В этом сезоне в составе «Юнайтед» также дебютировали: Александр («Алек») Лик Браун Дауни («Суиндон Таун»), Томас Моррисон («Бернли»), Герберт Берченоу и Герберт Ротуэлл («Глоссоп Норт Энд»), Артур Бидсуорт («Престон Норт Энд»), Томас Артур Аркесден («Бёрьон Юнайиед», сумма трансфера составила 150 фунтов), Александр («Алек») Белл (его купили за рекордные 700 фунтов в шотландском клубе «Эйр Паркхаус») и другие.

Наиболее заметный след в истории клуба оставил левый хавбек Алек (иногда – Сэнди) Белл. Свой первый матч за «Манчестер Юнайтед» он провел 24.01.1903 против «Глоссопа» и выступал за команду до июля 1913 года (его продали в «Блэкберн Роверс» за тысячу фунтов), сыграв 309 официальных матчей и забив 10 голов. Вскоре Белл сформировал мощное трио в центре поля вместе с Чарли Робертсом (302/23, 1904–1913) и Ричардом («Диком») Харгривзом Даквортом (254/11, 1903–1915). Имя легендарного футболиста было увековечено его бывшим одноклубником по «Юнайтед» Чарли Робертсом, который после завершения карьеры стал владельцем табачной фабрики и создал в честь знаменитого трио хавбеков «Юнайтед» марку сигарет под названием «Дакробел» (Ducrobel).

До 1907 года отыграли в коллективе нападающие Джон Педди (121/58, 1902–1907) и Томас Аркесден (79/33, 1902–1907).

Денежные вложения, финансовая стабильность, реконструкция стадиона (емкость двух трибун, над которыми была возведена крыша, увеличилась с пяти до восьми тысяч, появился подземный переход для футболистов из раздевалок на поле и пр.), приглашенные в коллектив футболисты придали команде новый импульс. Выиграв 15 матчей (при 8 ничьих и 11 поражениях), «Манчестер Юнайтед» занял в чемпионате пятое место. В розыгрыше Кубка Англии «Юнайтед», сумевший по пути одолеть «Ливерпуль» (2:1), добрался до второго основного раунда, где со счетом 1:3 проиграл «Эвертону». Лучшим бомбардиром «МЮ» стал Джек Педди, забивший 15 голов (из них 11 в чемпионате).

В октябре 1903 года секретарем-менеджером клуба стал Джеймс Эрнест Мангнэлл, прежде работавший в «Ньютон Хит» в должности третьего секретаря, а с января 1899 по сентябрь 1903 года тренировавший «Бернли». В сезоне 1903/1904 «Манчестер Юнайтед» поднялся на третье место (+20=8–6, мячи 65–33), отстав от «Арсенала» всего на одно очко. Лучшим бомбардиром «МЮ» в этом сезоне стал Томми Аркесден, забивший в 32 официальных матчах 15 голов. В чемпионате по 11 голов забили трое: Томми Аркесден, Билли Грэссем («Вест Хэм Юнайтед» и «Селтик») и Билли Гриффитс. В Кубке Англии «Юнайтед» вновь достиг только второго раунда, где был разгромлен клубом «Шеффилд Уэнсдей» со счетом 6:0.

В команде в этом сезоне, кроме Грэссема, дебютировали: вратари Генри («Гарри») Герберт Могер из «Саутемптона» (266, 1903–1912) и Джон Уильям («Вилли») Сатклифф (играл за «Болтон Уондерерс» и «Миллуолл Атлетик»; стал последним игроком, выступавшим одновременно за сборную Англии и в футбол, и в регби), шотландские защитники Томми Блэксток («Коденбит») и Роберт («Боб») Поллок Бонтрон («Данди»; 134/3, 1903–1907), хавбеки Александр («Алекс») Лик Браун Дауни (играл ранее за «Терд Ланарк», «Бристоль Сити» и «Суиндон Таун»; 191/14, 1902–1910), уроженец Манчестера Дик Дакворт (воспитанник молодежных команд «Стретфорд» и «Ньютон Хит»), Чарли Робертс из «Гримсби Таун» (сумма трансфера по различным источникам составляет от 400 до 600 фунтов; кроме мощи и скорости Робертс выделялся на поле короткими трусами, что для того времени было диковиной), Алекс Робертсон («Хайберниан»), форварды Ральф Гауди («Вулвич Арсенал»), Александр («Сэнди») Робертсон («Данди», «Мидлсбро») и другие.

В марте 1903 года в «Болтон Уондерерс» ушел Билли Морган (152/7, 1897–1903). Таким образом, состав «Манчестер Юнайтед» в этом сезоне был трансформирован почти полностью.

В сезоне 1904/1905 «Манчестер Юнайтед», набрав 53 очка (+24=5–5, мячи 81–30) вновь остался третьим, пропустив вперед «Ливерпуль» и «Болтон Уондерерс». Лучшим бомбардиром стал капитан команды Джек Педди, забивший 17 голов в 32 матчах. Дебютировали зазитник Ричард («Дик») Холден из клубв «Тонге» (117, 18905–1913), нападающие Джон («Джек») Томас Аллан из «Бишоп Окленд» (36/22, 1904–1907), Джон Гарри («Клем») Беддоу из «Бёртон Юнайтед», Гарри («Генри») Уильямс из «Бернли» и Ричард Уомбвелл из «Бристоль Сити».

