Линкольн распорядился создать военное управление в Аннаполисе (столице Мэриленда) во главе с полковником Бенджамином Батлером, который обратился к населению с воззванием, объявлявшим, что любые нарушения закона и порядка будут подавляться силой оружия[1587].

Поскольку федеральные власти подозревали, что в Мэриленде сторонники сецессии готовы присоединиться к Конфедерации, новый командующий федеральными войсками с июля 1861 г. Джордж Макклелан санкционировал аресты лидеров оппозиционной демократической партии как «военную необходимость». Был приостановлен выпуск некоторых газет, подозреваемых в симпатиях к южанам. Приостановка действия Habeas Corpus вызвала протесты противников Линкольна, к которым присоединился председатель Верховного суда США Роджер Тэйни, назначенный еще Э. Джексоном. В это время он проживал в Мэриленде, и к нему обратились адвокаты арестованного 25 мая 1861 г. по подозрению в измене жителя Балтимора, сторонника сецессии Джона Мэрримэна[1588].

Тэйни потребовал, чтобы Мерримэн и офицер, производивший задержание, предстали перед ним для установления «причин, если таковые имеются, для ареста и задержания»[1589]. Однако военный командир Джордж Кэдвалладер, производивший арест, отказался явиться к судье, заявив, что ему необходимо время для получения инструкций от своего начальства. Он также заявил, что общественная безопасность находится под угрозой и «те, кто не желают сотрудничать с властями, создают болезненные проблемы, их. позиция увеличивает наши затруднения». Тэйни объявил, что Кэдвалладер поступил незаконно и он будет добиваться освобождения Мэрримэна. Он резко осудил введенное военными властями понятие произвольного ареста, выступил в защиту гражданских свобод и отметил, что только Конгресс имеет право приостановить действие Habeas Corpus. В то же время он признал, что практически ничего не может сделать для обеспечения права личной неприкосновенности «перед лицом военной силы, слишком могущественной, чтобы ее можно было преодолеть». Генеральный прокурор Э. Бэйтс выступил в поддержку президента. «Он заявил, что все три ветви власти должны действовать скоординировано. Президент является защитником конституции. Обязанность именно президента подавить мятеж, поскольку суды слишком слабы для этого»[1590].

Верховный суд в целом поддержал администрацию в деле Мерримэна. Тэйни не удалось добиться рассмотрения дела в местном суде, и он обратился к Линкольну с длинным посланием, в котором прямо указывал, что президент нарушает законы и Конституцию страны. В нем он заявил, что президенту не хватает «должного уважения к высокому посту, который он занимает. Он, конечно же, обязан верно исполнять законы; если же он берет на себя законодательную власть путем приостановления действия приказа Habeas Corpus и вмешивается в дела судебной власти путем арестов и тюремного заключения лиц без надлежащей правовой процедуры, то этим самым он превышает свои полномочия» [1591].

Ответ Тэйни содержался в послании президента Конгрессу 4 июля 1861 г., где говорилось: «Вскоре после первого призыва добровольцев был признано целесообразным дать право главнокомандующему в определенных ситуациях приостанавливать действие Habeas Corpus, или, говоря иначе, арестовывать и содержать в заключении без соблюдения обычной законной процедуры лиц, угрожающих общественной безопасности. Неужели не лучше нарушить один закон, нежели допустить уничтожение всех законов и гибель страны?»[1592] Тем не менее, на внеочередной сессии Конгресса чрезвычайные меры президента не встретили полного одобрения конгрессменов. Резолюция, предлагавшая узаконить единоличные действия президента, предпринятые им в исключительных военных обстоятельствах, была отложена на неопределенное время.

В августе 1861 г. обстановка в Мэриленде нормализовалась. В мае того же года Линкольн отдал распоряжение ввести федеральные войска в небольшой виргинский городок Александрия, находящийся в 8 милях южнее Вашингтона. Поскольку он имел важное стратегическое положение, то в течение всей войны находился по существу на военном положении. Введение федеральных войск в штаты Кентукки и Миссури также способствовало укреплению в них позиций сторонников Союза[1593].

События, приведшие к жертвам среди гражданского населения, произошли в пограничном штате Миссури. Здесь капитан федеральных войск Натаниэл Лайон решил арестовать 700 ополченцев-южан. Когда арестованных вели через Сент-Луис, собравшаяся стихийно толпа начала забрасывать солдат камнями. Один из камней попал в офицера, и солдаты открыли огонь. В завязавшейся перестрелке были убиты 28 горожан и 2 солдата, число раненых не было установлено. Столкновения продолжались и на следующий день[1594]. По мнению историка Джеймса Макферсона, Лайон разворошил осиное гнездо. Солидные территории пограничного штата Миссури превратились в «ничейную территорию», на которой совершались «партизанские рейды» южан-конфедератов, совершались поджоги, грабежи и убийства. Вожаки Уильям Куонтрилл, «Кровавый Билл» Андерсон, Джордж Тодд приобрели известность бандитов с большой дороги[1595]. Фактически Миссури до конца войны управлялся временной администрацией.

После первого поражения при Манассасе в июле-августе 1861 г. Конгресс принял закон о наказаниях за выступления против правительства (Акт о заговорах). На Севере приостанавливалось действие законов о неприкосновенности прав личности. Сам президент в послании чрезвычайной сессии обеих палат Конгресса 4 июля 1861 г. заявил: «Вскоре после первого призыва ополченцев власти сочли своим долгом разрешить командующему генералу в надлежащих, по его разумению, случаях приостанавливать действие привилегии судебного приказа о неприкосновенности личности — или, иными словами, арестовывать и удерживать под стражей, не прибегая к обычным законным процедурам, лиц, которых он посчитает опасными для общества»[1596]. С 24 сентября 1862 на всей территории США проводились аресты подозрительных лиц (до 38 тыс. чел.). Правительство Линкольна приняло ряд жестких мер: было закрыто несколько газет, прекращена деятельность ряда антиправительственных обществ, произведены аресты наиболее активных сторонников рабовладения.