Падение сёл Глиновского и Константиновского привело к тому, что с конца июля 1919 года силы черкасцев оказались осаждёнными в трёх сёлах: Черкасском, Петропавловском и Антоновском. Кроме их защитников, здесь находилось до 25 тысяч населения с имуществом и скотом. При этом Черкасское и Петропавловское имели общую систему обороны, а село Антоновское, находившееся в 12 километрах западнее их, имело уже свою, отдельную, оборонительную линию. Разрыв в обороне прикрывался разъездами и дозорами.

Таким образом, генералы Щербаков и Ярушин не только не решили задачу полного уничтожения Черкасской обороны, но и с треском провалили её. Эту задачу чуть было не решил Анненков. Ему не удалось полностью покончить с Обороной, но наполовину эту задачу он всё-таки решил, взяв ряд сёл, входивших в её систему и сократив тем самым фронт Обороны до 10–15 километров по фронту и до 8–10 — в глубину. Это позволило Анненкову опоясать Черкасское, Петропавловское и Антоновское линиями окопов и приступить к осаде повстанцев, которая усугублялась не только тем, что осаждённые испытывали недостаток в оружии, боеприпасах, продовольствии, медикаментах, но и тем, что большое скопление в этих сёлах людей обрекало оборону на голод и болезни. В первой половине августа Анненков стянул под Черкасское и Петропавловское (по советским источникам) до 20 тысяч человек (откуда он только набрал их?!) с пулемётами и артиллерией. С другой стороны, командование Северного Семиреченского фронта также принимает меры по войсковому усилению Обороны. В ночь на 28 августа из Абакумовского сюда направляются 5-й и 7-й кавалерийские полки общей численностью до тысячи человек. Несколько дней спустя на помощь Обороне направляются Токмакский отдельный отряд и Пржевальский пехотный полк общей численностью более 500 бойцов, и полк Калашникова[179], в состав которого входили два казахских эскадрона. Все эти части успешно прорвались через позиции белых и благополучно прибыли в Черкасское.

В это время внутри обороны было проведено преобразование партизанских подразделений в части Красной армии путём объединения кавалерийских эскадронов в кавалерийские полки, отрядов самообороны — в пехотные. Сил обороне эти преобразования, конечно, не прибавили, но укрепили дисциплину, подняли моральный дух обороняющихся и упростили управление. Эти мероприятия позволили черкасцам выстоять: несмотря на многочисленные атаки, белым продвинуться не удалось. В сентябре оборона начинает не только обороняться, но и наступать. Выполняя требования 3-го съезда Советов об оказании действенной помощи Черкасской обороне, командование Северного Семиреченского фронта 24 августа предприняло наступление на станицу Аксуйскую. Несмотря на то что руководил наступлением командующий войсками фронта Л.П. Емелев[180], наступление не увенчалось успехом. Сбив заставы белых и завязав бой на подступах к станице, который длился более 10 часов, части Красной армии понесли большие потери и отошли обратно в Абакумовскую. Пробиться к району Черкасской обороны не удалось. Л.П. Емелев был смертельно ранен.

2 сентября командованием обороны была предпринята попытка прорыва блокады и соединения с войсками фронта. Наступление осуществлялось одновременно с двух направлений: от Петропавловского — против 5-й дивизии Щербакова и по берегу реки Лепсы, на юг — против Анненкова. В ходе боёв черкасцам удалось потеснить белых и даже вывезти с полей скошенный ими хлеб, но развить наступление они не смогли, так как в разгар наступления изменил и перешёл на сторону белых 7-й кавалерийский полк. С этого времени внутри обороны происходят события, значительно подорвавшие её способность противостоять белым: 8 сентября на сторону противника перешёл Пржевальский отряд, а в Токмакском полку был раскрыт заговор, и полк пришлось переформировать.

В октябре 1919 года командованием Северного Семиреченского фронта был разработан план взятия Сарканда и соединения с силами Черкасской обороны. Но начатая 7 октября операция не удалась, а положение Обороны ещё более ухудшилось. Критическое положение обороняющихся заставило их вновь предпринять попытки прорыва осады и соединения с красными частями. 12 сентября они вновь атакуют белых и вновь возвращаются на исходные позиции. Кончаются неудачей и попытки белых ликвидировать Оборону войсковыми методами. Тогда изобретательный Анненков решил взорвать её изнутри.

В оперативном подчинении Анненкова вначале был один алашордынский полк. Это название часто встречается в исторической литературе, посвящённой Гражданской войне в Семиречье, и прежде было знакомо каждому, сейчас же оно требует пояснения.

Присоединение казахских жузов к России было по душе не всем казахам. Пока это было выгодно, недовольные молчали, но постепенно недовольство стало принимать острые формы и даже выливаться в восстания, которые Россия, естественно, подавляла.

Народившейся под щитом России казахской интеллигенции стало тесно в рамках Степного края, как стали называться присоединённые к ней джунгарские, кокандские и хивинские земли, на которых проживали казахи, и она стала вынашивать планы отделения от России и создания своего государства. Первый шаг к осуществлению этих планов был сделан в начале ХХ века, когда оформилось националистическое движение, которое возглавили А. Букейханов, А. Байтурсунов, Мир-Якуб Дулатов, Х. и Д. Досмухамедовы, М. Тынышпаев, М. Чокаев, Х. Габбасов и другие.

Цель отделения от России ими тщательно скрывалась, и на первом этапе провозглашалось получение автономии в составе России. В сильной России это было бы практически невозможно, поэтому националисты с радостью встретили Февральскую революцию 1917 года и призвали казахов бросить старые киргизские споры, домашние дрязги, поддержать новый строй, готовиться к Учредительному собранию и послать на него достойных делегатов.

Вся первая половина 1917 года прошла у них в съездах, на которых обсуждались различные аспекты строительства независимого казахского государства от России, в том числе вопросы о государственном управлении, об автономии киргизских областей, о народной милиции (войске), о киргизской политической партии и т.п.

2–25 августа 1917 года в г. Актюбинске проходил 2-й Тургайский киргизский съезд, на котором было решено создать самостоятельную киргизскую национальную партию, получившую название «Алаш»[181].