В ходе этой реорганизации постановлением ЦК ВКП(б) и СНК СССР от 8 февраля 1941 г. особые отделы передавались из НКВД в ведение Наркомата обороны и Наркомата Военно-морского флота. Взамен ликвидируемого Особого отдела ГУГБ НКВД были образованы 3-е управления НКО и НКВМФ, подчинявшиеся непосредственно народным комиссарам обороны и Военно-морского флота.[155]

На органы внутренних дел возлагалась: охрана общественной (социалистической) собственности, охрана личной и имущественной безопасности граждан и охрана общественного порядка; охрана государственных границ СССР; организация местной и противовоздушной обороны; содержание в тюрьмах, исправительно-трудовых лагерях, исправительно-трудовых колониях, трудовых и специальных поселках осужденных и организация их трудового использования и перевоспитания; борьба с детской беспризорностью и безнадзорностью; прием, конвоирование, охрана, содержание и трудовое использование военнопленных и интернированных; оперативно-чекистское обслуживание войск НКВД; государственный надзор за противопожарной охраной и руководство противопожарными мероприятиями; учет военнообязанных; строительство, ремонт и содержание дорог союзного значения; учет, охрана, научная и оперативная разработка государственных архивных фондов СССР; запись актов гражданского состояния.[156]

В Наркомате внутренних дел был организован 3-й отдел НКВД с функциями чекистского обслуживания пограничных и внутренних войск НКВД СССР.

Реорганизация Наркомата внутренних дел продолжалась: 26 февраля 1941 года создаются Главное управление по промышленному строительству (Главпромстрой) и Главное управление лагерей горно-металлургической промышленности (ГУЛГМП), а также Управление лагерей лесной промышленности (УЛЛП), 27 марта — Главное управление аэродромного строительства (ГУАС).

По решению ЦК ВКП(б) и СНК СССР стали проводиться мероприятия по созданию противовоздушной обороны страны, на НКВД были возложены новые дополнительные функции: подготовка и защита населения городов и населенных пунктов от воздушного нападения противника. Для их выполнения было создано Главное управление противовоздушной обороны (ГУ МПВО) НКВД со своими структурами на местах.

В организационной структуре войск НКВД произошли очередные изменения: объединяются между собой главные управления войск НКВД по охране железнодорожных сооружений и по охране особо важных предприятий промышленности, а Главное управление конвойных войск преобразовывается в Управление конвойных войск. Кроме того, с 1 марта 1941 года начало функционировать Управление оперативных войск НКВД, которому передаются из ГУ ПВ части оперативных войск, а также подчиняются отдельная мотострелковая дивизия особого назначения и военно-учебные заведения.

В системе военно-учебных заведений НКВД СССР увеличилось число военных училищ, расширяется их профиль и численность обучаемых. Наряду с основным учебным заведением — Высшей школой НКВД — функционируют военные училища и курсы по подготовке офицерского состава войск НКВД. Харьковское военное училище готовило офицеров для кавалерийских и автотранспортных подразделений, а также авиации войск НКВД[157]. Харьковское военно-фельдшерское училище готовило для войск НКВД лекарских помощников и ветеринарных фельдшеров. Орджоникидзевское военное училище осуществляло подготовку офицеров для пограничных войск, Саратовское военное училище — офицеров пехоты для всех видов войск НКВД. Кроме того, действовали Ново-Петергофское военно-политическое училище, Московское военно-техническое училище НКВД, Школа физической подготовки войск НКВД. В апреле 1940 года создано Ленинградское военное училище войск НКВД.

По характеру выполняемых задач войска НКВД по состоянию на первую половину 1941 г. подразделялись на следующие виды:

внутренние войска (дивизии, в том числе стрелковые, мотострелковые и кавалерийские; отдельные стрелковые бригады);

оперативные войска были выделены из состава пограничных войск на основании приказа НКВД СССР от 28 февраля 1941 г. № 00234, для руководства которыми было сформировано Управление оперативных войск. Всего было передано: мотострелковых полков — 13, кавалерийских полков — 4, стрелковых полков — 1, отдельных стрелковых батальонов — 4, отдельных стрелковых рот — 1, отдельная мотострелковая дивизия особого назначения численностью 6725 чел.

Общая численность переданных оперативных войск составляла 27 840 чел. К началу Великой Отечественной войны оперативные войска НКВД включали: Отдельную мотострелковую дивизию особого назначения (ОМСДОН) имени Ф.Э. Дзержинского, три мотострелковые дивизии, семь отдельных полков (три мотострелковых, три кавалерийских и один стрелковый), три отдельных стрелковых батальона и одну отдельную роту. С началом военных действий были сформированы еще шесть полков. Кроме того, в состав оперативных войск входили Высшая школа НКВД и девять военных училищ.[158]

К началу войны в состав войск НКВД вошли:

пограничные войска (дивизия, отдельные пограничные полки, пограничные отряды, отдельные пограничные комендатуры, авиабригада, отдельные авиаэскадрильи, отдельные дивизионы сторожевых кораблей, отдельные батальоны связи и другие вспомогательные части). Численность пограничных войск после передачи оперативных войск составляла 161 625 человек, из которых 3020 человек в пограничной авиации;

войска НКВД по охране особо важных промышленных предприятий (промышленные войска НКВД): стрелковые дивизии и отдельные бригады;

войска НКВД по охране (железнодорожные войска): стрелковые дивизии и отдельные бригады;

конвойные войска НКВД: конвойные дивизии, отдельные конвойные бригады и отдельные конвойные полки;

войска правительственной связи НКВД (бригады, отдельные полки, отдельные батальоны и отдельные роты правительственной связи;

военно-строительные части НКВД (строительный корпус из 4 дивизий, строительные дивизии и отдельные строительные полки);

войска местной противовоздушной обороны (МПВО) НКВД (отдельные полки МПВО).

Внутренние войска НКВД организационно распределялись по округам внутренних войск со своими управлениями и другими вспомогательными и штабными службами. В 1941 г. накануне Великой Отечественной войны было 13 округов внутренних войск: Архангельский, Белорусский, Киргизский, Куйбышевский, Ленинградский, Московский, Новосибирский, Прибалтийский, Свердловский, Северо-Кавказский, Узбекский, Украинский, Хабаровский.[159]