Как бы то ни было, французская армия действительно в полном составе продолжала неспешное, но уверенное продвижение вслед за отступающим противником. Когда великий визирь оказался на безопасном расстоянии от неприятеля, турецкая кавалерия тоже ускорила отход, и вскоре французы потеряли ее из виду. По свидетельству Малюса, составившего точный хронометраж сражения, это произошло около 3 часов пополудни.

Перед заходом солнца французские войска подошли к главному турецкому лагерю у Эль-Ханки и без боя заняли его, встав там на ночлег. Солдаты отчаянно нуждались в отдыхе, ведь почти сутки они находились на ногах, не имея возможности подкреплять свои силы ничем, кроме водки, которую им раздали накануне сражения. Армия же визиря бежала в Бельбейс, бросив большую часть своих запасов воды и продовольствия. Битва при Гелиополисе закончилась.

Когда опустилась ночь, и лагерь французской армии затих, стало слышно, пишет Клебер в своем «Докладе», как в Каире грохочут пушки. После короткого отдыха главнокомандующий около полуночи приказал выступить на помощь гарнизону города генералу Лагранжу с четырьмя батальонами: двумя из 25-й полубригады, по одному от 61-й и 75-й. Остальная армия 21 марта еще затемно двинулась по дороге к Бельбейсу в погоню за войсками великого визиря, путь которых был отмечен брошенным имуществом, включая несколько орудий.

К утру французы уже находились перед Бельбейсом. Сам город и форт внутри него обороняла турецкая пехота. Левее города виднелось до тысячи человек турецкой конницы. Дивизия Рейнье развернулась по фронту. Дивизия Фриана направилась туда, где находилась вражеская кавалерия, обходя город слева. Артиллерия тем временем открыла огонь по позициям неприятеля.

Турецкая конница боя не приняла и отступила. Дивизия Фриана продолжила свое движение, вышла во фланг оборонявшим город войскам, атаковала их, выбила с занимаемых позиций и заставила отступить в форт. Штурм форта был намечен на следующий день, и ночь прошла в подготовке к нему.

Утром 22-го турки предложили сдать форт, если им позволят уйти следом за армией великого визиря со всем оружием. В последнем им было отказано, и военные действия продолжились. Но к середине дня, неся тяжелые потери от огня французской артиллерии и страдая от нехватки воды, турки предложили сдать форт и уйти, если только им разрешат взять с собой минимум оружия для самообороны от бедуинов. Это им позволили сделать, и около полудня 800 турецких солдат покинули Бельбейс, оставив там 10 орудий, включая два английских, и до 300 убитых.

При разоружении произошел неприятный инцидент: один из турок вдруг закричал, что предпочитает смерть позору и выстрелил из ружья в шефа бригады Латур-Мобура, с которого пуля сорвала эполет. Французские гренадеры немедленно расправились с покушавшимся.

После взятия Бельбейса Клебер отправил на помощь гарнизону Каира генерала Фриана с пятью батальонами (по два из 61-й и 75-й полубригад и один из 25-й), отрядом кавалерии и несколькими легкими орудиями. Пока главнокомандующий инструктировал уходящих, колонна капитулировавших в Бельбейсе турок ушла в направлении Салихии. Чуть отстав, за ними последовала дивизия Рейнье, усиленная 22-м конно-егерским и 14-м драгунским полками. Они уже скрылись из виду, когда Клебер двинулся вдогонку со штабом, бригадой Бельяра, гидами и 7-м гусарским полком. По пути его нашел еще один посланец великого визиря, передавший письмо, в котором Юсуф-паша предлагал остановить обе армии и провести переговоры в Бельбейсе.

Переночевав в деревне Сенека, Клебер выступил со своим отрядом на рассвете 23 марта. Неподалеку от деревни Кораим он услышал артиллерийскую канонаду и, приказав пехоте Бельяра ускорить шаг, поскакал вперед с гидами и 7-м гусарским полком выяснить, что происходит. Поднявшись на один из многочисленных барханов, окружавших деревню, он увидел на некотором от себя расстоянии каре дивизии Рейнье, окруженной 3-4 тыс. вражеской кавалерии. Заметив эскорт главнокомандующего, неприятельская конница тут же ринулась к нему. Гиды попытались развернуть имевшиеся у них пушки конной артиллерии, но атака противника была столь стремительна, что прислуга орудий оказалась изрублена раньше, чем успела открыть огонь. Вдобавок на французов напала толпа жителей деревни Кораим, вооруженных копьями и вилами. Противники смешались в рукопашной схватке. Клебер был ранен в руку копьем. Ситуация для него складывалась крайне опасная, и только атака 3-го и 14-го драгунских полков спасла ситуацию. Неприятель был обращен в бегство, оставив на поле боя до 300 человек убитыми и ранеными.

После боя французский главнокомандующий написал ответ на письмо Юсуф-паши, предупредив того, что идет со своими войсками на Салихию. Впрочем, до Салихии французы в тот день не добрались, встав на ночевку в 2 лье от города. Клебер предполагал, что поутру состоится генеральное сражение, и дал возможность своим войскам отдохнуть. Однако, достигнув 24 марта Салихии, французы обнаружили лишь пустой турецкий лагерь. Великий визирь с эскортом из 500 чел. бежал через пустыню в Сирию, бросив свою армию. Его войска отправились следом за ним практически без воды и припасов.

«Сразу же после нашего прибытия сюда, - пишет Клебер в “Докладе”, - генерал Леклерк получил приказ продолжить преследование до моста Сокровищ. На дороге он нашел множество умирающих, трупы лошадей и вьючных животных, брошенные вещи. По ту сторону моста он видел арабов, которые убивали и грабили отстающих. Решив, что дело в надежных руках, он вернулся в лагерь».

Оставив в Салихии дивизию Рейнье, чтобы Юсуф-паша не вздумал вернуться в Египет, Клебер послал бригаду Бельяра отбить обратно Дамьетту, а сам с 88-й полубригадой, двумя гренадерскими ротами 61-й полубригады, 7-м гусарским полком, 3-м и 14-м драгунскими полками отправился в Каир.

Армия же великого визиря прекратила свое существование: большинство из тех, кому удалось спастись от французских штыков и картечи, прикончили в пустыне голод, жажда и бедуины.

Несмотря на то что Клеберу удалось собрать для участия в генеральном сражении все находившиеся поблизости от Каира войска, на стороне противника всё равно оставался гигантский численный перевес. Поэтому в Каире французский главнокомандующий смог оставить лишь минимальное количество войск, состоявших к тому же в значительной степени из раненых, больных и выздоравливающих - тех, кто, по словам капитана 75-й полубригады Жозефа Мари Муаре, не мог полноценно сражаться в поле. В архиве Восточной армии сохранилась следующая таблица распределения находившегося в Каире личного состава по ключевым для контроля над городом пунктам.