Огромная турецкая армия плотным кольцом охватила Биргу. Отныне весь огонь турецкой артиллерии был сосредоточен на последних рубежах обороны рыцарей.

В этот критический момент госпитальерам впервые улыбнулась удача. Воспользовавшись сумятицей во вражеском стане, в Биргу сумел пробраться прибывший на подкрепление с Сицилии отряд, насчитывавший тысячу аркебузиров и 42 рыцаря. На следующее утро звон церковных колоколов и смех стоявших на стенах рыцарей известили турок о том, что госпитальеры получили подкрепление.

С первых дней июля турки начали методичный обстрел бастионов Биргу и форта Сент-Анжело. 15 июля они предприняли массированную атаку с моря и с суши на позиции госпитальеров. Нападающие были встречены дружным огнем. Нескольким десяткам мальтийцев, сражавшимся на стороне рыцарей, удалось вплавь добраться до турецких судов, доставивших десант. Находившаяся на них охрана была перерезана мальтийцами, кричавшими: «Отомстим за форт Сент-Эльмо!»

Во второй половине июля Мустафа-паша решил изменить тактику. Тысяча отборных янычаров на десяти судах была отправлена в обход основных укреплений. Если бы им удалось высадиться с южной, слабо защищенной стороны форта Сент-Анжело, рыцари оказались бы на грани поражения. Однако именно на этот случай у подножия форта ля Валеттом была оставлена замаскированная батарея под командованием французского рыцаря де Гираля. Увидев приближающиеся суда, де Гираль не мог поверить своей удаче. Подпустив их на 200 ярдов, он произвел залп из всех орудий. Девять из десяти судов камнем пошли на дно, унося с собой не менее 800 отборных воинов султанской армии.

Очередную атаку турки решили хорошо подготовить. Со 2 по 7 августа все орудия, имевшиеся в распоряжении Мустафа-паши, непрерывно вели огонь. 7 августа турки пошли на штурм Биргу. Это был критический момент обороны острова. У многочисленных пробоин в стенах города завязались кровопролитные схватки. Несмотря на огромные потери, турки шли вперед. Однако небольшой гарнизон рыцарей, оставшийся в Мдине, воспользовавшись тем, что Мустафа-паша бросил в бой все наличные силы, совершил удачную и крайне своевременную вылазку в тыл туркам, разграбив и спалив их огромный лагерь. Когда Мустафа-паша понял, что он не только упустил победу, но и лишился большого количества продовольствия, нехватка которого все острее сказывалась на моральном состоянии турецкого войска, отчаянию его не было предела. Адмирал турецкого флота Пиали, считавший, что турецкая армия не выдержит длительной осады, принялся настаивать на возвращении в Стамбул до наступления осенних штормов.

Госпитальеры отражают атаки турок. Миниатюра XVI века.

18 августа турки предприняли еще одну попытку овладеть Биргу. Защитников города возглавил сам ля Валетт. Великий магистр не ушел с поля боя даже после того, как был ранен в ногу. Своему оруженосцу, уговаривавшему его отправиться в госпиталь, он сказал, указывая на турецкий бунчук: «Я никогда не покину моих солдат, пока эти знамена развеваются над Мальтой».

Третья неделя августа стала наиболее тяжелой для госпитальеров. Госпиталь был переполнен. Амуниция и продовольствие — на исходе.

В этот момент счастье вновь улыбнулось рыцарям. 6 сентября на северо-восточном побережье острова высадился прибывший с Сицилии 8-тысячный десант во главе с вице-королем доном Гарсиа. Несмотря на то что численное превосходство по-прежнему оставалось на стороне турок — их армия насчитывала не менее 20 тыс. воинов, — Мустафа-паша и Пиали сочли за лучшее снять осаду и вернуться в Стамбул.

8 сентября, в день праздника Рождества Богородицы, осада была снята. К ударам колоколов церкви Св. Лаврентия, бившим победный набат над руинами Биргу, присоединился праздничный перезвон всех церквей Мальты.

«Я не мог поверить, что звук колокола может быть столь приятен для человеческого уха. Три месяца кряду колокола Мальты звали нас только на бой», — писал в своих воспоминаниях участник обороны острова испанский аркебузир Бальби.

Менее трети турецкой армии удалось достичь берегов Босфора. Гнев Сулеймана Великолепного был страшен. Мустафа-паша и Пиали спасли свои головы только тем, что догадались заранее известить султана о постигшем их поражении.

Несмотря на то что кампания завершилась для турок полным провалом, она нисколько не сказалась на боеспособности Оттоманской империи и не задержала ее экспансию. Однако эта победа укрепила боевой дух ордена госпитальеров, подняла престиж, привлекла в его ряды новое пополнение, а также обеспечила поддержку среди католического мира.

Сразу же после того, как осада была снята, рыцари принялись обживать остров. Стены Витториозо — так были названы в честь великой победы, сросшиеся вместе города Биргу и Сенглеа — были полуразрушены. Новую столицу следовало построить быстро и в соответствии с требованиями военной науки. Герой Великой осады магистр ля Валетт превратился в архитектора и военного инженера.

Местом строительства новой столицы был избран полуостров Шиберрас, позволявший контролировать и Большую гавань, и находящуюся рядом гавань Мерсамшетт. У него были, конечно, свои недостатки. Берега полуострова представляли собой отвесные скалы из песчаника, удобных мест для причала на нем не было. Кроме того, на полуострове не было источников воды. Однако его доминирующее положение в Большой гавани предопределило место строительства будущей столицы Мальты.

Папа Пий IV, одобрив намерение ля Валетта, направил на Мальту знаменитого инженера Франческо Лапарелли, находившегося в то время на службе у герцога Козимо Медичи. Уже через три месяца после снятия осады, в декабре 1565 года, Лапарелли прибыл на остров. Совместно с находившимся на службе у ордена архитектором Джероламо Кассаром он разработал детальный план фортификаций будущего города. Восковая модель будущей столицы Мальты была направлена королю Филиппу II Испанскому, который после некоторых изменений одобрил ее.

Осада Мальты 1565 года. Миниатюра XVI века.

Сложнее обстояло дело с финансированием задуманного гигантского строительства. Европейские монархи не спешили подкрепить свои добрые чувства к защитникам христианства финансовой помощью, и, если бы не пожертвования рыцарей и мальтийцев, добровольно согласившихся платить на период строительства повышенные налоги, строительные работы растянулись бы на долгие годы. Камень в основание будущего города был заложен ля Валеттом 28 марта 1566 года. К этому времени, впрочем, основные контуры будущих фортификационных сооружений были намечены траншеями и глинобитными стенами. На строительстве одновременно работали до 8 тыс. сицилийцев и рабов из числа захваченных рыцарями пленных. Престарелый великий магистр ежедневно бывал на месте будущей столицы, однако завершенными ему удалось увидеть лишь небольшую часовню и несколько бастионов. 28 августа 1568 года ля Валетт скончался и был погребен в построенной им часовне. Впоследствии прах его был перенесен в алтарную часть собора Св. Иоанна.