В ночь на 28 ноября 1918 года партизанский отряд Коцура–Тихоненко–Ильченко ворвался в Чигирин. Коцур тогда признал власть Директории УНР, но уже к концу 1918 года разочаровался в Директории и стал во главе всех недовольных этим режимом.

В начале января следующего года Коцур силами своего Субботовского повстанческого полка в 600 штыков захватил Чигирин, разогнал администрацию Директории и объявил о создании независимой «Чигиринской советской республики». «Чигиринская республика» января–апреля 1919 года — уникальное, в определенной степени даже комичное действо революционной неразберихи. Район Чигирин–Каменка– Субботов–Яничи–Новосельцы–Ивановка и несколько окрестных хуторов стали атаманской «независимой республикой». Коцур был «диктатором», «гетманом», «монархом» своей маленькой «страны Чигиринщины» с 40 тысячами «подданных».

Свое атаманское правление Спиридон Коцур начал с классового террора, с расправы над неугодными. По его приказу были расстреляны несколько десятков местных гетманских полицейских-«вартовых», «буржуев», чиновников, арестованы 50–60 «подозрительных лиц». Любой приказ атамана немедленно исполнялся и не подлежал согласованиям и утверждениям. Совет и ревком, созданные в Чигирине, имели формальные функции, большевистские комиссары и советские работники не допускались в район или служили только декорацией в атаманской игре. Отряд Коцура совершал карательные акции против «кулацких» сел и помещичьих экономий, устраивая контрибуции и конфискации продовольствия «на нужды революции». Грабежи Коцура приобрели такой размах, что в марте 1919 года в селах Оситняжка и Цыбулево вспыхнуло восстание местных крестьян против «красных чигиринцев».

Сохранилась фотография атамана: кубанка набекрень, усы как «у Чапаева», дерзкий взгляд исподлобья и показная удаль сельского вожака... Такие лица часто можно встретить на снимках мексиканских революционеров начала XX века. Коцур проповедовал одновременно большевистские, анархистские и украинские национальные идеи, и эта «горючая смесь» овладела умами «граждан республики». В 1918–1919 годах атаман не был членом какой-либо партии, хотя по своим взглядам находился где-то между украинскими левыми эсерами и анархистами. В то время Коцур называл себя «большевиком, но не коммунистом».

В феврале 1919 года Повстанческий Чигиринский полк Коцура официально вошел в состав Красной армии Украинского советского фронта (позже — 1-й Украинской советской армии) как 1-й Чигиринский советский полк. Этот полк принимал участие в мартовских боях против Запорожского корпуса атамана Волоха. В апреле Чигиринский полк был направлен на Западный фронт (в район станции Фундуклеевка) сражаться против армии Петлюры. В мае полк неожиданно оставил позиции под Волочиском и «добежал» до родного Чигирина. Во время бегства в родные края Коцур призывал своих солдат «бить жидов и назначенцев». Чигиринский полк уничтожал уездные ЧК, продотряды, вступал в схватки с небольшими советскими гарнизонами. Полк Коцура провел реквизицию имущества евреев местечка Златополье. В Субботов атаман привез «гостинцы» — два десятка подвод с реквизированным еврейским имуществом.

Одной из причин бегства полка Коцура стали известия из родных сел. Дело в том, что 11 мая 1919 года против большевиков восстал Чигиринский гарнизон, собранный Коцуром. Разгромив ЧК, повстанцы впустили в город отряды григорьевских атаманов Овчаренко и Уварова. Но григорьевцы, захватив Чигирин, разоружили коцуровский гарнизон. 14 мая, когда Коцур уже снялся с фронта для помощи своим односельчанам, «гарнизонники» напали на григорьевцев. Часть из них чигиринцы разоружили, часть порубили саблями и топорами и утопили в реке Тясмин. Боясь мести григорьевцев, солдаты гарнизона, «напившись крови», ушли из Чигирина на соединение со своим батькой Коцуром.

