В Латвии местные органы НКВД-НКГБ ликвидировали 119 банд, при этом убили, захватили и легализовали 3145 бандитов. Арестовано участников национального подполья и иных антисоветских элементов 17987 человек.

В Эстонии вскрыта и ликвидирована антисоветская организация.

На территории Польши в ходе борьбы с бандами Армии Крайовой, Народовы силы збройны и УПА войсками НКВД, органами общественной безопасности Польши и польским войском в течение августа 1945 года было убито 208, ранено 42, захвачено 96 и арестовано 1298 бандитов. За это же время, за счёт проведения «разложенческой» деятельности, вышли из подполья и явились с повинной в органы местных властей 48 бандгрупп общей численностью 3465 человек. Захвачено в боях и сдано при добровольной явке много оружия, взрывчатых веществ и патронов. Несмотря на это, бандпроявления на территории Польши продолжали оставаться высокими, в результате которых за указанное время убито 118, ранено 32 и захвачено 8 человек. В их числе 52 военнослужащих Красной армии, 8 военнослужащих Войска Польского, 13 сотрудников органов общественной безопасности, 30 милиционеров и 65 активистов. Бандиты захватили оружие, 150 лошадей, 800 коров, 20 свиней, несколько вагонов сахара и около двух миллионов рублей.

Положение усугублялось ещё и тем, что в соответствии с соглашением между правительствами Украинской ССР и Польши от 9 сентября 1944 года было решено переселить в добровольном порядке из СССР в Польшу поляков и евреев, выразивших на то желание, а из Польши в обратном порядке направить украинцев, белорусов, русских, русинов и литовцев, пожелавших получить советское гражданство. На переезд в Польшу записалось почти полтора миллиона человек, а на переселение в СССР — более 350 тысяч человек. Выезд эвакуировавшихся в Польшу осуществлялся беспрепятственно с оформлением необходимых документов и предоставлением транспорта. В то же время, переезжавшим в Советский Союз чинились всевозможные препятствия: на железной дороге не предоставлялись вагоны для погрузки или паровозы к готовым составам. Банды УПА усиленно противодействовали выезду крестьян, проводили среди них провокационную работу, подрывали и разбирали железнодорожные пути, чтобы сорвать движение поездов. Офицеры и солдаты Войска Польского, вместо борьбы с бандитами и поддержания общественного порядка, грабили собравшихся к переезду, отбирали у них ценности, продовольствие и скот, а сопротивлявшихся даже убивали. Польские военнослужащие и представители местных властей агитировали украинцев не выезжать в Украинскую ССР, что в ряде случаев удавалось сделать. В целях лучшей организации и быстрейшего завершения переселения, прекращения грабежей и бесчинств, пришлось этот вопрос поставить перед главой польского правительства Б. Берутом.

Таковы лишь отдельные штрихи затянувшейся вооружённой борьбы Советской власти с националистическими силами в западных областях Украины и Белоруссии, в Прибалтийских республиках и Польше, не желавшими соглашаться с принципами советизации. Прискорбно, что война с Германией уже закончилась, а раздутый, в том числе и нацистами, пожар внутри страны все ещё продолжал полыхать, пожирая человеческие жизни [76].

Помимо этого, Советский Союз, верный принятым на себя обязательствам, 9 августа 1945 года объявил войну Японии. В это время, под предлогом скорейшего окончания войны, 6 августа американцы сбросили атомную бомбу на Хиросиму, а через три дня — на Нагасаки. Говорят, была сброшена еще и третья бомба, но она не взорвалась. Меньше чем за месяц советские войска разгромили Квантунскую армию, освободили Южный Сахалин и Курильские острова. 2 сентября 1945 года на борту американского линкора «Миссури» был подписан Акт о безоговорочной капитуляции Японии. 3 сентября 1945 года вошло в Историю как день победы над Японией и окончания Второй мировой войны, которая продлилась ровно шесть лет. За это время 18 стран, участвовавших в боевых действиях, потеряли совместно около 55 миллионов человек [78].

