У Констанцы и в устье Дуная установлены минные заграждения, известные только немцам. С советской стороны было начато минирование с использованием подводных лодок. Южнее Одессы Л-4 (Поляков) и Л-5 (Жданов) тоже выставили мины.

Мины наносили потери обеим сторонам: румынский транспорт Regele Carol I, советская подлодка С-34, эсминец «Быстрый», который попал на мину под Севастополем. В течение трех дней приходилось тралить вход в порт.

В течение первых 6 месяцев в Черном море советские подлодки провели 101 рейд против противника и потопили транспорты и танкеры общим тоннажем 15 696 брт. В Черном море положение в конце 1941 года было, пожалуй, удовлетворительным, однако, к сожалению, на суше ход войны приобретал трагический поворот. Ленинград и Москва, правда, не были взяты. Однако Одесса к 15 октября была окружена; 18 октября немецкий авангард достиг Азовского моря и Феодосии на Черном море. 8 ноября была взята Ялта, 16-го – Керчь. Вице-адмирал Левченко, которому была поручена оборона Крыма, был отозван и командовал теперь базой в Кронштадте. Армия Манштейна остановилась перед Крымом; с приходом русской зимы до мая 1942 года фронт оставался стабильным.

1 июня 1942 года началась битва за Севастополь. Фон Манштейн доставил тяжелую артиллерию, 600-мм орудие Dora и 800-мм гаубицу Thor. Люфтваффе вели бомбардировку кораблей в порту, минировали подходы. Надводные корабли теперь не могли свободно проходить их. Отсутствие зенитной артиллерии у русских и превосходство немцев в воздухе позволили немецкой авиации потопить крейсер и два эсминца. Остальные корабли ушли в кавказские порты1. 30 советских подлодок было выделено для эвакуации раненых из большого черноморского порта и доставки продовольствия, мин, боеприпасов и снаряжения: Л-4, Л-5, Л-23, С-31, С-32, М-32, М-33, М-60, М-111, М-112… Они провели 78 рейсов и доставили 4000 тонн грузов.

Разрушенные тяжелой артиллерией форты Севастополя пали после упорных сражений: 19 июня первые немецкие солдаты вошли в Северную бухту.

2 июля Красная армия окончательно оставила территорию Севастополя. 7000 русским солдатам удалось спастись в Крыму, но многие были взяты в плен. Щ-209 эвакуировала Военный совет и штаб армии. Советские подводные лодки уходили из Севастополя под градом бомбардировок, погружались и всплывали лишь у Туапсе, Поти и Батума. Произведенный в контр-адмиралы Болтунов сразу взялся за их ремонт. В августе 20 подлодок из 34 были исправными, сформирована одна бригада из 4 дивизионов, и Соловьев был назначен начальником штаба.

Уже в конце июля Болтунов послал несколько лодок к Одессе и под Севастополь, там об интенсивных перевозках сообщали разведчики, которые высадились на морском берегу и работали вместе с партизанами. На суше положение продолжало ухудшаться. 6 ноября пал Новороссийск; 11 октября был осажден Туапсе, 6 подводных лодок, а также 3 плавучих завода, которые там находились, снялись с якоря и ушли на юг с курсом на Поти и Батум. С войсками, нагруженные материалом суда шли так близко к крымскому побережью, что советские подводные лодки не могли к ним подойти.

1 сентября грузовое судно Salzburg (1745 брт), несмотря на охрану, было торпедировано М-118 (Савин); к сожалению, оно транспортировало 2300 русских пленных, из которых только 200 спаслись. 10-го румынское грузовое судно «Карпаты» (4336 брт) было потоплено Щ-216 (Карбовский).

Несколько подводных лодок 2-го дивизиона, М-32 (Култипин), М-35 (Грешилов), который тогда сменила Щ-207 (Панов), действовали под Сулином в одном из устий Дуная и достигли некоторых успехов: 19 октября М-35 потопила панамский танкер Progres (511 брт), но Советы потеряли М-33, которая взорвалась на мине.

Боевая позиция 1-го дивизиона находилась в районе пролива Босфор; германские подлодки U-4 и U-5 установили вдоль румынского побережья перед Одессой и Севастополем 176 мин.

