Правда, армянских депутатов не было и на IV Вселенском (Халкидонском) соборе, так как в то время Армения была объята пламенем антиперсидского восстания. Армянские богословы, отступив от ромеев, разучились понимать греческий язык и различать тонкости терминов: «фисис», «усиа», «ипостасис» и т.п. Две природы Христа, провозглашенные Халкидонским собором, воспринимались ими как два лица. Напротив, проповеди монофизитов были понятны армянам и вызывали у них симпатии. В 491 г. Армянский церковный собор в Вагаршапате осудил и Нестория, и Евтихия, но отверг и Халкидонский собор как якобы утвердивший «два лица». Новый собор в Довине (527 г.) еще более углубил разделение с православием, ибо признал во Христе одну природу.

В начале VI в. власть Ирана над Арменией ослабла, и в 518 г. армяне получили самоуправление и своего местного правителя. Император Юстиниан I внимательно следил за состоянием дел в ромейской части Армении. Он наводил там порядок, пресек злоупотребления ромейских чиновников, строил храмы, монастыри. На V Вселенском соборе 553 г. Армянская Церковь, формально не представленная, мыслилась как бы в союзе с Православной Церковью.

Новое армянское восстание против персов в 571 г. под руководством Вардана II еще более усилило симпатии армян к ромеям. Восстание было подавлено персами лишь через семь лет. Но в 589 г. при императоре Маврикии сложился военный союз армян и ромеев. Во время нашествия персов в начале VII века Армения на шесть лет (611-617 гг.) была захвачена ими полностью. Персы принудили всех армян, живших ранее на землях Ромейской империи, отречься от Халкидонского собора. Но император Ираклий вскоре разгромил персов и освободил армян. В период правления монофелитствующих императоров (Ираклия и Константа II) сложилась формальная уния между армянскими монофизитами и ромейскими монофелитами. Но в 663 г. Армения была захвачена арабами и зажила опять своей отдельной церковной жизнью. В 707 г. арабский халиф послал войско в Армению и потребовал у католикоса Нерсеса отказа от «греческой веры». С этого времени армяне полностью отреклись от православия и вернулись в монофизитство. Так, в условиях периодической утраты государственной самостоятельности в Армении утвердилась особая церковная конфессиональная ориентация, позволявшая армянскому народу сохранять свой национальный менталитет и культуру.

Грузия попала в сферу политических интересов Римской империи в период завоевания Римом Понтийского царства в 60-е годы I века до н. э. Понтийский царь Митридат, разбитый римским полководцем Помпеем, бежал в Закавказье — через Колхиду в свои владения на северном берегу Черного моря. Это вызвало поход римских войск в Иберию и Колхиду, где они столкнулись с воинственными народами. Иберы во главе с царем Артагом оказали римлянам наиболее ожесточенное сопротивление, но все же были разбиты. В 36 г. до н.э. второй поход римлян в Иберию под руководством Канидия завершился завоеванием этой страны.

В течение трех первых веков по Р.Х. иберы, хотя имели своих царей, тем не менее, оставались в сфере политического влияния Римской империи. В эту эпоху грузины (иберы) неоднократно выступали в союзе с римлянами против персов и парфян, враждовали с северокавказскими горцами. В 138 г. грузинский царь Фарасман даже побывал в Риме и защищал интересы своей страны перед императором Адрианом и сенатом. Римское господство в Грузии сказалось на улучшении путей сообщения, оживлении торговли, совершенствовании административного управления страной.

По Низибинскому мирному договору 298 г. между Ираном и Римом не только западная часть Грузии (древняя Колхида), но и Восточная Грузия (Иберия) оставались под протекторатом Рима. Но в действительности эта независимость Грузии от Рима носила номинальный характер. Римская империя ослабела. В Западной Грузии (Колхиде) среди других племен самым сильным было племя лазов. В IV в. князь лазов подчинил своему влиянию остальные племена, жившие на территории Колхиды. Это объединение получило у греков и римлян название «Лазики».

Первые семена христианства в стране, по преданию, были посеяны еще апостолами Андреем Первозванным и Симеоном Кананитом, а затем христианами, бежавшими из Римской империи или сосланными на берега Черного моря. Во второй трети IV века царь Иберии Мириан принял христианство, которое стало государственной религией. Тогда Грузинская Церковь управлялась антиохийской кафедрой. Представители Грузии присутствовали на I Вселенском соборе. Во второй четверти V века в древней Иберии, которая стала называться Картлией, стало усиливаться персидское влияние. Картлийские цари превратились в вассалов Сасанидов. Попытка Сасанидов уничтожить самостоятельное устройство Картлии и сбор тяжелой дани с населения вызвали во второй половине V в. большое народное восстание во главе с царем Вахтангом I. На помощь грузинам приходили отряды армян, также поднявших восстание против персов. Вахтанг I много сделал для объединения Грузии, усмирил непокорную знать и кавказских горцев, вступил в союз с Ромейской империей. В союзе с армянами грузины предпринимали походы против Персии. Вахтанг I противостоял распространению огнепоклонства, насаждаемого персами. Он совершил также паломничество в Иерусалим и добился у Антиохийского Патриарха того, чтобы высшие иерархи Грузии выбирались только из среды грузинского духовенства. Это положило начало автокефалии Грузинской Церкви. В 491 году грузинские иерархи приняли участие в работе Вагаршапатского собора Армянской Церкви и уклонились в монофизитство, что оторвало грузин от греческого православия на 70 лет. Из древней Мцхеты столица государства была перенесена в построенный царем Тифлис.

Между тем персидское давление на Восточную Грузию усилилось. В длительной войне грузины были разбиты, а Вахтанг I погиб. В начале VI в. персы уничтожили царскую власть в Картлии. В столице страны Тифлисе воцарился персидский наместник. Но борьба с персами в Грузии продолжалась. Уже с конца V века в войну против Ирана в Западной Грузии вступила Ромейская империя. Война затянулась надолго и шла с переменным успехом. Наконец в 562 г. между императором Юстинианом и шахом Хосроем был заключен мир, по которому Лазика осталась за империей, а Картлия за Ираном. Но к концу VI века господство Ирана пало, и картлийская знать образовала самостоятельное государство. В начале VII в. Грузия вновь стала ареной сражений между Ромейской империей и Ираном. С севера последовали вторжения хазар. Страна ослабела и вскоре стала добычей арабских завоевателей.

Однако время с IV до конца VI в. явилось очень важным периодом в истории грузинской культуры, развивавшейся на почве античных традиций. Тогда были сделаны переводы ромейской церковной и исторической литературы на грузинский язык. Грузинские зодчие и иконописцы проявили значительную самостоятельность и зрелость. Выдающимся памятником того времени является собор св. Креста, построенный в Мцхете между 590 и 605 гг. Борьба за православие в Грузии шла не только против огнепоклонников-зороастийцев, но и против монофизитов. В VI в. св. Симеон Столпник послал из Антиохии в Грузию 13 миссионеров, которые разошлись по стране, строили монастыри и проповедовали православие. Тогда же в Лазике окончательно утвердилось христианство. А грузинский католикос Кирон, объявив о признании решений Халкидонского собора, порвал отношения с монофизитами и восстановил отношения с Константинополем.