Со второй половины 1944 года свою активную деятельность на восстановленной западной границе начали вести части десяти восстановленных пограничных округов. Этот период характерен для них активной борьбой с бандформированиями и националистическими организациями. В результате проведенных первых операций только с 10 августа по 1 сентября 1944 года было убито 2177 бандитов, задержано и арестовано 2913 бандитов, изъято 1184 единицы различного оружия, в том числе 98 пулеметов, два миномета и 280 тысяч патронов, обнаружено 28 складов с боеприпасами и продовольствием. Более обстоятельно о боевой деятельности пограничников на восстановленной западной границе будет сказано ниже.

Учитывая важность надежной охраны государственной границы, руководящие органы страны все годы войны, несмотря на весьма ограниченные возможности, постоянно принимают меры по усилению боевого состава пограничных округов, причем это касалось всех основных участков и направлений. В 1941 году НКВД сформировал 17 учебных полков, принявших призывников 1922 года рождения в количестве 25 000 человек, из них шесть полков готовили погранвойска. Два из этих полков были переформированы в 21-й и 26-й стрелковые полки, которые приняли участие в обороне Кавказа в составе внутренних войск НКВД. Три учебных полка, расположенных в Средней Азии, были обращены на укомплектование частей Туркменского, Среднеазиатского и Казахского погранокругов, которые выделили взамен полученного пополнения 2700 пограничников на укомплектование отдельной стрелковой дивизии особого назначения (ОСДОН) в г. Москве. Туда же влился личный состав учебного полка в г. Новосибирске.

В связи с активизацией деятельности иностранных разведок на закавказском участке границы в составе Грузинского погранокруга был сформирован 21-й пограничный резервный полк численностью 1500 человек. В это же время численность 165 береговых застав Приморского и Хабаровского погранокругов была доведена до 16 человек, на речных участках этих же округов введено в строй 62 катера.

Серьезное усиление боевого состава погранвойск на границе имело место в 1942 году. Грузинский погранокруг был усилен 40, 44 и 45-м пограничными полками, переброшенными из Москвы и Средней Азии. В составе 36-го и 37-го пограничных отрядов, входящих в состав Грузинского погранокруга, были сформированы маневренные группы численностью 250 человек каждая с дислокацией их в приморских городах Сочи, Сухуми, Гудауты и Поти с расчетом их действий против вражеской агентуры с моря. Все береговые посты Сухумского и Батумского погранотрядов переформировывались в пограничные заставы численностью в 31 человек. Дополнительно были сформированы три неотдельных комендатуры. Значительно усиливаются органы разведки в звене комендатура — отряд. Общее усиление Грузинского и Армянского погранокругов составило 6318 человек. Они получают и огневое подкрепление. В округа перебрасывается 102 противотанковых ружья и 312 минометов РМ-50.

В 1941–1942 годах отмечается усиление действий иностранных разведок со стороны Ирана. Для противодействия их намерениям усиливаются войска Туркменского и Азербайджанского погранокругов. В г. Баку формируется 1-й запасной пограничный полк в 2000 человек, позже он переформировывается в 126-й пограничный полк и принимает участие в обороне Кавказа. В г. Ашхабаде формируется 42-й пограничный полк численностью в 1643 человека, взамен убывшего в Грузинский погранокруг 44-го погранполка. Из Забайкалья в г. Мары Туркменской ССР передислоцируется 47-й пограничный полк. Пограничные отряды Азербайджанского и Туркменского погранокругов пополняются подразделениями связи. Общее усиление этих округов составило 1171 человек.

Резко обостряется обстановка на афганском участке границы, где активно действует нацистская разведка, а также подчиненные и взаимодействующие с ней разведорганы других иностранных государств. Проходя службу в те годы на Памире, автор имел возможность лично убедиться в этом. Отмечались неоднократные попытки захвата сопредельной стороной советских островов на реках Пяндж, Памир и Аму-Дарья. Для усиления численности погранвойск в г. Сталинабаде формируется 43-й пограничный полк, взамен убывшего в Грузинский округ 45-го погранполка. 48-й погранотряд, 15-й и 26-й отдельные погранкомендатуры укомплектовываются до полного штата, в них увеличивается число пограничных застав. В состав 66-го Памирского погранотряда в г. Хороге вводится дополнительно одна комендатура, три линейных заставы и увеличена численность двух линейных застав.

По-прежнему в предбоевых условиях несли службу пограничники Забайкалья, Дальнего Востока и Приморья. Как это ни было трудно, исходя из острой здесь обстановки, правительство изыскивает возможность усилить погранвойска Дальнего Востока. В Забайкальском округе были сформированы 4 резервных заставы и увеличена численность 36 линейных застав. Общее увеличение войск округа составило 810 человек. В Хабаровском округе было сформировано 6 линейных и 4 резервных заставы и увеличена численность 33 линейных застав. Увеличение личного состава по округу составило 1106 человек. В Приморском округе были сформированы 3 линейных и 2 резервных заставы и увеличена численность 36 линейных застав. В связи с активизацией немецко-японской разведки на Камчатке 60-й погранотряд получает увеличение численности 27 линейных застав до 31 человека. Учитывая, что участились случаи нарушения границы самолетами США на Командорских островах, на острове Медный выставляется пограничная застава, которая, кстати сказать, функционирует и в последнее время. Общая численность Приморского округа возрастает на 1570 человек. В целях усиления разведывательной работы в пограничных комендатурах всех трех дальневосточных округов были введены в штат разведывательные отделения. Округа получили и огневое усиление. На вооружение поступило 569 противотанковых ружей и 567 минометов РМ-50.

В интересах усиления охраны Государственной границы СССР проводятся структурные изменения войск в 1943 году и в начале 1944 года. Для охраны побережья Черного моря в г. Новороссийске выставляется 32-й погранотряд, переформированный из 32-го погранполка. Он принял под охрану участок по побережью Азовского и Черного морей от Долженко до реки Лоо. Усиливается и сухопутный участок. Пришибский погранотряд выставляет дополнительно два разведывательных поста и одну линейную погранзаставу и увеличивает здесь численность состава на 250 человек. В Туркменском погранокруге выставляется еще одна комендатура, 9 линейных застав и увеличивается штат 14 застав. Общий рост численности составил 580 человек. Усиление Азербайджанского и Туркменского погранокругов было произведено за счет 129-го резервного погранполка, который возвратился в г. Баку, выполнив боевую задачу по обороне Кавказа.

В это время, как уже упоминалось, происходят структурные изменения на советско-афганском участке границы. С целью приближения управления округа к границе на базе управления Среднеазиатского погранокруга в Сталинабаде и Фрунзе, соответственно, формируются управления Таджикского и Киргизского погранокругов. Первый — в составе Термезского, Кировобадского и Памирского погранотрядов, Шурабадской, Калейхумбской и Мургабской отдельных погранкомендатур, второй — в составе Алтай-Гульчинской, Нарынской и Пржевальской отдельных пограничных комендатур и 190-го отдельного кавдивизиона. В составе Таджикского погранокруга были сформированы шесть разведывательных постов, 22 заставы и увеличена численность 88 линейных застав. Штатная численность Таджикского округа была увеличена на 1496 человек.