Первые волнения вспыхнули в Ходженте 3 июля, 7 июля перекинулись на Ташкент. 13-го в Джизаке убили уездного начальника полковника Рукина. 18 июля Туркестан был объявлен на военном положении, генерал-губернатором стал Куропаткин.

Восстание в Ферганской долине было подавлено быстро. Немалую роль сыграла беспощадная карательная экспедиция в Джизак. Земли местных жителей Куропаткин в наказание объявил конфискованными. Оседлое население проще покорить. Но вскоре возмутились кочевники, и восстание приняло много больший размах.

С обеих сторон были отмечены случаи чудовищной жестокости. Счеты к русским, которые копились десятилетиями, были предъявлены. Особенно много крови пролилось в киргизских волостях Семиречья. Верный оказался в осаде. Села переселенцев и казачьи станицы подвергались нападениям. Например, в селе Кольцовка из 650 жителей в живых осталось 35. В отместку поселенцы начали убивать мусульман. В Беловодье армия собрала пленных киргизов, а гражданские набросились на них с вилами и топорами, перебив 517 человек. Уцелевших повели в Пишпекскую тюрьму, но закололи по дороге… Когда русские солдаты входили в сожженные деревни и видели растерзанные трупы женщин и детей, они отвечали такими же зверствами. И уже нельзя было вспомнить, кто начал первым…

К восстанию присоединились и другие народы. В селении Аксу киргизы ограбили и убили до полутысячи кашгарцев. А в Пржевальске русские отомстили дунганам за зверскую жестокость в отношении православных: из полутора тысяч дунган уцелело лишь восемь человек.

Казахи не остались в стороне, тем более что сохранившаяся у них племенная основа позволяла быстро собрать большие силы. Город Тургай осадили повстанцы под командованием Амангельды Иманова и Абдугаппара Жанбосынова. Они выдерживали бои с армейскими подразделениями до февраля 1917 года.

Тогда же Куропаткин подвел итоги кровавых событий. По сообщенным им в Петроград официальным данным, в одной только Семиреченской области погибло 2325 русских и 1384 пропало без вести. Сколько при этом погибло мусульман, историки спорят до сих пор. Точного учета коренного населения налажено не было. А многие казахские аулы откочевали в Китайский Туркестан. Но, судя по всему, счет погибшим превысил сто тысяч. Большая часть этих жизней формально не на совести русских солдат. Люди ушли зимой в горы, неподготовленные, без припасов. Скот пал. В Китае никто не ждал новых поселенцев, для них не было ни свободной земли, ни занятий. Кочевые калмыки, например, первым делом обобрали пришлецов. А когда пропал скот, начали умирать и люди.

В Тургае казахские представители во главе с Алиханом Букейхановым с согласия губернатора пытались примирить стороны. Они предложили временно приостановить призыв, уточнить списки, оставить в каждой семье не менее одного работника, освободить от работ мулл и учителей. Все эти разумные меры не были приняты властями.

В конце концов восстание 1916 года было подавлено армейскими частями при участии переселенцев. Случившееся обратили против туземцев и в наказание конфисковали земли бежавших в Китай. Но планам перелицевать карту наделов помешал февраль 1917 года. Временное правительство объявило амнистию для участников восстания, и бежавшие в Китай могли бы вернуться. Однако это оказалось непросто. Например, русское население Пржевальского уезда было категорически против возвращения дунган села Мариинского. Те замарали себя во время мятежа особыми зверствами, и власти опасались новой вспышки насилия…

Как бы то ни было, Февральская революция остановила взаимное истребление. В июле 1917 года на Первом Всеказахском съезде была основана партия Алаш. Она ставила задачей добиться автономии казахов. Лидеры партии прежде были кадетами, и стояли за демократические ценности. Они предложили объединить в национальную автономию все земли, на которых казахское население является господствующим. Остальным народностям гарантировались права меньшинства. Автономия должна была войти в Российскую демократическую федеративную республику на равных с другими.

Второй съезд в декабре 1917 года так и сделал: объявил создание Автономии казахских областей под названием Алаш. Было учреждено временное правительство Алаш-Орда. Из 25 мест в нем 10 отдали русским и представителям других народностей, живущих среди казахов. Во главе Алаш-Орды встали политические лидеры: А. Букейханов, А. Байтурсынов и М. Чокаев (Шокай). Однако автономия оказалась зажата между двумя враждующими силами: Советской властью и правительством Колчака. Ни те, ни другие не собирались признавать право казахов на самоопределение. Тем более что земля — ключевой ресурс — была объявлена собственностью только казахского народа.

В результате Алаш долго не протянул. Его правительство пыталось лавировать между молотом и наковальней. Часть военных сил влилась в войска Колчака и Дутова. В октябре 1919 года с приходом Красной Армии автономия была ликвидирована, ее вожди получили амнистию и в большинстве своем отошли от политической деятельности. Некоторые эмигрировали. Те, кто остался, выбрали разные стороны. Одни были за сотрудничество с Советской властью, другие — против. Казахстан вошел в СССР — федерацию ленинско-сталинского типа без каких-либо признаков демократии. В конце тридцатых годов все лидеры Алаша, кто не уехал, были репрессированы.

Погиб и Снесарев. Андрей Евгеньевич был арестован в 1930 году по сфальсифицированному ОГПУ делу «Весна». Его обвинили в создании контрреволюционной организации и дали 10 лет лагерей. Снесарев прошел СвирьЛАГ, Соловки. Тяжелобольного узника освободили досрочно в 1934 году — умирать. Он и умер в больнице спустя три года. Могила выдающегося русского офицера А.Е. Снесарева находится на Ваганьковском кладбище.