После завершения дел по обеспечению Потсдамской конференции первый зам наркома Круглов С.Н. получил новое ответственное поручение: приказом наркома внутренних дел от 9 августа 1945 года его назначили председателем Комиссии по пересмотру структуры и штата НКВД СССР. В состав этой комиссии вошли заместители наркома Чернышов В.В., Обручников Б.П., Аполлонов А.Н., Сафразьян Л.Б., Завенягин А.П. и начальник секретариата Мамулов С.С. Перед комиссией стояла непростая задача: сформировать применительно к условиям мирного времени ведомство, подвергавшееся значительным преобразованиям в период войны.

Следует отметить, что постоянное нервное напряжение военных лет, высокая степень ответственности за проводившиеся в Крыму и Потсдаме конференции не могли не отразиться на здоровье Сергея Никифоровича. Обычно, после снятия сильной психологической нагрузки, начинают проявляться болячки, на которые в процессе работы некогда бывает обращать внимание. Пришлось зам наркома ложиться в Кремлёвскую больницу.

21 августа 1945 года начальник санитарного отдела Хозяйственного управления НКВД Волошин представил на имя Берия Л.П. рапорт, в котором доложил, что состояние здоровья товарища Круглова улучшилось, но ему рекомендовано санаторное лечение, желательно в Кисловодске. В этом рапорте, вопреки тому, что некоторые искатели остренького могут подумать, не было ничего особенного: медицинские начальники часто представляли «наверх» сведения о своих больных, поскольку руководители страны должны были знать, в состоянии ли их подчинённые продолжать интенсивную работу или им следовало искать замену. В отношении Круглова С.Н., показавшего в военное время недюжинные и всесторонние организаторские способности, планы строились большие.

В сентябре 1945 года комиссия из заместителей наркома внутренних дел представила на утверждение Берия Л.П. несколько вариантов новой структуры Центрального аппарата НКВД СССР. В основном проекте предлагалось объединить в крупные управления все взаимосвязанные по задачам подразделения. Например, создать Общее управление, в состав которого включить Секретариаты наркомата и Особого совещания, Спецотделы шифровальный и учётно-статистический, отделы Юридический и Контрольно-инспекторский. В Секретно-оперативном управлении сосредоточить задачи борьбы с бандитизмом и агентурно-оперативного обслуживания исправительно-трудовых лагерей и спецпоселений. Центральный финансовый отдел мыслилось объединить с финансовым отделом войск НКВД. Материально-техническое обеспечение объектов НКВД в Крыму считалось целесообразным передать в Хозяйственное управление, ликвидировав за счёт этого 6‑й спецотдел. В Главном управлении лагерей сосредоточить Тюремный отдел, Отдел спецпоселений и Управление лесной промышленности. Сюда же передать «Отделение по использованию заключённых специалистов», более известное как Особое техническое бюро, которое руководило так называемыми «шарашками». Проверочно-фильтрационные лагеря, за истечением надобности в них, ликвидировать. Все строительные подразделения объединить в Главное управление промышленного строительства (Главпромстрой), а Инспекцию по котлонадзору выделить из их состава в отдельный аппарат при НКВД. Создать самостоятельное Политуправление войск НКВД, объединив в нем политорганы всех войсковых управлений. В Главное управление милиции передать функции по борьбе с детской беспризорностью и безнадзорностью, зато Отдел по борьбе с хищениями социалистической собственности сделать независимым подразделением. В проекте предлагалось освободить НКВД от ряда несвойственных ему функций. Так, Гохран (хранилище государственных ценностей) передать в Наркомфин СССР, а Главное архивное управление перевести в ведение Совнаркома СССР. Главное управление пожарной охраны предлагалось преобразовать в Главную пожарную инспекцию НКВД, а функции по пожаротушению передать в ведение Наркоматов и Исполкомов Советов. В связи сокращением задач считалось целесообразным снизить статус Главного управления местной противовоздушной обороны до Управления, зато Отдел кадров преобразовать в Управление кадров НКВД СССР [4].