до 40 вражеских солдат. Вторично в этот день Утин подполз к вражескому пулеметному расчету и броском двух гранат уничтожил его. В третий раз в этот день заместитель политрука с автоматом в течение двух часов один прикрывал фланг роты. Осколком мины Утину оторвало руку. Мужественный боец, не имея сил держать автомат, выхватил пистолет и с возгласом «Товарищи, держитесь, уничтожим фашистов!» бросился на врагов. Боевые друзья, подхватив безжизненное тело героя, стремительно сблизились с фашистами и в рукопашной схватке уничтожили до роты вражеских солдат. Отважному замполитруку В. И. Утину Указом Президиума Верховного Совета СССР 27 марта 1942 года было присвоено звание Героя Советского Союза.