Летом 1905 года попращался с коллективом два ветерана: хавбек Уолтер Картрайт и нападающий Уильям Гриффитс. Картрайт пришел в команду в 1895 году из «Кру Александра» и провел 257 матчей, забив при этом 8 голов. Гриффитс провел за коллектив 175 матчей и забил 30 голов (1899–1905).

Проблему возвращения в первый дивизион (после 12-летнего перерыва) «Манчестер Юнайтед» решил в сезоне 1905/1906, заняв в турнире второго дивизиона 2-е место. Ставший третьим «Челси» отстал на целых 9 очков. В розыгрыше Кубка Англии команда дошла до четвертого раунда, где проиграла «Арсеналу» со счетом 2:3. Лучшим бомбардиром «МЮ» стал Джек Пиккен, забивший 25 голов, из которых 20 в лиге. Из дебютантов отметим нападающих Джорджа Уолла из «Барнсли» (319/100, 1906–1919) и игрока сборной Англии Чарльза Сэгара из «Бери» (33/24, 1905–1907).

Первый сезон в элите «Юнайтед» завершил на 8-м месте (+17=9–13, мячи 53–56). В этом году за «Юнайтед» стали выступать бывшие ведущие игроки «Манчестер Сити» Герберт Ларри Берджесс, Джимми Бэннистер, Билли Мередит и Сэнди Тернбулл. О том, почему они оказались в «МЮ», было подробно рассказано в статье о «Манчестер Сити». Среди дебютантов отметим еще одного форварда – Алекса Мензиса из шотландского «Хартса».

Сезон 1907/1908 стал для «Манчестер Юнайтед» 16-м в Футбольной лиге и 25-м с момента основания клуба «Ньютон Хит Ланкашир энд Йоркшир Рейлуэй». По итогам этого сезона «Юнайтед» впервые в своей истории стал чемпионом Англии. Команда набрала 52 очка (+23=6–9, мячи 81–48), на 9 лучше, чем второй и третий призеры – «Астон Вилла» и «Манчестер Сити».

Уже в стартовых 14-и турах «Юнайтед» набрал 26 очков, уступив только «Миддлсбро». Зато в 13-и поединках манкунианцы побеждали, в том числе над действующим чемпионом – «Ньюкаслом», на его поле (6:1). Во время этой серии команда шесть раз выиграла с крупным счётом, забив в общей сложности 48 мячей. Лучшим бомбардиром сезона стал Сэнди Тернбулл, забивший 27 голов (в лиге – 25 в 30 матчах). Из дебютантов следует выделить купленного за 200 фунтов у «Барнсли» защитника Джорджа Уильяма Стейси (270/9, 1906–1915).

В составе новых чемпионов играли: Билли Мередит (37 матчей, 10 голов), Джордж Уолл (36/19), Джимми Бэннистер (36/5), Алек Белл (35/1), Дик Дакворт (35), Чарли Робертс (32/2), Сэнди Тернбулл (30/25), Гарри Могер (29), Герберт Берджесс (27), Джимми Тернбулл (26/10), Дик Холден (26), Джордж Стейси (18/1), Алекс Дауни (10), Герберт Клод Брумфилд (9; дублер Могера пришел из резервного состава «Манчестер Сити»), Джек Пиккен (8/1), Харолд Джеймс Халс (6/4, пришел из «Саутенд Юнайтед»), Александр («Алекс») Уильям Мензис (6/0), Уильям («Билл») Александр Берри (3/1), Эрнест Томсон (3), Аарон Хьюм (1), Керр Уайтсайд (1), Гарри Уильямс (1), Томми Уилсон (1), Эдвард Далтон (1), Джон Макгиллеврэй (1).

В этом сезоне был впервые розыгран Суперкубок Англии (FA Charity Shield). В матче за почетный трофей 27.04.1908 на нейтральном поле стадиона «Стэмфорд Бридж» в Лондоне встретились чемпионы Футбольной лиги 1907/1908 («МЮ») и чемпионы Южной лиги («Куинз Парк Рейнджерс»). Игра завершилась со счетом 1:1. Автором гола «Юнайтеда» стал Билли Мередит. Для выявления победителя было решено провести переигровку, которая состоялась четыре месяца спустя, 29.08.1908. На этот раз сильнее оказался «Манчестер Юнайтед», уверенно выигравший матч со счётом 4:0 благодаря «хет-трику» прибывшего из «Престон Норт Энд» транзитом через «Лейтон» шотландца Джеймса («Джимми») Маклахлена Тернбулла (78/45, 1907–1910) и голу Джорджа Уолла. Джимми Тернбулл (78/45, 1907–1910) и Сэнди Тернбулл (247/101, 1906–1915) были однофамильцами. Так «Манчестер Юнайтед» стал первым обладателем Суперкубка Англии. Этот Суперкубок Англии является единственным, который потребовал переигровки.