Сам Спиридон Коцур на предложение атамана Григорьева присоединиться к его восстанию сначала дал утвердительный ответ, но вскоре ударил в тыл григорьевцам. Оказавшись под Чигирином, он развернул свой полк против повстанцев атамана Григорьева и Холодного Яра и в начале июня окончательно выбил григорьевцев из Субботова и Чигорина. В это время Коцур наладил политическую связь с партией боротьбистов.

Интересно, что борьба Коцура и Григорьева происходила в условиях, когда оба атамана были объявлены советской властью «вне закона». Казалось, большевикам придется силой оружия подавлять мятежных чигиринцев. Но в июне 1919 года Спиридон Коцур воссоздал «Чигиринскую советскую республику» на платформе «вольных Советов без партийной диктатуры», под красными и черными флагами, и заявил о лояльности большевистской власти. В тот момент у Красной армии не было сил выяснять отношения с Коцуром — еще одним мятежником из «медвежьего угла», находившегося вдали от железных дорог и крупных городов. Пока он сидел в тихом Чигорине, его можно было временно не замечать, хотя и объявить вне закона. Власть даже стремилась использовать Коцура, натравливая его воинство на более опасных григорьевцев и холодноярцев.

В июле 1919 года Коцур предложил командованию Красной армии новый военный союз для борьбы против белогвардейцев и «буржуазно-националистических атаманов». Он заявил, что готов возглавить «Украинскую партизанскую армию», и связывал свой союз с красными с возможностью создания «Украинской советской республики с границами и независимым правительством». Иными словами, Коцур предлагал большевикам союз крестьянской стихии и большевистской диктатуры. Атаман тогда называл свои отряды «Украинской повстанческой дивизией», или «Надцнепровским кошем» (в его составе было четыре полка «Вольных казаков» при четырех пушках и 23 пулеметах).

К слову, в «сумасшедшем» 1919-м в Советской Украине можно было находиться вне закона и в то же время воевать против «врагов революции» в союзе с Красной армией, как это делали матрос Железняков и батька Махно.

Однако руководство Красной армии не только не пошло на этот союз, но и в июле 1919 года вторично объявило Коцура изменником и врагом. Во главе своего полка атаман провел неудачные карательные акции против восставших атаманов Холодного Яра. Летом того же года атаман Коцур сражался, казалось, против всех — белых, красных, петлюровцев и таких известных украинских атаманов, как Ангел, Чучупак, Дьяченко, Гулый-Гуленко, Струк. Соседние Субботову села не признавали Коцура и относились к нему враждебно. Холодноярцы укоряли его, что он «...опозорил старую гетманскую столицу Чигирин». В то же время Коцур и его единомышленники мечтали перенести столицу независимой Украинской республики из Киева в Чигирин.

С августа, когда деникинцы стали формировать свою власть в Центральной Украине, Спиридон Коцур начал боевые действия против белогвардейских частей генералов Слащева. Большая часть партизан Коцура жила в своих хатах и представлялась белым «простыми хлебопашцами», но по приказу своего атамана они быстро забывали о мирном труде и брались за винтовки. В то время столица «Чигиринской республики» переместилась в Субботов, подальше от белой администрации.

В сентябре–декабре 1919 года Коцур создавал Чигиринский ревком, подчинив себе соседних местных атаманов — Ильченко, Хвещука и Сатану. Он собрал под свои знамена до 2,5 тысячи повстанцев и тогда же заключил военный союз с Революционно-повстанческой армией Украины батьки Махно. На «махновском фронте» он взял на себя прикрытие Вольного махновского района с северо-запада. Отряды атамана Коцура вошли в Среднеднепровский корпус армии Махно. Кроме частей Коцура в то время в составе корпуса были отряды атаманов Блакитного, Келеберды, Скирды, командиром этого корпуса, численность которого доходила до 5 тысяч человек, стал атаман Константин Блакитный. Конники Коцура в декабре 1919-го совершили налеты на Елизаветград, Знаменку, Бобринец, громя тылы белогвардейских войск. Одновременно Коцур продолжал вести борьбу против своего конкурента — атамана Чучупака за контроль над Чигиринским уездом. Против его отрядов белые бросили Дикую чеченскую конную дивизию.