14 мая 1941 г., вскоре после обращения Мешика, вышло Постановление ЦК ВКП(б) и СНК СССР № 1299-526сс «Об изъятии контрреволюционных организаций в западных областях УССР».

«Сов. секретно. Особая папка. В связи с усилением активности контрреволюционных "организаций украинских националистов (ОУН)" в западных областях УССР, выразившейся в вооружённых налётах оуновцев на сельсоветы, колхозы, убийствах сельских активистов, в целях решительного пресечения преступной деятельности оуновцев, нарушающих мирный труд колхозников западных областей УССР, Центральный Комитет ВКП(б) и Совет Народных Комиссаров Союза ССР постановляют:

1. Обязать органы НКГБ и НКВД Украины продолжить изъятие участников контрреволюционных оуновских организаций.

2. Арестовать и направить в ссылку на поселение в отдалённые районы Советского Союза сроком на 20 лет с конфискацией имущества: а) членов семей участников контрреволюционных украинских и польских националистических организаций, главы которых перешли на нелегальное положение и скрываются от органов власти; б) членов семей участников указанных контрреволюционных националистических организаций, главы которых осуждены к ВМН.

3. Органам НКГБ и НКВД усилить агентурно-оперативную работу, обеспечив хорошую организацию и проведение оперативных мероприятий. НКГБ и НКВД Украины направить в помощь своим местным органам в западных областях оперативных работников для быстрого выявления преследования и изъятия участников бандгрупп.

4. Войска НКВД Украины расквартировать отдельными подразделениями в наиболее поражённых бандитизмом районах западных областей УССР для использования их в борьбе с бандгруппами.

5. ЦК КП(б) Украины и Совнаркому Украины укрепить партийно-советские кадры районов западных областей УССР, поражённых бандитизмом.

6. Со всей строгостью применять приказ НКВД СССР о запрещении, без специального разрешения, хранения и ношения огнестрельного оружия, арестовывая и привлекая к уголовной ответственности лиц, у коих будет обнаружено оружие без разрешения.

7. Для организации борьбы с бандгруппами в западных областях Украины на основе настоящего Постановления командировать заместителя НКГБ СССР тов. Серова

8. Поручить НКВД и НКГБ СССР и Секретарю ЦК Белоруссии т. Пономаренко обсудить вопрос о проведении аналогичных мер по западной Белоруссии.

Секретарь ЦК ВКП(б) и Председатель Совнаркома СССР И. Сталин».

23 мая 1941 г., то есть через девять дней после выхода Постановления № 1299-526сс «Об изъятии контрреволюционных организаций в западных областях УССР», Меркулов сообщил в ЦК ВКП(б) и СНК СССР о завершении операции по выселению семей репрессированных или находящихся на нелегальном положении участников националистических организаций:

«…Докладываю вам, что операция по выселению семей репрессированных или находящихся на нелегальном положении участников контрреволюционных организаций в западных областях УССР, по данным на 22 часа 22 мая, закончена полностью. Всего по западным областям УССР было намечено к изъятию 3110 семей, или 11 476 человек. Изъято и погружено в вагоны 3073 семьи, или 11 329 человек. В том числе: во время операции в ряде мест опергруппам НКГБ-НКВД было оказано вооружённое сопротивление. В результате перестрелки было изъято 66 нелегалов, из них убито 7 человек и ранено 5 человек. Скрылось 6 нелегалов.

Из числа изъятых нелегалов захвачены: главарь банды, оперировавшей в Волынской области, Кирилюк; связной Черновицкого окружного провода ОУН Мартынюк; связная между Львовской окружной экзекутивой и Збаражской ОУН Кижик, которая занималась доставкой оружия. Кижик в течение полугода разыскивалась Львовским управлением НКГБ.

Во время операции изъято оружия: винтовок — 13, револьверов — 27, холодного оружия — 6, гранат — 4, патронов — 115 и контрреволюционной литературы — 200 экземпляров. Во время перестрелки с нелегалами убито участвовавших в операции 2 человека и ранено 3 человека.

По сообщению с мест на станциях погрузки зачастую собирались родственники и знакомые выселяемых, которым изъятые нелегалы с возмущением передавали, чтобы возвратились нелегалы, из-за которых они страдают. В Збаражском районе Тарнопольской области был выслан и вывезен на станцию погрузки старик Ястребовский, сын которого находился на нелегальном положении. Нелегал Ястребовский, узнав, что отец выслан, явился на станцию и, рассказав о том, что перешёл на нелегальное положение, в присутствии родственников и знакомых начал просить об оставлении отца, а сам обещал искупить свою вину. Семья Ястребовского освобождена. Когда старик выходил из вагона, выселяемые кричали ему вслед: "Передайте и нашим подлецам, чтобы немедленно явились, пока нас ещё не вывезли". Аналогичные случаи имели место и по другим областям».

Однако одной депортации Меркулову показалось недостаточно. За сутки до начала войны, 21 июня 1941 г., директивой НКГБ СССР № 126 «О мероприятиях по пресечению террористической деятельности контрреволюционных элементов в западных областях Украины», Меркулов предложил Народному комиссариату госбезопасности УССР:

«1. Подготовить совместно с органами Наркомвнудела действенные мероприятия по пресечению террористической деятельности контрреволюционных элементов в западных областях Украины, в первую очередь среди оуновцев.

2. Срочно подобрать и подготовить материалы для проведения новой массовой операции по аресту и выселению контрреволюционного, антисоветского и социально чуждого элемента в западных областях УССР. Врагам, ведущим подрывную работу против советской власти, должен быть нанесён жёсткий и правильный удар, долженствующий внести необходимое спокойствие и безопасность для трудящихся этих областей. Немедленно телеграфируйте, к какому сроку указанная операция может быть вами подготовлена, а также ориентировочно о количестве лиц, могущих быть изъятыми, с разбивкой их на категории».

Однако планам Меркулова не суждено было сбыться. Началась война.

В начальный период войны в распоряжение Службы безопасности ОУН попали совершенно секретные документы НКВД СССР и, в частности, инструкция Государственного политического управления Украинской ССР (ПТУ УССР) «по организации информационно-осведомительных сетей», опубликованная американским исследователем Джефри Бурдсом.

Инструкция была разработана отделом информации и политконтроля (ИНФО) Секретно-оперативного управления Харьковского ГПУ в 1930 г. Все её экземпляры были пронумерованы. Она содержала рекомендации по организации агентурной сети в регионе и была официальным документом, регламентирующим эту деятельность на территории Украины. Очевидно, этот документ и служил методической основой при формировании агентурных сетей на Западной Украине. На его основе руководители оуновского подполья позднее разрабатывали свои инструкции по разоблачению агентуры МВД-МГБ.

Приведём выдержки из этого уникального документа. Один из его разделов посвящён организации работы районных уполномоченных ГПУ. Отмечено, что основной обязанностью уполномоченного является «Руководство осведомлением (агентурой), резидентурой, спецосведомлением, предварительный подбор действующих и запасных резидентов и контрольного осведомления».