Большая работа проводилась органами госбезопасности по контрразведывательной защите экономики от диверсионных акций германских и японских спецслужб, в том числе и с использованием бактериологического оружия.

На органы госбезопасности были возложены также контроль за технологическим состоянием промышленных, прежде всего оборонных объектов, эффективностью их деятельности, выявление причин невыполнения планов, выпуска некачественной продукции и т. п. Ими было налажено систематическое информирование по этим вопросам партийных и государственных инстанций разного уровня.

В 1939–1940 гг. пограничные войска были выдвинуты на линию новой государственной границы. Кроме того, они охраняли зону заграждения по линии старой границы, участвовали в поддержании режима безопасности на присоединенных территориях, вели борьбу с бандитскими и диверсионно-террористическими формированиями.

Пограничные войска активно добывали разведывательную информацию о военных приготовлениях фашистской Германии, задерживая и выявляя вражеских агентов среди нарушителей границы. Масштабы этой работы и ее результаты видны из приведенных в спецсообщениях НКВД СССР в ЦК ВКП(б) и СНК СССР данных о нарушениях государственной границы СССР со стороны Германии с ноября 1940 г. по 10 июня 1941 г.

Возрастание военной опасности и предпринимавшиеся Политбюро ЦК ВКП(б) и советским правительством в связи с этим меры требовали изменений и уточнений мобилизационных планов. 25 сентября 1939 г. был издан приказ НКВД СССР о разработке агентурно-оперативных мероприятий на военное время и составлении оперативно-мобилизационных планов[161]. Особенно активно эта работа развернулась с лета 1940 г., когда стали выявляться многочисленные факты подготовки Германии к агрессии против СССР. Разработка мобилизационных планов осуществлялась также в органах государственной безопасности и в пограничных войсках.[162]

В целях обеспечения координации разведывательной и контрразведывательной деятельности органов госбезопасности, погранвойск, НКО и НКВМФ 29 мая 1941 г. при НКГБ СССР был создан Центральный совет по координированию оперативной и следственной работы органов НКГБ, 3-го отдела НКВД и 3-х Управлений НКО и НКВМФ.

В условиях сложной предвоенной обстановки совершенствовалась специальная подготовка оперативного состава. С августа 1939 г. была введена обязательная оперативно-чекистская учеба всех оперативных работников органов госбезопасности, организована подготовка оперативных работников со знанием немецкого и английского языков, принято решение о зачислении в кадры органов госбезопасности и о специальной подготовке оперативных работников из поляков, румын и чехов, о подготовке шифровальщиков на военное время. Предпринимались и другие меры обеспечения органов государственной безопасности кадрами на случай возникновения войны.

Опасность военного нападения на СССР со стороны Германии и Японии диктовала необходимость укрепления органов государственной безопасности в целом и их основных оперативных управлений в отдельности. На XVIII съезде ВКП (б) отмечалось, что необходимо «не забывать о капиталистическом окружении, помнить, что иностранная разведка будет засылать в нашу страну шпионов, убийц, вредителей, помнить об этом и укреплять нашу социалистическую разведку».[163]

К моменту реорганизации (февраль 1941 г.) Наркомат внутренних дел СССР представлял громоздкий, трудно управляемый орган, в котором были сосредоточены функции обеспечения общественного порядка и государственной безопасности страны, в том числе Красной Армии и Военно-морского флота. Штаты центрального аппарата НКВД СССР и его органов на местах были непомерно раздуты. Оправданной мерой можно считать лишь укрепление кадрами органов Главного управления государственной безопасности, которые были призваны вести активную борьбу со шпионской и иной подрывной деятельностью разведок иностранных государств и зарубежных антисоветских центров.

При реорганизации органов НКВД СССР в феврале 1941 г., на наш взгляд, не были в достаточной степени учтены особенности организации контрразведывательной работы в военное время на таких важных объектах, как железнодорожный транспорт и оборонная промышленность. Ликвидация Главного экономического управления (ГЭУ) и Главного транспортного управления (ГТУ) была неоправданной, так как основные усилия разведки фашистской Германии накануне и в годы войны были направлены против Вооруженных Сил СССР, оборонных объектов и железнодорожного транспорта.[164]

С началом войны эти обстоятельства были учтены. При реорганизации органов государственной безопасности и внутренних дел приняты меры к усилению контрразведывательной работы на объектах промышленности и транспорта. В июле — августе 1941 г. в системе НКВД СССР были вновь образованы Экономическое и Транспортное управления.[165]

С целью улучшения разведывательной, диверсионной и контрразведывательной работы в тылу немецко-фашистских войск в январе 1942 г. в составе НКВД СССР было образовано 4-е управление.

В ходе реорганизации НКВД, естественно, встал вопрос о ведомственной принадлежности органов военной контрразведки. В тот период, видимо, не было уверенности, что оставление особых отделов в системе НКВД или передача их новому Наркомату государственной безопасности положительно отразится на их деятельности. Особые отделы были переданы в ведение НКО СССР и НКВМФ СССР.

Кроме того, передача в 1943 г. органов военной контрразведки в подчинение Наркоматов обороны и Военно-морского флота, по всей вероятности, диктовалась также изменением военно-политической обстановки, необходимостью совместных действий армии и военной контрразведки на освобожденной от противника советской территории и в тылу врага.

Вопрос о ведомственном подчинении органов военной контрразведки, по мнению автора, должен решаться однозначно: как в мирное, так и в военное время особые отделы должны входить в состав органов государственной безопасности. Нужно отметить, что советская военная контрразведка изначально являлась составной частью органов государственной безопасности с момента их образования. Особый отдел ВЧК был организован 19 декабря 1918 г. путем слияния армейских чрезвычайных комиссий и органов военного контроля Реввоенсовета. И хотя в последующем, вплоть до 1931 г., Реввоенсовет имел право давать Особому отделу задания и контролировать их выполнение[166], последний продолжал быть самостоятельным отделом в системе ОГПУ. Центральный Комитет партии и советское правительство уделяли большое внимание деятельности Особого отдела, укрепляли его партийными и военными кадрами.[167]