Через три года, когда наставником «Данфермлин Атлетик» уже был бывший голкипер «Блэкпула» и сборной Шотландии Джордж Нил Фарм, команда в третий раз вышла в финал Кубка Шотландии и со счетом 3:1 переиграла 27.04.1968 клуб «Харт оф Мидлотиан» (Пат Гарднер отметился «дублем», один мяч провел дебютант из «Рэйт Роверса» Иан Листер). Причем, в ходе турнира были повержены такие сильные клубы, как «Селтик» (2:0), «Абердин» (2:1), «Партик Тистл» (1:0) и «Сент-Джонстон» (1:1, 2:1).

В победном финале цвета «Данфермлин Атлетик» защищали: Бент Мартин, Вилли Каллаган, Джон Макгарти, Рой Бэрри, Джон Ланн, Иан Листер, Томми Каллаган, Хью Робертсон, Алекс Эдвардс, Пат Гарднер, Берт Пейтон.

По итогам сезона 1971/1972 «Данфермлин Атлетик» покинул элиту шотландского футбола, но через год смог вернуться. Правда, всего на две сезона (1973/1974 и 1974/1975), а потом началось сползание клуба вниз по турнирной лестнице. Сезоны 1976/1977–1978/1979, 1983/1984–1985/1986 команда провела в третьем дивизионе. В высший шотландский дивизион клуб смог вернуться в 1989 году, после чего несколько раз покидал его. Лучший результат клуба в чемпионате Шотландии последнего десятилетия – 4-е место в сезоне 2003/2004, а по итогам сезона 2012/2013 команда вообще вылетела в League One (третий по значимости дивизион).

В 1991 году «Данфермлин Атлетик» во второй раз вышел в финал Кубка Шотландской лиги и вновь не смог завоевать почетный трофей, проиграв «Хайберниану» со счетом 0:2. Тогда в команде Джима Лишмана играли: Энди Роудс, Томми Уилсон, Рэймонд Шарп, Норри Маккати, Дэвид Мойес, Крейг Робертсон, Дерек Макуильямс, Иштван Козма, Скотт Литч, Билли Дэвис, Крис Синклер, Эдди Каннингтон, Иан Макколл.

Последние кубковые успехи «Данфермлина» датируются уже новым тысячелетием – в 2004 и 2007 годах клуб доходил до финала Кубка Шотландии, а в 2006 году в третий раз в своей истории принял участие и в финале Кубка Шотландской лиги.

22.05.2004 на стадионе «Хэмпден Парк» в Глазго, в финале Кубка Шотландии встретились «Селтик» и «Данфермлин Атлетик». Победу в этом поединке праздновали «кельты». На «дубль» Хенрика Ларссона и гол Стилияна Петрова, подопечные Джимми Колдервуда смогли ответить лишь одним забитым мячом защитника сборной Литвы Андрюса Скерлы.

Через три года, 26.05.2007, эти же соперники вновь сошлись в решающем поединке за Кубок Шотландии, и вновь сильнее оказался «Селтик», добившийся победы с минимальным счетом 1:0. «Данфермлин Атлетик» тогда тренировал ирландец Стивен Кенни. А годом ранее, все тот же «Селтик» праздновал успех в финале Кубка Шотландской лиги, забив 19.03.2006 в ворота «Данфермлин Атлетик», которые защищал Аллан Макгрегор, три безответных мяча.

Большую часть своей истории «Данфермлин Атлетик» выступал в футболках в горизонтальную чёрно-белую полоску, чёрных шортах и такого же цвета гетрах. Однако оригинальными цветами клуба, под которыми он играл с 1885 по 1901 год, были бордовые футболки с тёмно-синими или белыми шортами и бордовыми, белыми или серыми гетрами. С 1901 по 1909 год команда выступала в форме синего цвета, и только с 1909 года перешла на чёрно-белые цвета.

Свои домашние матчи «Данфермлин Атлетик» с первого дня своего основания проводит на «Ист Энд Парк». В начале 30-х годов после вылета клуба из высшего дивизиона и на фоне разразившейся Великой Депрессии «Данфермлин» сдавал стадион в аренду под собачьи бега, а во время Второй Мировой Войны здесь некоторое время базировались британские и польские войска.

Наиболее принципиальными соперниками «Данфермлина» считаются базирующиеся по соседству «Кауденбит» и «Рэйт Роверс», встречи с которыми известны как дерби Файфа, а также базирующийся на противоположном берегу реки Форт «Фолкирк».