В 1911 вместе с В.М. Волиным и В.И. Федоровым-Забрежневым Карелин основал в Париже группу «Вольных социалистов», выпустив 2 номера ее печатного органа – журнала «Молот». «Проект соглашения» «Вольных социалистов», авторство которого, по всей видимости, принадлежит Аполлону Карелину, был выдержан в духе анархо-коммунистических идей, хотя в то же время автор дистанцировался от принадлежности к какой-либо политической платформе, подчеркивая межпартийный характер организации. Кроме того, он сотрудничал в анархо-синдикалистской газете «Голос труда».

В своих работах 1911–1916 гг. («К вопросу о коммунизме», «Что такое анархия?», «Положительные и отрицательные стороны демократии с точки зрения анархистов-коммунистов» и др.) Карелин популяризировал идеи Кропоткина и др. анархо-коммунистических теоретиков. Впрочем, его труды отличает ряд самобытных идей. В первую очередь это касается представлений Карелина об анархистской организации, несущих отпечаток бланкизма. Начало революции, полагал он, должны были положить всеобщая стачка и вооруженное восстание, инициированные небольшими законспирированными группами – «братствами», объединенными во «Всероссийское народное братство». Анархо-коммунистический характер программы преобразований и децентрализованную структуру «братств» Карелин предлагал совмещать с открытостью для вступления представителей политических партий, но при условии согласия с правилами и отказа от политических дискуссий в рамках общей организации. В более поздних работах он уже указывал на недопустимость сотрудничества анархистов с социал-демократами и эсерами, как с партиями, стремящимися к власти. Допускалось лишь совместное участие в восстании против существующего правительства. Целью деятельности «братств» должны были стать агитация и пропаганда среди рабочих, крестьян и солдат с целью подготовки вооруженного восстания. Эту идею положительно оценил Кропоткин, указывавший при этом на опасность установления централистических диктаторских порядков в подобных организациях.

Распространять свое влияние анархисты, по Карелину, должны были через крестьянские и рабочие профсоюзы. При этом его представления о профсоюзной организации менялись. Так, в статьях 1911–1914 гг. («Положительные стороны новых рабочих организаций», «Заметка об индустриализме»), пропагандируя опыт деятельности ВКТ и американского профсоюзного центра «Индустриальные рабочие мира» (США), Карелин выступал за сохранение неидеологического характера профсоюзов при выдвижении лозунга ликвидации капитализма и наемного труда. Вызванная условиями классовой борьбы и эксплуатации близость наемных рабочих социалистическому мировоззрению, полагал он, в процессе социальной революции приведет большинство рабочего класса в ряды анархистов.

Для трудов Карелина характерна оценка интеллигенции как класса, враждебного рабочим. Ее классовую идеологию («господский социализм») выражают социал-демократические партии, стремящиеся к установлению «нового государственного капитализма». Социалисты-интеллигенты стремятся увлечь рабочий класс в парламентскую борьбу: «Нельзя доказать […] что сторонники парламентского, господского социализма – друзья рабочего класса. […] Они преследуют интересы собственного класса, класса интеллигентов, интересы которого менее резко, чем интересы буржуазии, но все же расходятся с интересами рабочих».

В 1911–1915 гг. Карелин становится одним из наиболее авторитетных теоретиков анархического движения по аграрному вопросу. Еще в 1909 г. он опубликовал в «Буревестнике» статью с критикой методов пропагандистской работы анархистов среди крестьян. В своих работах Аполлон Карелин уделял внимание критике помещичьего землевладения в России, стремясь доказать преступный характер его формирования в результате становления крепостничества и предшествовавшего ему захвата земель крестьянских общин феодальной знатью при поддержке государства. Указывая на низкое качество используемой в помещичьем хозяйстве техники, преобладание в нем отработочной формы аренды, низкий уровень оплаты труда сельскохозяйственных рабочих, он утверждал, что крупная земельная собственность наносит вред развитию сельского хозяйства. Отсюда Карелин делал вывод о том, что ликвидация помещичьего землевладения в России необходима для прогрессивного развития аграрного сектора экономики.

Решению аграрного вопроса посвящена работа Карелина «Земельная программа анархистов-коммунистов». Указывая на распространение «отартельных» форм организации труда в общинах, он делал вывод о близости анархо-коммунистических идеалов нуждам крестьянства. Карелин выступал за передачу всей имеющейся земли «в общее достояние, которое нельзя смешивать ни с государственной, ни с общественной собственностью», при равном праве пользования для тех, кто работает на ней. Установлению коммунистических отношений должно предшествовать «переходное время» «коммунизации», которая «очень сильно уравняет доходы отдельных лиц» при сохранении разницы «в благосостоянии отдельных хозяйств». В этот период сохранятся денежные отношения в торговле при доминировании индивидуального и общинного крестьянского хозяйства на селе. К уравнению материального положения крестьян должны были привести такие меры, как: равномерное распределение всей земли между отдельными селениями и работниками на правах личного труда пользователя, первостепенное наделение землей безземельных и малоземельных работников, добровольные переселения в многоземельные местности, конфискация инвентаря помещичьих хозяйств и наделение им крестьян. «Отартельные» формы хозяйства, традиции общинной взаимопомощи в сочетании с необходимостью совместного сбыта продукции и содержания сельскохозяйственной техники приведут крестьян к осознанию необходимости объединения на добровольных началах в артельные хозяйства, а постепенно – в крупные сельскохозяйственные коммуны и кооперативные союзы, способные поднять доходность аграрного сектора экономики и повысить благосостояние крестьян. Эту программу Карелин распространял только на земли, населенные русскими: «не наше дело заботиться о делах ныне порабощенных Россией иностранцев. Никто нас не просит об этом. Они будут свободны, и сами устроятся, как пожелают».

В то же время некоторые деятели анархистского движения высказывали несколько иное видение перспектив решения аграрного вопроса. Так, Иуда Гроссман, также признавая общинные традиции важным фактором анархо-коммунистических преобразований, считал необходимым уделить внимание наименее состоятельной части слоя индивидуальных сельских хозяев, образовавшегося в ходе столыпинской аграрной реформы. Исходя из свершившегося факта выхода значительной части крестьян из общины, он предлагал анархистам признать и защищать индивидуальное хозяйство, основанное на личном труде крестьянина. Со временем, полагал Гроссман, эти хозяева, оказавшись под экономическим давлением помещика, скупщиков и сельской буржуазии («кулачества»), интегрируются в общину или будут охвачены кооперацией.

Другой темой работ Карелина были правовые проблемы теории анархизма. В духе идей Кропоткина и ряда юристов-теоретиков (Р. Штаммлера, А. Менгера) он делал выводы о насилии как основном источнике современного права, выражающего интересы «сильнейших групп общества, которые […] всегда ставили законами преграду самодеятельности слабых групп населения». Анархо-коммунистический строй, неотъемлемым свойством которого является равенство, ликвидирует главный повод к преступлениям – чувство зависти. Развитие в обществе этических отношений на основе солидарности создаст психологические предпосылки к изживанию преступности. На смену принудительному праву придет договорное (в его основе лежит «вольное соглашение», которое можно расторгнуть в любой момент) и обычное право. Органы власти будут заменены общими собраниями – «сходами союзов или кварталов или даже объединенными сходами многих союзов и многих кварталов», а также избранными для выполнения поручений «уполномоченными». Место судебных и карательных органов займет «народный самосуд» и «самосуд народного веча». Система наказаний будет заменена общественным порицанием и выделением провинившегося из коммуны в отдельную хозяйственную единицу.