В Зимнем дворце был назначен «большой выход с благодарственным молебствованием». Скобелев был произведён в генералы от инфантерии и получил орден Георгия 2 степени.

Д. А. Милютин записал, что овладение Геок-Тепе «несомненно, поправит наше положение не только в Закаспийском крае, но и в целой Азии» (187, т. 4, с. 17). Было совершенно ясно, что на сей раз в роли неудачника оказался Джон Буль, потерпевший ряд поражений в Афганистане и Южной Африке.

С окончанием военных действий и постепенным возвращением в свои дома бежавших в пустыню жителей 6 мая 1881 г. Ахалтекинский оазис был включён в Закаспийский военный отдел, преобразованный в Закаспийскую область в составе Туркестанского генерал-губернаторства. Административным центром области стал Асхабад. Первым начальником области был назначен генерал Рерберг (171а, с. 166).

Желая ослабить впечатление от учинённого в Геок-Тепе разгрома, Петербург объявил о прощении туркменских патриотов, сражавшихся в оазисе. Туркмены получали землю, одежду, продовольствие, им оказывалась медицинская помощь.

Серьёзное внимание было уделено привлечению на сторону Российской империи феодальной знати. Отдельные представители племенной верхушки получили звание офицеров местной «милиции». Пятеро из них во главе с Дыкма Сердаром прибыли в Петербург в качестве делегации туркестанских старшин и были тепло приняты царём и военным министром.

После образования Закаспийской области свою независимость сохраняли лишь племена Тедженского, Мервского и Пендинского оазисов.

На часть этих территорий претендовал иранский шах, войска которого нападали на селения туркмен, разрушали ирригационные сооружения, отводили воду с полей. Лондон поддерживая притязания Персии на туркменские земли, в частности на Мерв, стремясь создать из него «независимое» государство под протекторатом Афганистана или Ирана, с тем чтобы стать его фактическим хозяином. Пресса особенно подчёркивала роль Мерва для защиты Индии. Как и в других крупных городах Средней Азии, жители Мерва не были единодушны в вопросе о политической ориентации. Большая его часть, преимущественно трудящаяся, стремилась к прекращению кровопролитных войн, к сближению с Россией. Меньшая, прежде всего родоплеменная верхушка и мусульманское духовенство, противилась ориентации на Россию. Отсутствие согласия среди населения было использовано недругами России. Они возбуждали антирусские настроения, доставляли в Мерв английское оружие и боеприпасы. Однако эти усилия успеха не имели. Взятие Геок-Тепе предопределило судьбу всей Туркмении. В январе 1884 г. на Собрании народных представителей Мервского оазиса, расположенного по течению реки Мургаба, было принято решение о добровольном присоединении оазиса к России (312, с. 145). Участвующий в обсуждении влиятельный Махтумкули-хан от имени всех присутствующих заявил, что «мервский народ безусловно принимает русское подданство… и для управления собой желает иметь русского начальника» (309, с. 149). Город был принят в русское подданство: ему предоставлялось внутреннее самоуправление, запрещались рабство и работорговля. В марте 1884 г. в Мерве (Мары) расположились царские войска. Великобритания «рассматривала Мерв как стратегический пункт, с которого можно угрожать Афганистану и Индии», — писал министр иностранных дел Н. К. Гирс в своём отчёте царю (39, 1884 г., л. 71).

К 1885 г. в состав России добровольно вошли Атрек, Теджен и Пендинский оазис. В 1882 г. на территории Туркмении была образована Закаспийская область в составе Кавказского наместничества. В 1890-1897 гг. она находилась в непосредственном ведении Военного министерства, затем была включена в Туркестанское генерал-губернаторство. Завоевание Средней Азии было закончено в 1885 г.

В первой половине 1885 г. Российская империя пребывала в тревожном состоянии ожидания войны с Англией из-за афганского вопроса. После присоединения к России в 1884 г. района Мерва возник острый англо-русский конфликт, связанный с так называемым афганским разграничением. Для установления чётких границ между Россией и Афганистаном была создана англорусская комиссия. Петербург ещё в 1882 г. предложил Лондону установить афганскую границу на основании этнографического и географического принципов. Пока шли переговоры об отправлении русского комиссара, афганские отряды выдвинулись к северу и заняли оазис Пенде между реками Кушкой и Мургабом. В ответ на это русский отряд был двинут к реке Кушке. Оба правительства согласились остановить дальнейшее движение отрядов (4 и 5 марта). Невзирая на это, по настоянию англичан в марте 1885 г. афганские войска переправились через Кушку с целью захватить при разграничении возможно больше спорных территорий. 18(30) марта в районе моста Таш-Кепри между русским отрядом генерала А. В. Комарова (1500 человек) и афганским подразделением (2600 всадников и 1900 пехотинцев) произошло вооружённое столкновение. Афганский отряд был разбит и рассеян, потеряв до 500 человек убитыми, всю артиллерию (8 орудий), два знамени и весь лагерь с запасами и обозом. Обгоняя отходивших афганцев, в паническом страхе бежали их британские советники.

У нас оказались убитыми 1 офицер и 10 нижних чинов, ранеными 33 человека. Конфликт послужил поводом для усиления военных приготовлений в Англии. Лондон враждебно относился к политике России в Средней Азии, поскольку она подрывала влияние Британии в Афганистане и Индии. В Туманном Альбионе было призвано 70 тыс. резервистов и вооружались отряды милиции. 27 апреля Гладстон потребовал от парламента 6,5 млн фунтов стерлингов на вооружение против России (193, с. 377). По выражению Ленина, «Россия была на волосок от войны с Англией» (176, т. 28, с. 668). Сообщение о конфликте застало эмира Афганистана Абдурахман-хана в индийском г. Равалпинди, куда он был приглашён для встречи с вице-королём Дефферином, который подарил ему 10 лакхов рупий (1 лакх равен 100 тыс.), 20 тыс. ружей, 3 артиллерийские батареи и различное военное снаряжение. Англия всеми способами старалась втянуть Афганистан в войну против России. Эмиру представляли искажённые сведения о столкновении в районе Кушки, требовали его согласия на немедленный ввод в Афганистан британских войск. Но Абдурахман-хан категорически отказался от каких-либо действий, которые могли привести к обострению отношений с Россией (332, с. 368).

Завязывая конфликт, Джон Буль рассчитывал воевать против России на суше (в Закавказье) турецкой кровью. Он добивался пропуска английского флота в Чёрное море. Предполагалось высадить десант на Кавказском побережье и провести морскую диверсию против Одессы. Планировалось также нападение на Владивосток. Следует признать, что Россия в то время была почти безоружна не только на Дальнем Востоке, но и на Чёрном море. Хотя известно, что в сентябре 1881 г. на особом совещании под председательством Александра III было принято решение приступить к сооружению Черноморского флота, значительно превосходящего турецкий. Однако к 1885 г., когда разразился англо-русский конфликт, первые русские черноморские броненосцы только что были спущены на воду и до их вступления в строй было далеко.

Несмотря на продолжающиеся переговоры между Англией и Россией британский лев демонстративно пытался запугивать нас своими воинственными мерами. Собирались войска для отправки в Индию, парламент единогласно проголосовал за 11 млн фунтов стерлингов на военные расходы, заговорили о занятии британцами острова Гамильтон в Японском море, о переговорах с Портой относительно пропуска в Чёрное море английского флота и т. д.