Реализация органами «СМЕРШ» и командованием того же Северо=Западного фронта комплекса мер по борьбе с изменой Родине привела к положительным переменам. 10 октября 1943 года начальник фронтового контрразведывательного управления сообщал ГУКР о том, что «изменнические проявления» в частях фронта значительно сократились. Так, если в июне, сообщалось в этом докладе, к противнику перешли 10 человек, в июле — 4, то в сентябре только 227; в момент перехода через линию фронта в мае задерживались 15 человек, в июле — 828. Снизилось и количество арестованных за изменнические намерения. В мае, например, по этой причине всего по фронту было арестовано 97 военнослужащих, а в сентябре — 1129; в июне в войсках фронта было учтено «активного изменнического элемента», т. е. перешедших к врагу, уничтоженных при попытке перехода и арестованных за подготовку измены 99 человек, в августе — 42, в сентябре же — 1730.

Еще одним особо опасным видом воинских преступлений, с которым контрразведка «СМЕРШ» вела бескомпромиссную борьбу, было дезертирство. Под дезертирством принято понимать самовольное оставление военнослужащим своей части или места службы с целью уклонения от участия в боевых действиях или дальнейшего несения службы.

Как явствует из документов, работа УКР «СМЕРШ» фронтов в этой сфере велась по трем направлениям: информирование командования о состоянии дисциплины в частях, оперативные мероприятия по обнаружению намерений военнослужащих покинуть свою часть, организация заградительных мероприятий с целью недопущения случаев самовольного ухода военнослужащих в тыл. Главной причиной дезертирства «смершевцы» Северо-Западного фронта считали «нежелание служить в Красной армии из-за трусости».

Ведущая роль в борьбе с дезертирством отводилась заградительным мероприятиям, т. е. задержанию и тщательной проверке всех военнослужащих, появлявшихся в полосе фронта вне состава своих подразделений, следовавших в тыл, а также бойцов и командиров, в одиночку или группами передвигавшихся по тыловым дорогам фронта. Несли заградительную службу комендантские команды, войска НКВД, взводы и роты охраны «СМЕРШ». Для прочесывания лесов, задержания дезертиров на дорогах и железнодорожных станциях создавались подвижные заградотряды, куда были включены оперативные работники контрразведки. Они имели право задержания и предварительного расследования с дальнейшей передачей задержанных «по подсудности». Заградотряды Северо-Западного фронта выполняли большой объем работы. Только с мая по июль 1943 года они задержали 5815 подозрительных лиц, из которых 5333 человека были направлены в воинские части, 194 арестованы, а остальные переданы прокуратуре, органам НКВД или препровождены на сборно-пересыльные пункты для проверки. Однако анализ задержаний позволил контрразведчикам сделать в июне того же года вывод о том, что существовавшая на Северо-Западном фронте система заградительной службы была недостаточно эффективной.

В апреле — июне из состава фронта были выведены и переброшены на другие участки 11,27, 53 и 68-я армии. Интенсивное передвижение большой массы войск и техники осложняло работу заградительной службы и увеличило число каналов проникновения дезертиров в тыл. Так, в результате опроса задержанных дезертиров из числа среднего командного состава было установлено, что проезд от линии фронта в тыл практически свободен, так как из-за огромного потока транспорта на контрольно-пропускных пунктах документы тщательно не проверялись. Как правило, их спрашивали только у водителей, а тех, кто находился в кузове, «проверяли» лишь вопросами: «У всех имеются документы?» или «Это ваши люди?» и т. п… Получив утвердительный ответ, контролеры отправляли машины дальше.

Эффективность заградительных мер существенно снижалась из-за того, что занимавшиеся проверкой военнослужащие часто не знали правил заполнения документов и порядка передвижения командированных, не проявляли должной требовательности. По оценке «СМЕРШа», отсутствовал контроль за пассажирами поездов, курсировавших по железнодорожным магистралям Северо-Западного фронта, вследствие чего «проезд военнослужащих в поездах без билетов и предварительной проверки документов… создает дезертирам и проходимцам условия для быстрого и беспрепятственного продвижения».

