В ряде городов Западной Украины (Львове, Тернополе, Самборе, Злочеве и других) при их захвате немецкой армией проводилась эксгумация трупов расстрелянных НКВД во время репрессий и «зачистки тюрем» и устраивались «выставки» жертв «евреев из ЧК». Для раскопок могил немцы привлекали евреев из гетто. Во время раскопок их заставляли целовать раны трупов, избивали и, после окончания процедур, многих из них убивали. Расстрелы заключённых в тюрьмах на Украине проводились также в Киеве, Харькове, Днепропетровске и Запорожье. «Акции» по «зачистке тюрем» проводились и в Белоруссии, Литве, Латвии и Эстонии. В России такие «зачистки» проводились в тюрьме г. Орла и в Кабардино-Балкарии, вблизи Нальчика, где на молибденовом комбинате НКВД работали заключённые.

Жители региона, мечтающие об избавлении от польского режима, попали под ещё более жёсткий и кровавый сталинский режим. Такое поведение новой власти укрепляло позиции ОУН в регионе и, безусловно, способствовало формированию антисоветского вооружённого подполья. Из отчёта Краевого Проводника ОУН(б) на ЗУЗ И. Климова (Е. Легенды) по состоянию на июль 1941 г. Сеткой ОУН было охвачено до половины населённых пунктов, а общая численность членов ОУН в регионе достигла 20 тыс.

После «освободительного похода» Красной армии и включения ЗУЗ в состав УССР и СССР ОУН активизировала свою деятельность. Антисоветские мероприятия, проводимые ОУН, получали поддержку большей частью населения ЗУЗ. Этому способствовал авторитет организации как активного борца с польским антинародным режимом.

Активное участие в «освободительном походе» приняли органы НКВД. Мероприятия, связанные с «освободительным походом» и проводимые по линии НКВД, маскировались под «учебными сборами». 8 сентября 1939 г., т. е. до начала «Освободительного похода» Красной армии, нарком внутренних дел СССР Лаврентий Берия подписал приказ № 001064 «Об оперативных мероприятиях в связи с проводимыми учебными сборами».

Приведём выписку из приказа НКВД СССР № 001064:

«ОБ ОПЕРАТИВНЫХ МЕРОПРИЯТИЯХ В СВЯЗИ С ПРОВОДИМЫМИ УЧЕБНЫМИ СБОРАМИ Для проведения оперативно-чекистской работы в соответствии с ранее данными указаниями ПРИКАЗЫВАЮ:

1. Народному комиссару внутренних дел УССР тов. Серову выделить 50 оперативных работников НКВД Украины и 150 оперативно-политических работников погранвойск, стянув их в Киев к 22.00 9 сентября.

2. Народному комиссару внутренних дел БССР тов. Цанава выделить 50 оперативных работников НКВД БССР и 150 оперативно-политических работников погранвойск, стянув их в Минск к 22.00 9 сентября.

3. Начальнику УНКВД по Ленинградской области тов. Гоглидзе выделить 30 оперативных работников УНКВД и 30 оперативно-политических работников погранвойск и откомандировать их 8–9 сентября в Киев, в распоряжение НКВД Украины — тов. Серову.

4. Зам. наркома внутренних дел СССР тов. Круглову и тов. Масленникову выделить 25 оперативных работников НКВД СССР и 9 сентября направить: 10 человек — в Киев, в распоряжение НКВД УССР — тов. Серову, и 15 человек — в Минск, в распоряжение НКВД БССР — тов. Цанава.

5. Организовать 5 оперчекистских групп в КОВО и 4 — в БОВО.

7. Тов. Серову и тов. Цанава укомплектовать указанные группы оперативными работниками: в КОВО — по 50–70 человек, а в БОВО — по 40–55 человек.

8. Тов. Серову и тов. Цанава: тщательно проинструктировать оперативно-чекистские группы в соответствии с полученными указаниями; подготовить организацию отправки и использования выделенных товарищей для чекистско-оперативной работы; принять меры к вооружению личного состава групп наганами с соответствующим количеством патронов; выделенные оперативно-чекистские группы распределить по плану Наркомата обороны по армейским группам.

9. Связаться: тов. Серову — с тов. Хрущёвым и тов. Тимошенко, а тов. Цанава — с тов. Пономаренко и тов. Ковалёвым, ориентировав их о проводимых мероприятиях.

10. Всех выделенных работников снабдить командировочными деньгами из расчёта на 1 месяц.

11. Заместителю народного комиссара внутренних дел СССР тов. Масленникову выделить из войск Киевского и Белорусского пограничных округов в распоряжение начальников оперативно-чекистских групп для выполнения специальных заданий по одному батальону численностью 300 человек каждый. Тов. Масленникову к 22.00 9 сентября представить срок готовности и расчёт по формированию батальонов.

12. Тов. Круглову иметь резерв 300 человек из террит. органов НКВД. Список резервов закончить к 10 сентября.

13. Тов. Серову и тов. Цанава о ходе работы доносить ежедневно к 18.00 по телеграфу.

14. Для организации и проведения всех необходимых мероприятий, а также для соответствующего инструктажа командировать: на Украину — заместителя народного комиссара внутренних дел СССР тов. Меркулова, а в Белоруссию — начальника Особого отдела НКВД СССР тов. Бочкова.

Народный комиссар внутренних дел СССР Л. Берия».

Уже через сутки народный комиссар внутренних дел УССР Серов сообщил в Москву о выделении работников и ходе комплектования оперативных групп. Секретность и срочность комплектования оперативных групп объяснялась тем, что из их личного состава планировалось сформировать территориальные управления НКВД в областях Западной Украины. 12 сентября 1939 г. были сформированы и укомплектованы четыре оперативные такие группы, одна из которых оставалась в резерве.

По условиям «учебных сборов» территория вновь присоединённых областей разбивалась на районы (уезды), поэтому каждая из оперативно-чекистских групп разбивалась на подгруппы, включающие по 7-12 оперативных работников для «обслуживания» закреплённых районов.

15 сентября 1939 г., за два дня до вступления Красной армии на территорию Западной Украины и Западной Белоруссии, органам госбезопасности УССР и БССР была направлена директива НКВД СССР, разъясняющая порядок действий спецгрупп. Приведём выдержки из этой директивы: «…По продвижении наших войск и занятии тех или иных городов будут создаваться временные управления (временный орган власти), в состав которых войдут руководители опергрупп НКВД. Работники НКВД всю свою работу должны проводить в теснейшем контакте с военным командованием и под руководством временных управлений. При выполнении специальных задач по обеспечению порядка, пресечению подрывной работы и подавлению контрреволюции опергруппы НКВД по мере продвижения войсковых частей должны создавать на занятой территории во всех значительных городских пунктах аппарат НКВД за счёт выделения из состава основной опергруппы НКВД небольших групп (численность в зависимости от важности конкретного пункта) с небольшим отрядом красноармейцев-пограничников. Выделенные опергруппы работников должны стать ядром будущих органов НКВД.

« Опергруппы НКВД должны провести следующие мероприятия.

1. Немедленно занять все учреждения связи: телеграф, телефон, радиостанции и радиоузлы, почты, поставив во главе органов связи надёжных людей.