2. Немедленно занять помещения государственных и частных помещений банков, казначейств и всех хранилищ государственных и общественных ценностей и взять на учёт все ценности, обеспечив их хранение.

3. Оказать всяческое содействие Политотделам армии и прикомандированным к ним работникам в немедленном занятии типографий, редакций газет, складов бумаги и в налаживании изданий газет.

4. Немедленно занять все государственные архивы, в первую очередь архив жандармерии и филиалов 2-го Отдела Генштаба (экс позитуры, пляцувок — органов разведки).

5. В целях предотвращения заговорщической предательской работы — арестуйте и объявите заложниками крупнейших представителей из помещиков, князей, дворян и капиталистов.

6. Арестуйте наиболее реакционных представителей правительственных администраций, руководителей местных полиций, жандармерии, пограничной охраны и филиалов 2-го Отдела Генштаба (воевод и их ближайших помощников, руководителей к/р партий — ППС — польской партии социалистов строжництво народове, национальной партии) бывших членов национал-демократической партии (стронництво праци христианской), демократической партии О.Н.Р. Аресты духовных лиц пока не производить, особенно католиков.

7. Занять тюрьмы, проверять весь состав заключённых. Всех арестованных за революционную и проч. антиправительственную работу освободить, использовав эти мероприятия для вербовки агентуры и проведения политработы среди населения. Организовать новую тюремную администрацию из надёжных людей, во главе с одним из работников НКВД, обеспечив строгий режим содержания арестованных.

8. Одновременно с проводимыми операциями, разверните следствие заключённых с задачей вскрытия подпольных к/р организаций, групп и лиц, ставящих целью проведения диверсии, террора, повстанчества и к/р саботажа. Лиц, изобличённых следствием в организации политических эксцессов и открытых к/р выступлениях, арестовывать немедленно.

9. Приступите к созданию агентурно-осведомительной сети с расчётом охватить в первую очередь государственный аппарат, к/р буржуазные помещичьи круги и политические партии. Особое внимание уделить быстрой организации осведомительной сети в редакциях газет, в культурно-просветительных учреждениях, продскладах, в штабах, рабочих гвардиях и крестьянских комитетах.

10. Принять меры к выявлению и аресту агентов-провокаторов жандармерии, политической полиции и филиалов 2-го Отдела Генштаба, использовав для этого также изъятый архив.

11. Обеспечить чёткую организацию охраны общественного порядка. Организовать надёжную охрану электрических станций, водопроводов, продовольственных складов, элеваторов и хранилищ горючего. Организовать борьбу с грабежами, бандитизмом, спекуляцией. Организовать работу по противопожарной охране, назначив нач. пожарных команд надёжных людей. Провести регистрацию и изъятие у всего гражданского населения огнестрельного оружия (нарезного), взрыввеществ и радиопередатчиков.

12. Опергруппам НКВД необходимо занять помещения, соответствующие требованиям работы НКВД. Для содержания подследственных арестованных организуйте внутренние тюрьмы, обеспечив их охрану и обслуживание.

13. В целях обеспечения безопасности и бесперебойности работы железнодорожного транспорта, работникам дорожно-транспортных групп НКВД на каждой крупной станции организовать агентурно-оперативную работу по борьбе с диверсией, шпионажем и контрреволюционным саботажем, проводя эту работу под руководством начальников опергрупп НКВД. Совместно с комендантом и комиссаром станции организуйте охрану станций, депо, ремонтных заводов, станционных складов, водокачек, желдормостов, путей и связи.

14. Конфискации фуража и продовольствия у населения избегайте. Необходимый фураж и продовольствие покупайте у населения за наличные в советских рублях, объявив населению, что стоимость (курс) рубля равняется стоимости (курсу) одного злотого». Народный комиссар внутренних дел СССР Берия».

(1 Нумерация мероприятий в документе изменена. Из текста документа опущены пункты, которые касаются организации и проведения оперативных мероприятий по пресечению шпионажа и террора, недопущению случаев диверсий и саботажа в промышленности и на транспорте, предотвращению провокационных действий, дестабилизирующих порядок и организованность в городах и населённых пунктах, занятых Красной армией.)

Таким образом, оперативно-чекистские группы должны были выполнять функции органов госбезопасности во вновь присоединённых областях Украины. Их штаб или временный центр управления должен был находиться в Тернополе с последующим переводом его во Львов.

Главными задачами групп являлась очистка занятой территории от социально опасных для новой власти элементов, к которым были отнесены представители знати (дворяне), крупные помещики и капиталисты, члены правительственной администрации, руководители отделений полиции, жандармерии, пограничной охраны и филиалов 2-го отдела Генштаба. В группу социально опасных элементов входили также руководители контрреволюционных партий, бывшие полицейские, агенты и осведомители польских спецслужб и «прочий антисоветский элемент». Основным мероприятием, которое должно было обеспечить «зачистку», являлось создание агентурно-осведомительной сети на занятых землях и налаживание агентурно-осведомительной работы. Деятельность спецгрупп сдерживалась острым дефицитом чекистских кадров. На второй день операции в спецдонесении на имя Л. Берии В. Меркулов докладывал о «бардаке» при передислокации войск, организации комендатур и катастрофической нехватке оперативных работников.

Помимо функций, обозначенных в директиве, оперативно-чекистским группам приходилось заниматься и другими делами, в частности, «работать» с военнопленными и националистами. Так, опергруппой в районе гг. Чертков, Коломыя, Печенежин, Косов, Снятый и Станиславов по состоянию на 27.09.1939 г. было арестовано 923 человека, в основном бывших полицейских и офицеров польской армии. Среди арестованных оказались и активные члены ОУН.

По состоянию на 28 сентября 1939 г. во Львове было арестовано 124 украинских националиста, а по 10 законченным следственным делам были расстреляны два человека. В донесении на имя Берии от 28 сентября 1939 г. о работе оперативно-чекистских групп на Западной Украине Меркулов сообщал: «…Арестовываем исключительно по материалам следствия и агентуры. Работа даёт удовлетворительные результаты…»

В донесении от 3.10.1939 г. на имя начальника секретариата НКВД Мамулова Меркулов и Серов подвели итоги работы спецгрупп за две недели. Они сообщали: «…общее количество арестованных оперативно-чекистскими группами по областям Западной Украины, по данным на 1-е октября включительно, составляет 3914 человек, в том числе бывших жандармов, полицейских, официальных и секретных агентов полиции и разведки — 2539 человек; помещиков, крупной буржуазии, бывших людей — 293 человека; офицеров польской армии и осадников — 381 человек; руководителей контрреволюционных партий УНДО, ОУН и других — 144 человека; петлюровцев, участников бандгруппировок — 74 человека; прочих — 483 человека».

Оперативно-чекистские группы были перегружены, и на территории Западной Украины стали создавать органы милиции. В донесении от 9.10.1939 г. Меркулов и Серов сообщают, что для организации милиции «…нами вызвано из Управления милиции УССР 255 человек, которых распределили по пунктам: Львов — 80 чел., Луцк — 60 человек, Тарнополь — 60 человек, Станиславов — 55 человек…». В донесении сказано также об организации «дружин рабочей гвардии» и налаживании работы милицейского аппарата — уголовного розыска, паспортных отделов и т. д.