Почти целый месяц враждующие армии стояли друг против друга, и никто не решался первым переправиться через Нил на глазах противника. Наконец Амори удалось перебраться на остров в излучине Дельты, расположенный немного севернее лагеря, а оттуда — на левый берег. Оказавшись там, его солдаты напали на один из отрядов Ширкуха. Полководец Нур ад-Дина, войско которого по численности уступало объединенной франко-египетской армии, отступил на юг, двигаясь вдоль Нила. Амори и Шавар последовали за ним, однако в качестве меры предосторожности оставили в Каире сильный гарнизон во главе с сыном Шавара Камилем и бароном Гуго д’Ибелином. Появление в Каире воинов Гуго, а также то, что рыцарям было разрешено заходить во дворец, привело в ужас консервативные мусульманские круги столицы.

Оказавшись неподалеку от Миньи в Среднем Египте, Ширкух приготовился переправиться через Нил, намереваясь вернуться и совершить набег на сирийскую границу. Он расположился лагерем в Ашмунейне среди руин древнего Гермополя. Именно здесь с ним и столкнулась франко-египетская армия. Войска Амори обладали численным превосходством, даже без учета оставленного в Каире гарнизона. Однако большинство армии Ширкуха составляла легкая турецкая конница, в египетской армии главным образом были пехотинцы, да и среди франков было всего несколько сотен рыцарей. Не прислушавшись к совету своих эмиров, Ширкух решил вступить в битву. Амори, со своей стороны, колебался.

Тогда святой Бернард самым неудачным образом вмешался в историю крестовых походов. Явившись королю в видении, он назвал его недостойным частицы истинного креста, которую тот носил на шее. И только если король поклянется стать лучшим христианином, он благословит эту реликвию. На следующее утро, 18 марта 1167 г., ободренный Амори повел свои войска в наступление на сирийцев. Ширкух использовал турецкую тактику. Центр его войска под командованием Саладина притворно отступил, и, когда король и его рыцари пустились в погоню, Ширкух приказал правому крылу атаковать левый фланг франко-египетского войска и быстро сломил сопротивление противника. Амори попал в окружение. То, что ему удалось в итоге спастись, король приписал заступничеству истинного креста. Однако многие из его лучших рыцарей были убиты, а другие, включая сеньора Кесарии Гуго, взяты в плен. Амори, Шавар и остатки их армии поспешно отступили в Каир, чтобы объединиться с оставшимся там гарнизоном.

Ширкух победил, однако вражеская армия по-прежнему представляла угрозу. Вместо того чтобы попытаться взять Каир, он переправился через Нил и поспешно двинулся через Фаюмский оазис на северо-запад. Спустя несколько дней он подошел к Александрии, и жители великого города, ненавидевшие Шавара, открыл Ширкуху ворота. Тем временем Амори и Шавар, добравшись до Каира, восполнили потери своей армии. Даже несмотря на понесенные утраты, франко-египетское войско все еще обладало численным преимуществом, поэтому Амори принял решение преследовать Ширкуха и взять Александрию в осаду. Кроме того, из Палестины прибыло подкрепление, а франкские корабли замкнули кольцо блокады с моря. Примерно через месяц Ширкух ощутил угрозу голода. Оставив Саладина с военным отрядом, состоявшим примерно из 1000 человек, удерживать город, одной майской ночью 1167 г. он в сопровождении большей части армии выскользнул из осажденной Александрии и, пройдя через лагерь франков, направился в Верхний Египет.

Амори пришел в ярость и рвался в погоню, однако Шавар посоветовал ему предоставить Ширкуху возможность грабить верхнеегипетские города, ибо гораздо важнее было вернуть Александрию. К концу июня Саладин оказался в настолько тяжелой ситуации, что ему пришлось молить дядю прийти к нему на помощь. Ширкух понял, что больше ничего не сможет сделать, вернулся к Александрии и послал одного из франкских пленников, Арнульфа из Турбесселя (после того как сеньор Кесарии Гуго отказался взять на себя эту миссию), в лагерь Амори с предложением мира. Он предлагал покинуть вместе с франками Египет, а Шавар, в свою очередь, должен будет дать обещание не наказывать тех своих подданных (как жителей Александрии, так и других египетских городов), которые поддержали в этой войне захватчиков.

Король, обеспокоенный состоянием дел в Палестине и Триполи, согласился с предложенными условиями. В итоге 4 августа 1167 г. армия франков во главе с ним вошла в Александрию. Саладина и его войско проводили за пределы города со всевозможными воинскими почестями, хотя местное население было готово буквально порвать их на куски, обвиняя Саладина и его солдат во всех свалившихся на город несчастьях. Однако неприятности александрийцев на этом не закончились. Как только чиновники Шавара вошли в город, начались аресты жителей Александрии, заподозренных в связи с сирийцами. Саладин пожаловался Амори, который приказал Шавару отпустить узников. Кроме того, король лично предоставил корабли, чтобы переправить раненых солдат Ширкуха по морю в Акру. К сожалению, позднее те из несчастных, которые оправились от ран, были отправлены работать на плантации сахарного тростника, пока король лично не приехал и не освободил их.

Во время переговоров Саладин завел среди франков много друзей; впоследствии даже утверждали, будто коннетабль Онфруа де Торон посвятил его в рыцари. Ширкух и Саладин покинули Египет приблизительно 10 августа и достигли Дамаска в сентябре. Амори и его армия отправились в Каир, чтобы освободить Гуго д’Ибелина от обязанностей начальника гарнизона. Шавар был вынужден подписать с франками договор, по условиям которого он обещал выплачивать Амори ежегодную дань в размере 100 000 золотых слитков, а также оставить в Каире франкских военных советников и небольшой гарнизон для охраны городских ворот. Затем Амори вернулся в Палестину, добравшись до Аскалона 20 августа.

Некоторые франкские сеньоры утверждали, что можно было заключить более выгодную сделку. Однако Амори не хотел больше подвергать свое войско опасности в Египте, не защитив франкские государства в Сирии от нападений Нур ад-Дина. Когда он воевал в Египте, Нур ад-Дин совершил набег на территорию Триполи, однако ему не удалось захватить стратегически важных крепостей. Амори сознавал необходимость реорганизации системы обороны королевства. Главной проблемой, как всегда, были людские ресурсы. Из-за многочисленных смертей и пленений число франкских семей, постоянно проживавших на территории королевства, заметно снизилось. Крестоносцев, прибывавших на Восток, таких как граф Фландрии Тьерри, можно было использовать при проведении отдельных военных кампаний.

Именно поэтому Амори настолько зависел от духовно-рыцарских орденов, которым в 1167-м и последующих годах было передано большое количество крепостей вместе с окружавшими их землями. Особенно крупные подарки ордена получили в Триполи, граф которого находился в плену и в котором осталось совсем мало знатных семей. Тартус и север страны перешли под контроль тамплиеров, а госпитальеры, вероятно уже владевшие крепостью Крак, известной благодаря им как Крак-де-Шевалье, получили Букайю. На территории королевства тамплиеры, которым уже принадлежала Газа на юге, получили Сафед на севере. Госпитальерам также досталась крепость Бельвуар, контролировавшая притоки реки Иордан к югу от Галилейского моря.

Князь Антиохии Боэмунд последовал примеру Амори. Он расширил владения тамплиеров вокруг Баграса, являвшегося частью Сирийских Врат, а госпитальеры получили обширные земельные владения на юге княжества, большинство которых в действительности принадлежало мусульманам. Если бы члены рыцарских орденов не оказались столь безответственными и жадными, они могли бы стать прекрасными защитниками франкских государств на Востоке.