31 мая "Айова", идя на сей раз сначала с востока на запад головным в кильватерной колонне своего отряда, около часа вёл обстрел испанцев. В обоих боях броненосец не имел потерь и повреждений. 1 июня адмирал Сэмпсон возглавил объединённые американские морские силы возле Сантьяго.

Броненосец "Айова" на ходовых испытаниях. 1897 г.

В ночь со 2 на 3 июня броненосец обеспечивал операцию затопления парохода "Мерримак" на фарватере Сантьяго. Он охранял этот старый угольщик до входа в бухту, а его паровой катер шёл следом за "Мерримаком", помогая тому в поисках фарватера. Как писал испанский лейтенант Хозе Мюллер-и-Техейро, 4 июня "Айова" входил в состав эскадры из 17 вымпелов, стоявшей дугой между бухтой Аквадорес и мысом Кабрера на расстоянии примерно 5 миль от берега. Он занимал позицию на фланге рядом с броненосцем "Орегон", отличаясь от того своими высокими трубами и полубаком. Машины "Айова" держал застопоренными, но сносимый течением, систематически возвращался на своё место. 5 июня, согласно записей Мюллера, американская эскадра приблизилась ко входу в бухту.

В дальнейшем "Айова", как и другие броненосцы, продолжал нести дозорную службу возле Сантьяго, находясь в 4-5 милях от входа в бухту на своём штатном месте между "Массачусетсом" и "Нью Йорком". Иногда он отходил для дозаправки.

6 июня корабль в составе восточного отряда под командованием адмирала Сэмпсона участвовал в обстреле фортов Сантьяго и стрелял по укреплениям Морро. Потерь и повреждений при этом не имел. В июне "Айова" вошёл в список т.н. "восточной эскадры коммодора Уатсона", но до конца войны продолжал оставаться возле Кубы. 18 июня "Айова" от Сантьяго ушёл в море, вероятно, к Гуантанамо для пополнения запасов топлива, воды и продовольствия. На рассвете 20 июня броненосец уже продолжал нести службу у входа в бухту.

Броненосец "Айова"

(Сведения о корабле, опубликованные в английском справочнике "JANE'S FIGHTING SHIPS". 1900)

В соответствии с приказом Сэмпсона от 21 июня, который определял действия кораблей при высадке десанта в Дайкири 22 июня, "Айова", как "Массачусетс", "Бруклин" и "Орегон" должен был оставаться на своём месте, контролируя выход из бухты, чтобы пресечь возможную попытку прорыва испанской эскадры. В этот день все паровые и гребные суда, кроме одной шлюпки, "Айове" следовало направить к флагману, для обеспечения перевозки десанта. По испанским данным, 22 июня "Айова" вместе с "Техасом" и "Бруклином" вели перестрелку с батареями Морро и Сокапа. 23 июня "Айова" вместе с другими броненосными кораблями стоял в 6 милях от входа в бухту Сантьяго.

На рассвете 26 (или 28) июня "Айова" снова уходил от Сантьяго к Гуантанамо для дозаправки, но 29 июня вернулся к Сантьяго, где и находился до боя 3 июля.

Перед боем 3 июля "Айова" находился в центре блокадной линии примерно в 3 милях от форта Морро между броненосцами "Орегон" и "Техас", удерживаясь машинами носом к входу в бухту и имея пар для малого хода. Крейсер "Нью Йорк", который по диспозиции должен был стоять между "Айовой" и "Орегоном", отсутствовал, как и броненосец "Массачусетс", место которого было между "Айовой" и "Техасом".

Увидев выходящие корабли испанцев и прекратив воскресный смотр, командир "Айовы" начал бой, первым из своей эскадры открыв огонь с 30 каб. и пойдя прямо на противника. На расстоянии 12,5 каб. броненосец повернул влево и дал залп правым бортом по крейсеру "Инфанта Мария Тереза". Затем он развернулся в сторону испанцев, а на расстоянии 9,5 каб. повторил манёвр с левым поворотом, снова произведя залп по "Инфанта Мария Тереза". Потом "Айова" опять пошёл прямо на неприятеля, а на расстоянии 7 каб. окончательно развернулся влево и лёг на параллельный с ним курс, открыв огонь по крейсеру "Кристобаль Колон".

Позднее командир американского броненосца говорил, что в начале боя он шёл на врага с целью нанесения таранного удара, но сблизиться вплотную не успел. По испанским миноносцам "Айова" вёл стрельбу с дистанции 20-22 каб., нанося повреждения своей скорострельной артиллерией и отгоняя прислугу от пушек. Его 152-мм и малокалиберные орудия поддерживали огнём "Индиану", "Орегон" и "Техас", встретивших снарядами выходящие из бухты "Плутон" и "Фурор". Вскоре "Айова" прекратил огонь по миноносцам и занялся преследованием крейсеров противника. Густые клубы порохового дыма сильно затрудняли видимость с корабля.

По свидетельствам современников, снаряды с "Айовы" попали в концевой крейсер испанской колонны "Алмиранте Окуендо". Его кормовые башни после поворота на курс преследования в бою практически не участвовали. Будучи самым новым из броненосцев, "Айова" в этом бою двигался ещё медленнее, чем уже ставший ветераном "Техас". У него за всё время боя так и не было задействовано два котла из пяти. Сначала "Айова" шёл третьим после "Бруклина" и "Техаса" со скоростью не выше 11 узлов. Затем он позволил "Орегону" обогнать себя, отстал от своей колонны и, прервав погоню за единственным остававшимся крейсером противника "Кристобаль Колон", пошёл к сидевшему на рифах крейсеру "Визкайя" (тот загорелся от огня "Бруклина" с "Орегоном" и выбросился на берег уже после того, как "Айова" и "Техас" отстали от своих). Экипаж броненосца пытался оказать помощь экипажу погибающего корабля, а заодно стремился высадить призовую партию.

В бою 3 июля "Айова" выпустил 1469 снарядов: по 31 12- и 8 – дюймовых, 251 4-дюймовых, 1056 57-мм, 100 37-мм. По испанским крейсерам "Айова" стрелял в основном своим главным калибром, поддержанным скорострельными пушками. Осмотр американцами после боя вражеских кораблей показал, что в "Инфанта Мария Тереза" попали и разорвались два 305-мм снаряда, нанеся обширные, но неопасные повреждения. Возможно, они были с "Айовы" (или с "Техаса"). Сколько из двенадцати 203-мм снарядов, поразивших испанский флагман, принадлежало "Айове", установить было невозможно.

Согласно рапорту командира "Айова", некоторое время он вёл сосредоточенную стрельбу по "Кристобаль Колон", а по данным очевидцев, его снаряды попадали и в "Алмиранте Окуендо". Высоко расположенные над водой и более удачно, чем на "Индиане", размещённые, 203-мм башни корабля были в бою весьма полезными. 102-мм скорострельные пушки, имевшиеся на броненосце, оказались достаточно эффективными, дав 12 попаданий. Сколько из 57-мм снарядов "Айовы" попало в испанские миноносцы, выяснить было невозможно.