Время на проведение самих операций уменьшалось из-за удаления исходных баз (600 морских миль от Поти до румынского берега) и огромной продолжительности пути. Тем не менее бригада в последнюю четверть 1942 года провела 42 рейда с 38 атаками. Она добилась лишь небольших успехов, если принять во внимание, что с самого начала боевых действий корабли противника в Черном море имели общий тоннаж 640 000 брт, который удалось уменьшить лишь на 12 026 брт, то есть на 2 процента от общего тоннажа. 3 советские подводные лодки было потоплено, 6 – повреждено.

В январе 1943 года в Поти под командованием капитана 1– го ранга Крестовского осталось 29 советских подводных лодок, сведенных в 3 дивизиона: 1-й (типы Д, Л и С), 2– й («Щуки»), 3-й (типы A и M) и 2 новые «Малютки» М-112 и М-117.

Адмирал Октябрьский их использовал против немцев, чьи коммуникации, как ему было известно, были нарушены. Вследствие победоносного наступления Красной армии на Сталинград фон Клейст повернул подразделения с Терека в направлении Ростова и Кубани; положение начало меняться. В июне 1943-го Октябрьский решил изменить тактику «единственной торпеды» в пользу «ловли» и «неподвижной подводной лодки» в пользу патрулирования. Уже 20 апреля лодкой С 33 (Алексеев) был достигнут первый успех. Румынское грузовое судно Suceava тоннажем 6875 брт, вероятно, самый большой транспорт на Черном море, было поражено 2 торпедами с интервалом в 5 секунд. Судно перевозило в качестве груза бензин и взлетело на воздух, причем немецкий командир конвоя тоже погиб. Алексеев получил звание Героя Советского Союза, а подлодка стала гвардейской.

Утром 8 июля М-111 (капитан-лейтенант Иоселиани) появилась перед Феодосией, портом снабжения для Керчи и Кубани. Рейд был прерван инцидентом: М-111 охотилась на большое судно, когда вышел из строя электродвигатель. «Придется застопорить ход, – думал Иоселиани, – мы не можем идти дальше». Он приказал двум морякам, чтобы они надели водолазное снаряжение, спустились и снаружи лодки определили, что произошло. Подводники вернулись через несколько часов. Антенна, кронштейн которой был разбит при бомбардировке глубинными бомбами, намоталась на винт и блокировала его. Когда винт вновь стал свободен, М-111 продолжила рейд дальше. В ночной атаке 17 июля лодка пустила торпеду по немецкому танкеру Adelheid (506 брт), которая тем не менее прошла под килем небольшого судна. Из-за этого промаха подводной лодке пришлось уходить от преследования быстроходных катеров до рассвета. М-111 снова всплыла ранним утром, обнаружила пустое море и ушла обратно в Поти.

6 августа Щ-216 (Карбовский), патрулировавшей пролив Босфор, удалось повредить немецкий танкер Firuz (7324 брт); Д-4 (Израйлевич) торпедировала и потопила болгарское грузовое судно Varna (2141 брт) у полуострова Крым. Советский военно-морской атташе в Стамбуле сообщил о выходе из Босфора французского грузового судна Thisbe, которое было конфисковано немцами с верфей в Марселе. 30 августа в 18 часов Михаил Васильевич Грешилов, тогдашний командир Щ-215, обнаружил на юге сопровождаемый румынскими эсминцами Thisbe. Грузовое судно и эсминец Maria шли в 500 метрах перед перископом Щ-215; в 18.35 Грешилов пустил две торпеды. Thisbe был поражен обеими. Третья торпеда прошла мимо румынского эсминца Marasesti. Дорожка от этой последней торпеды привела корабли сопровождения Thisbe к Щ-215, находящейся на 40-метровой глубине. Дело дошло до сильной бомбардировки глубинными бомбами. Грешилов приказал лечь на грунт и выждать ночь, а затем продолжил свой рейд. Грешилов – это тот советский командир, который участвовал, вероятно, в самых больших атаках и чаще всего отличался. Позже американцы удостоили его наградой ВМС США.