Отмечали контрразведчики и характерные особенности действий различных групп дезертиров. Так, рядовые солдаты, дезертировавшие без документов, пробирались в тыл глухими проселочными дорогами, обходя посты заградотрядов. Лица же начальствующего состава, дезертировавшие из частей, обычно пытались открыто пользоваться транспортом, изображая командированных по спецзаданиям. У этого вида дезертиров, как правило, были поддельные командировочные предписания, продовольственные аттестаты и чистые бланки с печатями. Например, у задержанного старшего техника-лейтенанта Каратаева при обыске было обнаружено 15 командировочных предписаний с подчищенными датами и несколько чистых бланков.

Обозначившиеся каналы проникновения в тыл могли быть использованы не только дезертирами, но и агентурой немецкой разведки. Поэтому органы «СМЕРШ» стремились сделать все возможное, чтобы перекрыть эти каналы. Оперативные группы фронтовой контрразведки постоянно работали в прифронтовых городах: Демянске, Валдае, Осташкове, Крестцах. Наряду со своей основной задачей — задержанием агентуры противника они проводили мероприятия по задержанию пытавшихся укрыться в тылу дезертиров. Было сформировано еще 5 оперативно-розыскных групп, которые курсировали по железным и грунтовым дорогам фронта и с 1 мая по 20 июня 1943 года в ходе проверки документов у военнослужащих задержали в общей сложности 1915 человек, в том числе 134 дезертира, а в июне — июле было задержано 800 лиц, из которых 58 тоже оказались дезертирами.

В июле 1943 года контрразведывательное управление «СМЕРШ» Северо-Западного фронта представило военному совету перечень выявленных недостатков, способствовавших «совершению самого факта дезертирства» и продвижению дезертиров от передовой линии фронта в тыл. К этим недостаткам были отнесены: нарушение режима военного времени на транспорте и в населенных пунктах прифронтовой полосы, «медлительность введения в действие» приказов командующего фронтом, «самоустранение» гарнизонов тыловых частей от несения заградительной службы, беспорядочное движение по дорогам команд и групп военнослужащих, беспечность в хранении различного рода документов, бланков и печатей. В связи с перечисленным предлагалось осуществить ряд мероприятий по повышению надежности заградслужбы: ввести обязательное для всех гарнизонов несение этой службы на перекрестках проселочных дорог подходах к крупным населенным пунктам, потребовать от штабов строгой отчетности за использование командировочных документов, ввести единые образцы командировочных предписаний. Кроме того, по мнению контрразведчиков, следовало для наведения порядка и проверки документов высылать патрули на железнодорожные станции из расположенных поблизости воинских частей, практиковать поголовную одновременную проверку документов у пассажиров в поездах.

Некоторое затишье на фронте позволило армейскому командованию и военной контрразведке Северо-Западного фронта уделить значительное внимание развитию системы заградслужбы. К этому подталкивала и активизация германской разведки, которая пыталась определить силы и возможности фронта. Оперативные группы «смершевцев» сумели выявить значительное число «осевших» и легализовавшихся дезертиров, которым удавалось прежде благополучно проходить через все проверки. Так, в Вышнем Волочке опергруппой «СМЕРШ» был задержан человек, назвавший себя старшим лейтенантом Титовым. Проверкой было установлено, что все его документы — липа. Титов в ноябре 1941 года дезертировал из коммунистической роты 31-й армии, раздобыл чистые бланки, печать и сфабриковал себе новые документы. Он поселился в Вышнем Волочке и, пока его сослуживцы бились за Родину, занимался спекуляцией, периодически выезжая за товарами в Москву, вел разгульный образ жизни. До встречи с группой «СМЕРШ»