Первая такая попытка, предпринятая в августе 1918 г., сыграла положительную роль, но это было все же половинчатое решение (введен принцип двойного подчинения, каждое из специальных формирований оставалось в своем ведомстве). Потребовалась более радикальная реформа.

28 мая по Постановлению Совета Рабоче-Крестьянской Обороны произошло объединение большей части этих формирований и создание войск внутренней охраны Республики (ВОХР) с подчинением их отныне одному ведомству — Народному комиссариату внутренних дел.[19] Наркомом к этому времени уже был Ф. Э. Дзержинский, сохранявший одновременно пост председателя ВЧК.

В войсках ВОХР высшим должностным лицом являлся начальник войск К. М. Валобуев. Сменивший его с 16 апреля 1920 г. В. С. Корнев был уже заместителем народного комиссара внутренних дел по управлению войсками ВОХР, начальником войск ВОХР. Статус начальника войск повысился: он занимал теперь должность замнаркома.

Согласно Постановлению Совета Труда и Обороны о войсках внутренней охраны Республики от 21 апреля 1920 г., «все войска, выделенные в распоряжение Наркомвнудел, находятся в непосредственном подчинении его заместителю по управлению войсками ВОХРа, который является начальником войск».[20]

Но в то же время, как сказано в Положении о войсках внутренней охраны: «Прямое высшее подчинение и общее руководство ВВО принадлежит Наркомвнудел через Военный совет ВВО» (ст. 13).[21]

На последнем этапе Гражданской войны происходит новая крупная реорганизация внутренних войск. Совет Труда и Обороны 1 сентября 1920 г. постановил: «Для успешного выполнения всех задач, возложенных на войска ВОХР постановлением Совтрудобороны от 21 апреля сего года, все войска, имеющие назначением охрану, поддержание порядка и обеспечение выполнения распоряжений правительства, т. е. караульные, желдоробороны, желдормилиции, водмилиции и т. д., как на фронтах, так и в тыловых округах, объединить с войсками ВОХР в один общий вид войск внутренней службы…».

Далее было определено, что «Наркомвнудел управляет работой войск внутренней службы через командующего войсками внутренней службы», который «непосредственно подчиняется Наркомвнудел и Главкому».[22]

Таким образом, впервые во внутренних войсках появляется должность командующего войсками. Им стал В. С. Корнев. По должности он входил в состав коллегии ВЧК. Не случайно оговорено, что комвойсками ВНУС подчинен не только наркому внутренних дел, но и главнокомандующему всеми вооруженными силами Республики (главкому). В то время этот пост занимал С. С. Каменев.

Такое положение предоставляло большие полномочия В. С. Корневу.

Численность войск ВНУС по сравнению с первоначально установленной при создании войск ВОХР (120 тыс.) увеличилась более чем в два раза.

Эта реформа сблизила внутренние войска с Красной Армией, дала экономию сил и средств, позволила эффективнее использовать войска для ликвидации бандитизма на местах.

В то же время реформа носила промежуточный характер. Завершение Гражданской войны неизбежно должно было привести к сокращению войск, изменению объема выполняемых ими задач.

Постановлением СТО от 19 января 1921 г.[23] войска ВНУС, за исключением войск чрезвычайных комиссий, железнодорожной и водной милиции, передавались в военное ведомство (в дальнейшем резко сокращены), оставшиеся контингенты составили войска ВЧК.

В Основных положениях организации войск ВЧК от 29 января 1921 г. говорилось: «Войска ВЧК во всех отношениях подчиняются председателю ВЧК, который управляет ими через командующего войсками ВЧК Республики, являющегося в то же время членом коллегии ВЧК» (ст. 2).[24]

Однако в марте 1921 г. эта должность упраздняется и восстанавливается должность начальника войск (приказ ВЧК № 61 от 25.03.1921 г., приказ войскам ВЧК от 28.03.1921 г.).

Спустя некоторое время издается Положение об организации войск ВЧК от 10 июля 1921 г., в котором этот вопрос трактуется следующим образом:

«Войска ВЧК во всех отношениях подчиняются председателю ВЧК, который руководит ими через начальника Управления войск ВЧК» (§ 9).[25] Непосредственный руководитель войск теперь именуется начальником Управления (не командующим) и теряет статус члена коллегии ВЧК.

В то же время повышается роль и ответственность в деле руководства войсками председателя ВЧК (с февраля 1922 г. — Государственного политического управления при НКВД РСФСР). Титул командующего переходит к нему.

Характерным для того периода явлением была частая смена декораций. Не успели принять одно решение, как тут же следует новое об очередной реорганизации. Эта перестроечная лихорадка продолжалась почти два года. Она была вызвана изменением общеполитической обстановки, переходом от войны к миру, необходимостью приспособиться к новым условиям, поиском наиболее целесообразных решений. Возможно, здесь играло роль и то обстоятельство, что после ухода В. С. Корнева на первых порах не нашлось фигуры для равнозначной замены. Хотя в это время во главе войск смогли побывать достаточно колоритные личности (Розен, Студеникин, Патаки), но они командовали войсками недолго и не успели проявить в должной мере свойственный им организаторский талант, реализовать свои возможности. Однако даже за короткий срок каждый из них внес что-то новое, интересное, полезное. М. И. Розен был инициатором создания отряда ОСНАЗ (прообраз современного спецназа); П. К. Студеникин предложил преобразовать этот отряд в дивизию (проект был осуществлен спустя три года); Ф. В. Патаки, будучи начальником отдела борьбы с бандитизмом и начальником Управления войск ВЧК — ГПУ, успешно исполнял обе должности, провел реорганизацию войск в связи с их сокращением, был одним из разработчиков проекта о создании Отдельного пограничного корпуса.

Появление на командном олимпе Э. С. Кадомцева, выступившего с интересными инициативами, способствовало росту авторитета начальника войск, внесло в жизнь войск свежую струю полезных преобразований. По его инициативе коллегия ГПУ 26 июля 1922 г. приняла постановление, согласно которому начальник Управления войск ГПУ стал именоваться начальником войск. Была изменена структура управления войсками, она приобрела общевойсковую форму организации. Управление становится Штабом, реорганизации подверглись и периферийные органы войскового управления. Кадомцеву не удалось вернуть титул командующего начальнику войск. Командующим войсками ГПУ считался председатель ГПУ или его заместитель, в округах командующими войсками округа были полномочные представители ГПУ.