Теперь Шуйский сидел в польской осаде. На помощь к нему пришел отряд Ляпунова, большую часть этого войска составляли казаки. Но в Москве они начали чинить непотребства, скверно ругались, насиловали женщин, то есть довели недовольство управлением Шуйского до предела. Недовольство довершила скоропостижная смерть молодого полководца Скопина-Шуйского, славе которого царь сильно завидовал (по народной версии, Василий Иванович отравил его на пиру). И начались военные неудачи. Посланное Василием войско было разгромлено поляками у Клушина. А 17 июля 1610 года казаки Ляпунова, умело направляемые боярами, свергли царя Василия с престола, обвинив в пролитии христианской крови, постригли в монахи, а к осени выдали полякам. В Москве победила пропольская группировка, желавшая получить в цари королевича Владислава. Сигизмунд с возведением сына на русский престол тянул, ссылался на его малолетство и предлагал в качестве царя себя, но москвичи присягнули Владиславу. 20 сентября польское войско вошло в Москву.

Самозванца, который вдруг объявил себя патриотом и решился пойти на Москву, разбили и убили, но у Марины к тому времени родился сын Иван, и его-то восставшие провозгласили новым царем! Марина с сыном находилась в Калуге, а потом в Коломне у атамана Заруцкого.

Не только Лжедмитрий Второй, но многие в Московском царстве были недовольны избранием в цари польского королевича, когда сам король с войском – уже в Москве, и восставшие снова стали сплачиваться. Теперь они уже назывались ополченцами. Девизом их стало изгнание поляков из Московского царства и всенародное избрание отечественного православного монарха. Первое ополчение собрали Ляпунов, князь Трубецкой и атаман Заруцкий. Заруцкому было что предложить: царица Марина с младенцем Иваном. Одни в стане этого ополчения хотели присягнуть законному государю Ивану Дмитриевичу, другие называли его пренебрежительно «ворёнком», третьи хотели избрать нового царя, хотя против поляков выступали все. Однако раздоры в ополчении скоро привели и к жертвам: Ляпунов был убит на казачьем круге, а его люди покинули ополчение. Но ополченцы все же решились идти на Москву.

Там царил ужас: столица помнила еще бесчинства казаков, как бы они теперь себя ни называли. Но скоро там были согласны уж и на казаков: 17 марта 1611 года польский гарнизон, увидев, что драка ожидается нешуточная, решил, что в городе начался мятеж, и стал избивать горожан прямо на рыночной площади. Убитых было много. Отношение к полякам резко ухудшилось. Но ополченцы Москву не взяли.

Второе ополчение – 1612 года – стало собираться на Волге, в Нижнем Новгороде, купцом Мининым, который отозвался на призыв патриарха Гермогена. Вести людей на Москву уговорили князя Пожарского. Ополчение тоже было политически разнородным: одни хотели иметь «природного русского царя», другие предлагали шведского королевича Карла-Филиппа, третьи – «Маринкиного сына», но все, как и в первом ополчении, были против поляков. Этим освободителям повезло больше: они взбунтовали всех недовольных поляками и Москву взяли – сначала Китай-город, а затем и Кремль, где сидел польский гарнизон и отсиживались московские бояре, боявшиеся, что их в случае сдачи посекут первыми. Бояр не тронули, поляков – посекли. А в январе 1613 года был созван Земский собор, на котором избрали в цари шестнадцатилетнего Михаила Романова.

На этом, однако, бунты и мятежи не прекратились: атаман Заруцкий ушел на юг и увез с собой Марину с сыном. Кандидатуру этого малолетнего Ивана он всячески продвигал на трон, но на Соборе потерпел поражение. Марина находилась с ним не то как пленница, не то как наложница, а атаман воевал по всему Поволжью, покуда в 1614 году его не загнали на самую окраину – в Астрахань, а оттуда – на реку Яик (ныне Урал). Здесь все они были схвачены и под надежной охраной отвезены в Москву. Атамана посадили на кол, а Ивана зимней ночью в одной рубашонке вывели к городским воротам и там повесили. Марина выплакала в темнице все глаза и умерла от горя.

В 1615 году Москву пробовал захватить атаман Баловень, который, впрочем, требовал не изменений в государстве, а выплаты обещанных казакам денег, но его быстро утихомирили. В том же году на Москву ходил пан Лисовский, дошел до Орла, и войско Пожарского в боях с ним только чудом не было разгромлено. Лисовский обошел Москву, разграбил попутно городки севернее столицы и вернулся в Польшу. Причина похода Лисовского была проста: поляки ссылались на то, что вся Русская земля уже присягнула королевичу Владиславу, и потому выбор Земского собора при хотя и не вступившем в должность, но уже существующем царе нелегитимен. Владислав надеялся получить «свою страну» и «свою столицу» если не добровольно, так принудительно. Но – не удалось.

В 1618 году последнюю попытку взять Москву сделал гетман Сагайдачный. В его войске были и поляки, и казаки. Тревог он вселил немало, но был отбит. В конце концов с Польшей был заключен мир. Правда, для удовлетворения польских претензий пришлось отдать Смоленск, крепость Белую, Дорогобуж, Рославль, Городище Монастыревское (Муромск), Чернигов, Стародуб, Попову Гору, Новгород Северский, Почеп, Трубчевск, Серпейск, Невель, Себеж, Красный и Велижскую волость.

Большие проблемы возникли и в северных, новгородских землях. Новгородцы не признали решений Земского собора 1613 года и добровольно передались под власть шведского короля. За два года до этого они заключили со шведским королем соглашение, что готовы признать над собой власть одного из королевичей, по общему мнению это был принц Карл-Филипп. Кроме того, они заверили шведов, что хотят видеть и на московском престоле шведского принца. Соглашение предусматривало, что Новгород войдет в состав королевства как особая территория, а Швеция станет федерацией. И все могло получиться, но шведский король не решился сразу же, как приехали послы от ополчения, отправить на Земский собор шведского королевича, и на московский престол был избран Михаил Романов. В такой ситуации Карл-Филипп наотрез отказался принимать власть над Новгородом. Но Густав Второй Адольф решил, что Новгорода ему мало, и неплохо бы получить обещанный трон. От новгородцев потребовали принести ему присягу. Но тут отказали новгородцы: они требовали Карла-Филиппа, и притом с условием, что тот перейдет в православие. Принц сидел в Выборге и ожидал решения. Но стороны так ничего и не решили. Шведам это надоело, и они вернулись в Стокгольм.